RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239223.3

DUSP1-201, Transcript of dual specificity phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene DUSP1, Length 2,019 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1-201ENST00000239223 SSH2Q76I76 1423 aa25.85■■□□□ 1.73
DUSP1-201ENST00000239223 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa25.85■■□□□ 1.73
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DUSP1-201ENST00000239223 C19orf44Q9H6X5 657 aa25.85■■□□□ 1.73
DUSP1-201ENST00000239223 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.83■■□□□ 1.73
DUSP1-201ENST00000239223 ORAI2Q96SN7 254 aa25.83■■□□□ 1.73
DUSP1-201ENST00000239223 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.82■■□□□ 1.72
DUSP1-201ENST00000239223 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.82■■□□□ 1.72
DUSP1-201ENST00000239223 MTHFSP49914 203 aa25.81■■□□□ 1.72
DUSP1-201ENST00000239223 C1orf167Q5SNV9 1468 aa25.79■■□□□ 1.72
DUSP1-201ENST00000239223 PIK3C2AO00443 1686 aa25.78■■□□□ 1.72
DUSP1-201ENST00000239223 MST1RQ04912 1400 aa25.77■■□□□ 1.72
DUSP1-201ENST00000239223 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa25.77■■□□□ 1.72
DUSP1-201ENST00000239223 SHPRHQ149N8 1683 aa25.77■■□□□ 1.72
DUSP1-201ENST00000239223 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
DUSP1-201ENST00000239223 ATF3P18847 181 aa25.75■■□□□ 1.71
DUSP1-201ENST00000239223 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa25.75■■□□□ 1.71
DUSP1-201ENST00000239223 OVOS2Q6IE36 1432 aa25.75■■□□□ 1.71
DUSP1-201ENST00000239223 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.75■■□□□ 1.71
DUSP1-201ENST00000239223 DCCP43146 1447 aa25.75■■□□□ 1.71
DUSP1-201ENST00000239223 COG3Q96JB2 828 aa25.74■■□□□ 1.71
DUSP1-201ENST00000239223 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.73■■□□□ 1.71
DUSP1-201ENST00000239223 MSH6P52701 1360 aa25.73■■□□□ 1.71
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DUSP1-201ENST00000239223 FOXO3O43524 673 aa25.71■■□□□ 1.71
DUSP1-201ENST00000239223 TTC21AQ8NDW8 1320 aa25.71■■□□□ 1.71
DUSP1-201ENST00000239223 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.7■■□□□ 1.7
DUSP1-201ENST00000239223 POLKQ9UBT6 870 aa25.7■■□□□ 1.7
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DUSP1-201ENST00000239223 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
DUSP1-201ENST00000239223 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
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DUSP1-201ENST00000239223 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
DUSP1-201ENST00000239223 KIF1AQ12756 1690 aa25.67■■□□□ 1.7
DUSP1-201ENST00000239223 SOX12O15370 315 aa25.67■■□□□ 1.7
DUSP1-201ENST00000239223 PSME1Q06323 249 aa25.67■■□□□ 1.7
DUSP1-201ENST00000239223 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
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DUSP1-201ENST00000239223 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.63■■□□□ 1.69
DUSP1-201ENST00000239223 NLRP6P59044 892 aa25.63■■□□□ 1.69
DUSP1-201ENST00000239223 ABTB2Q8N961 1025 aa25.63■■□□□ 1.69
DUSP1-201ENST00000239223 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
DUSP1-201ENST00000239223 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.63■■□□□ 1.69
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DUSP1-201ENST00000239223 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
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DUSP1-201ENST00000239223 PEAK1Q9H792 1746 aa25.61■■□□□ 1.69
DUSP1-201ENST00000239223 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.6■■□□□ 1.69
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DUSP1-201ENST00000239223 MAP3K19Q56UN5 1328 aa25.54■■□□□ 1.68
DUSP1-201ENST00000239223 ALS2Q96Q42 1657 aa25.54■■□□□ 1.68
DUSP1-201ENST00000239223 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
DUSP1-201ENST00000239223 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.53■■□□□ 1.68
DUSP1-201ENST00000239223 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.53■■□□□ 1.68
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DUSP1-201ENST00000239223 NFAT5O94916 1531 aa25.5■■□□□ 1.67
DUSP1-201ENST00000239223 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.5■■□□□ 1.67
DUSP1-201ENST00000239223 APAF1O14727 1248 aa25.49■■□□□ 1.67
DUSP1-201ENST00000239223 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.49■■□□□ 1.67
DUSP1-201ENST00000239223 IL13P35225 146 aa25.49■■□□□ 1.67
DUSP1-201ENST00000239223 LTN1O94822 1766 aa25.49■■□□□ 1.67
DUSP1-201ENST00000239223 NUDCQ9Y266 331 aa25.47■■□□□ 1.67
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DUSP1-201ENST00000239223 AMPHP49418 695 aa25.42■■□□□ 1.66
DUSP1-201ENST00000239223 PLEKHF1Q96S99 279 aa25.42■■□□□ 1.66
DUSP1-201ENST00000239223 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
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DUSP1-201ENST00000239223 NHSL1Q5SYE7 1610 aa25.41■■□□□ 1.66
DUSP1-201ENST00000239223 GCP02774 474 aa25.41■■□□□ 1.66
DUSP1-201ENST00000239223 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.41■■□□□ 1.66
DUSP1-201ENST00000239223 HOXC9P31274 260 aa25.4■■□□□ 1.66
DUSP1-201ENST00000239223 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.4■■□□□ 1.66
DUSP1-201ENST00000239223 RGPD1P0DJD0 1748 aa25.4■■□□□ 1.66
DUSP1-201ENST00000239223 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.39■■□□□ 1.66
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