RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443528.5

ACTB-206, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-206ENST00000443528 SERPINB11Q96P15 392 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 PNKPQ96T60 521 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 BBS2Q9BXC9 721 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 C2orf42Q9NWW7 574 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 STOML2Q9UJZ1 356 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 MYO6Q9UM54 1294 aa16.38■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 A0A0A0MRY4 1105 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 LRRC53A6NM62 1247 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 GFRA2O00451 464 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 TRIM24O15164 1050 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 CACNG3O60359 315 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 HSF2BPO75031 334 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 RNF40O75150 1001 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 TULP3O75386 442 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 LATS1O95835 1130 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 SP9P0CG40 484 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 UNGP13051 313 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 FERP16591 822 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 NNTQ13423 1086 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 FBXO43Q4G163 708 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 DCAF6Q58WW2 860 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 FYB2Q5VWT5 728 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 OLIG1Q8TAK6 271 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 BHMTQ93088 406 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 SYT11Q9BT88 431 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 PLK2Q9NYY3 685 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 IFNKQ9P0W0 207 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 WDR35Q9P2L0 1181 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 TLR6Q9Y2C9 796 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 MYOFQ9NZM1 2061 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 IRAK2O43187 625 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 DAB1O75553 588 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 KAT7O95251 611 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 PENKP01210 267 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 TDGF1P13385 188 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 MMP8P22894 467 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 SCNN1AP37088 669 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 ZNF445P59923 1031 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 SATB1Q01826 763 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 KDSRQ06136 332 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 FIGNQ5HY92 759 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 NUGGCQ68CJ6 796 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 TSSK4Q6SA08 328 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 TRIM72Q6ZMU5 477 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 UNC45BQ8IWX7 931 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 SLC30A5Q8TAD4 765 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 AGPAT1Q99943 283 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 EDEM3Q9BZQ6 932 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 ARHGEF4Q9NR80 690 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 FAM86C1Q9NVL1 165 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 DEC1Q9P2X7 70 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 FBXO10Q9UK96 956 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 FBXO4Q9UKT5 387 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 ACSL4O60488 711 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 APODP05090 189 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 CISD3P0C7P0 127 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 HOXC13P31276 330 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 GRIA2P42262 883 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 CXCL12P48061 93 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 CCR3P51677 355 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 CDK17Q00537 523 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 PTP4A2Q12974 167 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 ADGRF1Q5T601 910 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 NADSYN1Q6IA69 706 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 RNF214Q8ND24 703 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 AZIN2Q96A70 460 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 PHOX2BQ99453 314 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 ADAM33Q9BZ11 813 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 AIPL1Q9NZN9 384 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 TMEM59LQ9UK28 342 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 TSPAN3O60637 253 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 CCDC172P0C7W6 258 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 SLC6A4P31645 630 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 NOS2P35228 1153 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 MATKP42679 507 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 SLC11A2P49281 568 aa16.34■□□□□ 0.21
ACTB-206ENST00000443528 SGSHP51688 502 aa16.34■□□□□ 0.21
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