RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040580.6

Syde1-201, Transcript of Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Syde1, Length 3,288 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1-201ENSMUST00000040580 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
Syde1-201ENSMUST00000040580 U2af1Q9D883 239 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
Syde1-201ENSMUST00000040580 Tsen2Q6P7W5 460 aa24.43■■□□□ 1.5
Syde1-201ENSMUST00000040580 GsdmaQ9EST1 446 aa24.43■■□□□ 1.5
Syde1-201ENSMUST00000040580 Iqsec2Q5DU25 1478 aa24.43■■□□□ 1.5
Syde1-201ENSMUST00000040580 Plin1Q8CGN5 517 aa24.43■■□□□ 1.5
Syde1-201ENSMUST00000040580 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
Syde1-201ENSMUST00000040580 Cabp4Q8VHC5 271 aa24.42■■□□□ 1.5
Syde1-201ENSMUST00000040580 Frmpd2A0A140LI67 1392 aa24.41■■□□□ 1.5
Syde1-201ENSMUST00000040580 Mak16Q8BGS0 296 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
Syde1-201ENSMUST00000040580 Dennd6aQ8BH65 605 aa24.39■■□□□ 1.49
Syde1-201ENSMUST00000040580 Fyb1O35601 819 aa24.38■■□□□ 1.49
Syde1-201ENSMUST00000040580 Neurod2Q62414 383 aa24.38■■□□□ 1.49
Syde1-201ENSMUST00000040580 Apaf1O88879 1249 aa24.38■■□□□ 1.49
Syde1-201ENSMUST00000040580 Tmem2Q5FWI3 1383 aa24.38■■□□□ 1.49
Syde1-201ENSMUST00000040580 Slc12a5Q91V14 1138 aa24.37■■□□□ 1.49
Syde1-201ENSMUST00000040580 Farp2Q91VS8 1065 aa24.37■■□□□ 1.49
Syde1-201ENSMUST00000040580 KdrP35918 1367 aa24.37■■□□□ 1.49
Syde1-201ENSMUST00000040580 Golga2Q921M4 999 aa24.36■■□□□ 1.49
Syde1-201ENSMUST00000040580 Nlgn1Q99K10 843 aa24.35■■□□□ 1.49
Syde1-201ENSMUST00000040580 Col18a1P39061 1774 aa24.33■■□□□ 1.49
Syde1-201ENSMUST00000040580 Zfp444Q3TDV8 331 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
Syde1-201ENSMUST00000040580 Atf7ipQ7TT18 1306 aa24.31■■□□□ 1.48
Syde1-201ENSMUST00000040580 Anks4bQ8K3X6 423 aa24.3■■□□□ 1.48
Syde1-201ENSMUST00000040580 PalmQ9Z0P4 383 aa24.3■■□□□ 1.48
Syde1-201ENSMUST00000040580 Uhrf1bp1lA2RSJ4 1457 aa24.3■■□□□ 1.48
Syde1-201ENSMUST00000040580 Wdr17E9Q271 1322 aa24.3■■□□□ 1.48
Syde1-201ENSMUST00000040580 Brinp3Q499E0 766 aa24.3■■□□□ 1.48
Syde1-201ENSMUST00000040580 Mcm10Q0VBD2 885 aa24.29■■□□□ 1.48
Syde1-201ENSMUST00000040580 Speer4f1Q9D5Q6 258 aa24.29■■□□□ 1.48
Syde1-201ENSMUST00000040580 Pik3c2aQ61194 1686 aa24.28■■□□□ 1.48
Syde1-201ENSMUST00000040580 Tmem132eQ6IEE6 982 aa24.28■■□□□ 1.48
Syde1-201ENSMUST00000040580 Astn2Q80Z10 1352 aa24.28■■□□□ 1.48
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gli3Q61602 1583 aa24.28■■□□□ 1.48
Syde1-201ENSMUST00000040580 Znf335A2A5K6 1337 aa24.28■■□□□ 1.48
Syde1-201ENSMUST00000040580 Mon2Q80TL7 1715 aa24.27■■□□□ 1.48
Syde1-201ENSMUST00000040580 Bcl11bQ99PV8 884 aa24.27■■□□□ 1.48
Syde1-201ENSMUST00000040580 Unc13bQ9Z1N9 1602 aa24.27■■□□□ 1.48
Syde1-201ENSMUST00000040580 FancaQ9JL70 1439 aa24.27■■□□□ 1.48
Syde1-201ENSMUST00000040580 Trim28Q62318 834 aa24.26■■□□□ 1.47
Syde1-201ENSMUST00000040580 MpripP97434 1024 aa24.25■■□□□ 1.47
Syde1-201ENSMUST00000040580 Kcna6Q61923 529 aa24.25■■□□□ 1.47
Syde1-201ENSMUST00000040580 Usp19Q3UJD6 1360 aa24.25■■□□□ 1.47
Syde1-201ENSMUST00000040580 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
Syde1-201ENSMUST00000040580 Kif1aP33173 1695 aa24.22■■□□□ 1.47
Syde1-201ENSMUST00000040580 Atxn3Q9CVD2 355 aa24.22■■□□□ 1.47
Syde1-201ENSMUST00000040580 TimelessQ9R1X4 1197 aa24.22■■□□□ 1.47
Syde1-201ENSMUST00000040580 Eif4a2P10630 407 aa24.21■■□□□ 1.47
Syde1-201ENSMUST00000040580 Dixdc1Q80Y83 711 aa24.21■■□□□ 1.47
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ppp1r15aP17564 657 aa24.2■■□□□ 1.47
