RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253193.8

LRP3-201, Transcript of LDL receptor related protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP3, Length 3,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3-201ENST00000253193 ATAD2Q6PL18 1390 aa23.16■■□□□ 1.3
LRP3-201ENST00000253193 KIF1BO60333 1816 aa23.16■■□□□ 1.3
LRP3-201ENST00000253193 NSD2O96028 1365 aa23.15■■□□□ 1.3
LRP3-201ENST00000253193 ARAP3Q8WWN8 1544 aa23.15■■□□□ 1.3
LRP3-201ENST00000253193 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.14■■□□□ 1.29
LRP3-201ENST00000253193 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa23.13■■□□□ 1.29
LRP3-201ENST00000253193 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
LRP3-201ENST00000253193 FAM69CQ0P6D2 419 aa23.12■■□□□ 1.29
LRP3-201ENST00000253193 FCHSD2O94868 740 aa23.12■■□□□ 1.29
LRP3-201ENST00000253193 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.12■■□□□ 1.29
LRP3-201ENST00000253193 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
LRP3-201ENST00000253193 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
LRP3-201ENST00000253193 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.11■■□□□ 1.29
LRP3-201ENST00000253193 COG3Q96JB2 828 aa23.11■■□□□ 1.29
LRP3-201ENST00000253193 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
LRP3-201ENST00000253193 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
LRP3-201ENST00000253193 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
LRP3-201ENST00000253193 NME9Q86XW9 330 aa23.09■■□□□ 1.29
LRP3-201ENST00000253193 DCTN1Q14203 1278 aa23.08■■□□□ 1.29
LRP3-201ENST00000253193 PHACTR3Q96KR7 559 aa23.08■■□□□ 1.29
LRP3-201ENST00000253193 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
LRP3-201ENST00000253193 PLEKHF1Q96S99 279 aa23.08■■□□□ 1.29
LRP3-201ENST00000253193 CHMP5Q9NZZ3 219 aa23.08■■□□□ 1.29
LRP3-201ENST00000253193 ZRANB1Q9UGI0 708 aa23.08■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 CHD1LQ86WJ1 897 aa23.07■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 MYOM1P52179 1685 aa23.07■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 GNAI1P63096 354 aa23.07■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa23.06■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 POLKQ9UBT6 870 aa23.06■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 TSPYL6Q8N831 410 aa23.05■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 NFE2L2Q16236 605 aa23.05■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.05■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa23.04■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 ABCC11Q96J66 1382 aa23.04■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 FAM83GA6ND36 823 aa23.04■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.03■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.03■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.03■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 DEPDC5O75140 1603 aa23.03■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 ADGRB3O60242 1522 aa23.02■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.02■■□□□ 1.28
LRP3-201ENST00000253193 MCM4P33991 863 aa23.01■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 IL16Q14005 1332 aa23.01■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 NLRP1Q9C000 1473 aa23.01■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 LMOD3Q0VAK6 560 aa23.01■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 SLC4A10Q6U841 1118 aa23■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 SMC5Q8IY18 1101 aa23■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 PANK2Q9BZ23 570 aa22.99■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 TRAK2O60296 914 aa22.99■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 PLEKHG5O94827 1062 aa22.99■■□□□ 1.27
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LRP3-201ENST00000253193 MROH2AA6NES4 1674 aa22.99■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.98■■□□□ 1.27
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LRP3-201ENST00000253193 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.98■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.98■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.98■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.97■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 NUCB1Q02818 461 aa22.97■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 ABCC3O15438 1527 aa22.97■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.97■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.97■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 VAMP4O75379 141 aa22.96■■□□□ 1.27
LRP3-201ENST00000253193 GCC1Q96CN9 775 aa22.95■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.94■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 C14orf37Q86TY3 774 aa22.94■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 GBP4Q96PP9 640 aa22.94■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.94■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 ADGRB1O14514 1584 aa22.93■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.93■■□□□ 1.26
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LRP3-201ENST00000253193 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa22.93■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.92■■□□□ 1.26
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LRP3-201ENST00000253193 CCDC61Q9Y6R9 512 aa22.92■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22.92■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.91■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 MCM10Q7L590 875 aa22.91■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 IFT57Q9NWB7 429 aa22.91■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 CASC1Q6TDU7 716 aa22.91■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 MIS18AQ9NYP9 233 aa22.91■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 KRT24Q2M2I5 525 aa22.9■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 ZNF428Q96B54 188 aa22.9■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
LRP3-201ENST00000253193 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
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