RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP35.56■■■■□ 3.28
CAPNS1-201ENST00000246533 LMOD2Q6P5Q4 547 aa35.55■■■■□ 3.28
CAPNS1-201ENST00000246533 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP35.55■■■■□ 3.28
CAPNS1-201ENST00000246533 SHPRHQ149N8 1683 aa35.54■■■■□ 3.28
CAPNS1-201ENST00000246533 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
CAPNS1-201ENST00000246533 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
CAPNS1-201ENST00000246533 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP35.53■■■■□ 3.28
CAPNS1-201ENST00000246533 TNS3Q68CZ2 1445 aa35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CD163L1Q9NR16 1453 aa35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC24A1O60721 1099 aa35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-201ENST00000246533 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-201ENST00000246533 SBNO1A3KN83 1393 aa35.5■■■■□ 3.27
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR3GLQ9BT43 218 aa35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-201ENST00000246533 LRP6O75581 1613 aa35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CABLES1Q8TDN4 633 aa35.49■■■■□ 3.27
CAPNS1-201ENST00000246533 FANCIQ9NVI1 1328 aa35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-201ENST00000246533 NUTM2GQ5VZR2 741 aa35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-201ENST00000246533 USP6P35125 1406 aa35.46■■■■□ 3.27
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC7Q96M83 1385 aa35.45■■■■□ 3.27
CAPNS1-201ENST00000246533 ALS2Q96Q42 1657 aa35.44■■■■□ 3.26
CAPNS1-201ENST00000246533 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa35.44■■■■□ 3.26
CAPNS1-201ENST00000246533 AKAP12Q02952 1782 aa35.43■■■■□ 3.26
CAPNS1-201ENST00000246533 SSH2Q76I76 1423 aa35.41■■■■□ 3.26
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PP64 1363 aa35.41■■■■□ 3.26
CAPNS1-201ENST00000246533 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
CAPNS1-201ENST00000246533 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTS2O95450 1211 aa35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-201ENST00000246533 CDCA8Q53HL2 280 aa35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP35.39■■■■□ 3.26
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP4R2Q9NY27 417 aa35.38■■■■□ 3.25
CAPNS1-201ENST00000246533 MYOM1P52179 1685 aa35.38■■■■□ 3.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ABTB2Q8N961 1025 aa35.38■■■■□ 3.25
CAPNS1-201ENST00000246533 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGEF10O15013 1369 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-201ENST00000246533 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBED9Q6R2W3 1325 aa35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-201ENST00000246533 MON2Q7Z3U7 1717 aa35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-201ENST00000246533 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
CAPNS1-201ENST00000246533 TERF2IPQ9NYB0 399 aa35.34■■■■□ 3.25
CAPNS1-201ENST00000246533 ZRANB1Q9UGI0 708 aa35.33■■■■□ 3.25
CAPNS1-201ENST00000246533 KIF7Q2M1P5 1343 aa35.32■■■■□ 3.24
CAPNS1-201ENST00000246533 NRKQ7Z2Y5 1582 aa35.32■■■■□ 3.24
CAPNS1-201ENST00000246533 NINLQ9Y2I6 1382 aa35.31■■■■□ 3.24
CAPNS1-201ENST00000246533 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
CAPNS1-201ENST00000246533 PIK3C2AO00443 1686 aa35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa35.29■■■■□ 3.24
CAPNS1-201ENST00000246533 CARD14Q9BXL6 1004 aa35.28■■■■□ 3.24
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCA3Q99758 1704 aa35.28■■■■□ 3.24
CAPNS1-201ENST00000246533 NME9Q86XW9 330 aa35.28■■■■□ 3.24
CAPNS1-201ENST00000246533 C8orf37Q96NL8 207 aa35.28■■■■□ 3.24
CAPNS1-201ENST00000246533 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
CAPNS1-201ENST00000246533 NLRP6P59044 892 aa35.27■■■■□ 3.24
CAPNS1-201ENST00000246533 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa35.26■■■■□ 3.23
CAPNS1-201ENST00000246533 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.23
CAPNS1-201ENST00000246533 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-201ENST00000246533 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC21AQ8NDW8 1320 aa35.21■■■■□ 3.23
CAPNS1-201ENST00000246533 NLRP13Q86W25 1043 aa35.2■■■■□ 3.23
CAPNS1-201ENST00000246533 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
CAPNS1-201ENST00000246533 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP35.2■■■■□ 3.23
CAPNS1-201ENST00000246533 MRS2Q9HD23 443 aa35.2■■■■□ 3.22
CAPNS1-201ENST00000246533 NGLY1Q96IV0 654 aa35.19■■■■□ 3.22
CAPNS1-201ENST00000246533 USP19O94966 1318 aa35.19■■■■□ 3.22
CAPNS1-201ENST00000246533 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
CAPNS1-201ENST00000246533 PANK3Q9H999 370 aa35.18■■■■□ 3.22
CAPNS1-201ENST00000246533 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
CAPNS1-201ENST00000246533 SOX12O15370 315 aa35.17■■■■□ 3.22
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM83GA6ND36 823 aa35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-201ENST00000246533 GCP02774 474 aa35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-201ENST00000246533 AFF2P51816 1311 aa35.16■■■■□ 3.22
CAPNS1-201ENST00000246533 NSD3Q9BZ95 1437 aa35.14■■■■□ 3.22
CAPNS1-201ENST00000246533 FYB1O15117 783 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA0232Q92628 1395 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-201ENST00000246533 MSH5O43196 834 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-201ENST00000246533 CHRNA2Q15822 529 aa35.12■■■■□ 3.21
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC184Q52MB2 194 aa35.11■■■■□ 3.21
CAPNS1-201ENST00000246533 GGNBP2Q9H3C7 697 aa35.11■■■■□ 3.21
CAPNS1-201ENST00000246533 POTEAQ6S8J7 498 aa35.1■■■■□ 3.21
CAPNS1-201ENST00000246533 FBLN1P23142 703 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-201ENST00000246533 USP31Q70CQ4 1352 aa35.09■■■■□ 3.21
CAPNS1-201ENST00000246533 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM9BQ8IZU0 186 aa35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-201ENST00000246533 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-201ENST00000246533 SLIT3O75094 1523 aa35.08■■■■□ 3.21
CAPNS1-201ENST00000246533 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB7CA1YPR0 619 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-201ENST00000246533 PRDM11Q9NQV5 511 aa35.06■■■■□ 3.2
CAPNS1-201ENST00000246533 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-201ENST00000246533 OVOS2Q6IE36 1432 aa35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-201ENST00000246533 USP21Q9UK80 565 aa35.05■■■■□ 3.2
CAPNS1-201ENST00000246533 BCL9LQ86UU0 1499 aa35.04■■■■□ 3.2
CAPNS1-201ENST00000246533 ERICH6Q7L0X2 663 aa35.04■■■■□ 3.2
CAPNS1-201ENST00000246533 SLIT2O94813 1529 aa35.02■■■■□ 3.2
CAPNS1-201ENST00000246533 BTG4Q9NY30 223 aa35.01■■■■□ 3.2
CAPNS1-201ENST00000246533 PLCH1Q4KWH8 1693 aa35■■■■□ 3.19
CAPNS1-201ENST00000246533 USP54Q70EL1 1684 aa35■■■■□ 3.19
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