RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293683.9

PDE4A-201, Transcript of phosphodiesterase 4A, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4A, Length 2,583 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4A-201ENST00000293683 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PDE4A-201ENST00000293683 VGFO15240 615 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
PDE4A-201ENST00000293683 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PDE4A-201ENST00000293683 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PDE4A-201ENST00000293683 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
PDE4A-201ENST00000293683 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.92■■□□□ 1.1
PDE4A-201ENST00000293683 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PDE4A-201ENST00000293683 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PDE4A-201ENST00000293683 FYB1O15117 783 aa21.91■■□□□ 1.1
PDE4A-201ENST00000293683 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
PDE4A-201ENST00000293683 RIPK4P57078 832 aa21.91■■□□□ 1.1
PDE4A-201ENST00000293683 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
PDE4A-201ENST00000293683 MLH3Q9UHC1 1453 aa21.9■■□□□ 1.1
PDE4A-201ENST00000293683 RAPGEF3O95398 923 aa21.9■■□□□ 1.1
PDE4A-201ENST00000293683 IDI1Q13907 227 aa21.89■■□□□ 1.09
PDE4A-201ENST00000293683 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.89■■□□□ 1.09
PDE4A-201ENST00000293683 SMC5Q8IY18 1101 aa21.88■■□□□ 1.09
PDE4A-201ENST00000293683 MCM4P33991 863 aa21.88■■□□□ 1.09
PDE4A-201ENST00000293683 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa21.88■■□□□ 1.09
PDE4A-201ENST00000293683 PIK3C2BO00750 1634 aa21.87■■□□□ 1.09
PDE4A-201ENST00000293683 FBLN1P23142 703 aa21.87■■□□□ 1.09
PDE4A-201ENST00000293683 PRAM1Q96QH2 718 aa21.85■■□□□ 1.09
PDE4A-201ENST00000293683 LNPKQ9C0E8 428 aa21.85■■□□□ 1.09
PDE4A-201ENST00000293683 CD163L1Q9NR16 1453 aa21.85■■□□□ 1.09
PDE4A-201ENST00000293683 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PDE4A-201ENST00000293683 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
PDE4A-201ENST00000293683 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
PDE4A-201ENST00000293683 IL16Q14005 1332 aa21.82■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.82■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 OSCARQ8IYS5 282 aa21.82■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 PTPRMP28827 1452 aa21.82■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 PANK2Q9BZ23 570 aa21.81■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.81■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 KIF16BQ96L93 1317 aa21.8■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 NUCB1Q02818 461 aa21.8■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.8■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 HSCBQ8IWL3 235 aa21.79■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.79■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.78■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 ATAD2Q6PL18 1390 aa21.78■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.78■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 FSD2A1L4K1 749 aa21.78■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 TRAK2O60296 914 aa21.78■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 PRKAR2BP31323 418 aa21.78■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 CABP1Q9NZU7 370 aa21.78■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 CHD1LQ86WJ1 897 aa21.77■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa21.77■■□□□ 1.08
PDE4A-201ENST00000293683 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.77■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 PNPLA6Q8IY17 1366 aa21.76■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 CDK19Q9BWU1 502 aa21.76■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 HMOX1P09601 288 aa21.75■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.75■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 MED14O60244 1454 aa21.74■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 TSPYL6Q8N831 410 aa21.74■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.74■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.74■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.74■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 ZFYVE9O95405 1425 aa21.73■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa21.73■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.73■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 DDIT3P35638 169 aa21.72■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa21.72■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 FCHSD2O94868 740 aa21.72■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.71■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 POLKQ9UBT6 870 aa21.71■■□□□ 1.07
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PDE4A-201ENST00000293683 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PDE4A-201ENST00000293683 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.7■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 KIF2CQ99661 725 aa21.7■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 FOXD4L1Q9NU39 408 aa21.7■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 YEATS2Q9ULM3 1422 aa21.7■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.69■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 VAMP4O75379 141 aa21.69■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.68■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 SIRT2Q8IXJ6 389 aa21.68■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.68■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.68■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.68■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 WAPLQ7Z5K2 1190 aa21.67■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 SNX21Q969T3 373 aa21.67■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PDE4A-201ENST00000293683 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.66■■□□□ 1.06
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