Syde1-201ENSMUST00000040580 Rsph6aQ8CDR2 708 aa24.2■■□□□ 1.46
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ccne1Q61457 408 aa24.19■■□□□ 1.46
Syde1-201ENSMUST00000040580 Dzip1Q8BMD2 852 aa24.19■■□□□ 1.46
Syde1-201ENSMUST00000040580 Cdk12Q14AX6 1484 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
Syde1-201ENSMUST00000040580 Acsbg1Q99PU5 721 aa24.18■■□□□ 1.46
Syde1-201ENSMUST00000040580 Col16a1Q8BLX7 1580 aa24.18■■□□□ 1.46
Syde1-201ENSMUST00000040580 Uspl1Q3ULM6 1089 aa24.17■■□□□ 1.46
Syde1-201ENSMUST00000040580 Dnajc10Q9DC23 793 aa24.17■■□□□ 1.46
Syde1-201ENSMUST00000040580 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa24.16■■□□□ 1.46
Syde1-201ENSMUST00000040580 Camta1A2A891 1682 aa24.16■■□□□ 1.46
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gas2l2Q5SSG4 860 aa24.16■■□□□ 1.46
Syde1-201ENSMUST00000040580 TatQ8QZR1 454 aa24.16■■□□□ 1.46
Syde1-201ENSMUST00000040580 L3mbtl2P59178 703 aa24.15■■□□□ 1.46
Syde1-201ENSMUST00000040580 CemipQ8BI06 1361 aa24.14■■□□□ 1.46
Syde1-201ENSMUST00000040580 Hoxb7P09024 217 aa24.13■■□□□ 1.45
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ubr1O70481 1757 aa24.13■■□□□ 1.45
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ttll13A4Q9F6 804 aa24.13■■□□□ 1.45
Syde1-201ENSMUST00000040580 Smim5Q8BT42 78 aa24.13■■□□□ 1.45
Syde1-201ENSMUST00000040580 Map2P20357 1828 aa24.13■■□□□ 1.45
Syde1-201ENSMUST00000040580 Hoxc9P09633 260 aa24.11■■□□□ 1.45
Syde1-201ENSMUST00000040580 Map4k4P97820 1233 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
Syde1-201ENSMUST00000040580 Trim26Q99PN3 545 aa24.11■■□□□ 1.45
Syde1-201ENSMUST00000040580 Cabp2Q9JLK4 216 aa24.11■■□□□ 1.45
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gimap6Q8K349 305 aa24.11■■□□□ 1.45
Syde1-201ENSMUST00000040580 Parp14Q2EMV9 1817 aa24.11■■□□□ 1.45
Syde1-201ENSMUST00000040580 Dusp27Q148W8 1138 aa24.11■■□□□ 1.45
Syde1-201ENSMUST00000040580 Kif24Q6NWW5 1356 aa24.1■■□□□ 1.45
Syde1-201ENSMUST00000040580 PaskQ8CEE6 1383 aa24.1■■□□□ 1.45
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ccdc30Q8BVF4 654 aa24.1■■□□□ 1.45
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ncapd2Q8K2Z4 1392 aa24.1■■□□□ 1.45
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gimap5Q8BWF2 308 aa24.08■■□□□ 1.45
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gm21698A0A087WQP8 267 aa24.07■■□□□ 1.44
Syde1-201ENSMUST00000040580 Gm21671G3UY31 267 aa24.07■■□□□ 1.44
Syde1-201ENSMUST00000040580 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
Syde1-201ENSMUST00000040580 Eya1P97767 591 aa24.07■■□□□ 1.44
Syde1-201ENSMUST00000040580 Polr3glQ8R0C0 218 aa24.07■■□□□ 1.44
Syde1-201ENSMUST00000040580 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
Syde1-201ENSMUST00000040580 Ncoa4Q5U4H9 625 aa24.06■■□□□ 1.44
Syde1-201ENSMUST00000040580 Apbb1Q9QXJ1 710 aa24.06■■□□□ 1.44
Syde1-201ENSMUST00000040580 TnikP83510 1323 aa24.05■■□□□ 1.44
Syde1-201ENSMUST00000040580 Erbb3Q61526 1339 aa24.05■■□□□ 1.44
Syde1-201ENSMUST00000040580 Q4VA45 678 aa24.05■■□□□ 1.44
Syde1-201ENSMUST00000040580 Txnrd1Q9JMH6 613 aa24.04■■□□□ 1.44
Syde1-201ENSMUST00000040580 Amotl2Q8K371 772 aa24.02■■□□□ 1.44
Syde1-201ENSMUST00000040580 Fmnl2A2APV2 1086 aa24.02■■□□□ 1.44
Syde1-201ENSMUST00000040580 Wnk3Q80XP9 1757 aa24.02■■□□□ 1.44
Syde1-201ENSMUST00000040580 Kcnh5Q920E3 988 aa24.01■■□□□ 1.43
Syde1-201ENSMUST00000040580 Snap23O09044 210 aa24.01■■□□□ 1.43
Syde1-201ENSMUST00000040580 Hspa1lP16627 641 aa24■■□□□ 1.43
Syde1-201ENSMUST00000040580 Stk31Q99MW1 1018 aa23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.1 ms