RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 RALBP1Q15311 655 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 ANKRD1Q15327 319 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 FAM153CQ494X1 144 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 CTXN3Q4LDR2 81 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF484Q5JVG2 852 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TMEM63BQ5T3F8 832 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TSTD2Q5T7W7 516 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 CEP85Q6P2H3 762 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 RASAL3Q86YV0 1011 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 ESX1Q8N693 406 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 FSIP1Q8NA03 581 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 USP38Q8NB14 1042 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 PIGSQ96S52 555 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 NPAS1Q99742 590 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 PLEKHA2Q9HB19 425 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 SLC13A4Q9UKG4 626 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 PACSIN3Q9UKS6 424 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 VWA3AA6NCI4 1184 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 SAC3D1A6NKF1 404 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 H3BNC9 293 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 H7C1Q1 480 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 FYB1O15117 783 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 SEPT4O43236 478 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 EXOC3O60645 756 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 KAT7O95251 611 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 GCP02774 474 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 CSF1P09603 554 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 WT1P19544 449 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 CYP3A7P24462 503 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 NDUFS1P28331 727 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 SLC8A1P32418 973 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 PCP4P48539 62 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 AGTR2P50052 363 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 SOX10P56693 466 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 GAB1Q13480 694 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TRPC3Q13507 836 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 MFSD13AQ14CX5 517 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 DLGAP5Q15398 846 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 CNGA3Q16281 694 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 LRRC24Q50LG9 513 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM72Q6ZMU5 477 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 LDLRAD3Q86YD5 345 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 LAS2Q8IYD9 372 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 AMER2Q8N7J2 671 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 CLEC4CQ8WTT0 213 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 HTRA1Q92743 480 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 ARRDC3Q96B67 414 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 REPS1Q96D71 796 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 MPP4Q96JB8 637 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 HS6ST2Q96MM7 605 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 UROC1Q96N76 676 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TIMP4Q99727 224 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 REEP2Q9BRK0 252 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 ADGRE3Q9BY15 652 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 RMI1Q9H9A7 625 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 UBN1Q9NPG3 1134 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 SLC17A6Q9P2U8 582 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 ADAM21Q9UKJ8 722 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 PRRT4C9JH25 899 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 BTBD19C9JJ37 291 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 J3KRW8 73 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 GRM8O00222 908 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 CLIC1O00299 241 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 PRYO14603 147 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TSPAN3O60637 253 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 FZD7O75084 574 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 RHOBTB3O94955 611 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 ACP5P13686 325 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 CHN1P15882 459 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 XBP1P17861 261 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 PROZP22891 400 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 DDIT3P35638 169 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 PNPLA4P41247 253 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 STAT6P42226 847 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 LIFRP42702 1097 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-205ENST00000391970 TUBP50607 506 aa3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms