RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000002112.14

Trappc6a-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6a, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 TimelessQ9R1X4 1197 aa24.85■■□□□ 1.57
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Bcl9lQ67FY2 1494 aa24.67■■□□□ 1.54
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Gm21671G3UY31 267 aa24.62■■□□□ 1.53
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Nlgn1Q99K10 843 aa24.55■■□□□ 1.52
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Fam184bQ0KK56 942 aa24.54■■□□□ 1.52
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Cabp4Q8VHC5 271 aa24.54■■□□□ 1.52
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa24.53■■□□□ 1.52
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Chd4Q6PDQ2 1915 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Tmf1B9EKI3 1091 aa24.52■■□□□ 1.52
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Card10P58660 1021 aa24.51■■□□□ 1.51
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Slx1bQ8BX32 270 aa24.48■■□□□ 1.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Pard3Q99NH2 1333 aa24.48■■□□□ 1.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa24.47■■□□□ 1.51
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 ClspnQ80YR7 1315 aa24.47■■□□□ 1.51
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Pank3Q8R2W9 370 aa24.46■■□□□ 1.51
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 MpndQ3TV65 487 aa24.45■■□□□ 1.5
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ano8Q6PB70 1060 aa24.45■■□□□ 1.5
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Sgsm1Q8BPQ7 1093 aa24.45■■□□□ 1.5
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Dnajc10Q9DC23 793 aa24.45■■□□□ 1.5
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 PrxO55103 1391 aa24.44■■□□□ 1.5
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Mdc1Q5PSV9 1707 aa24.44■■□□□ 1.5
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Ubr1O70481 1757 aa24.42■■□□□ 1.5
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Robo1O89026 1612 aa24.3■■□□□ 1.48
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Col22a1E9Q7P1 1613 aa24.29■■□□□ 1.48
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Plekhd1B2RPU2 505 aa24.29■■□□□ 1.48
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Pak3Q61036 559 aa24.28■■□□□ 1.48
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Tmem132eQ6IEE6 982 aa24.28■■□□□ 1.48
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Rad17Q6NXW6 688 aa24.28■■□□□ 1.48
Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Sugp2Q8CH09 1067 aa24.27■■□□□ 1.48
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Trappc6a-201ENSMUST00000002112 Tnks1bp1P58871 1720 aa24.25■■□□□ 1.47
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