RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)Q1

tS(GCU)Q1, Transcript of Mitochondrial serine tRNA (tRNA-Ser), yeastyeast

Gene tS(GCU)Q1, Length 86 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PDR5P33302 1511 aaKnown RBP-6.23□□□□□ -3.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VPS13Q07878 3144 aa-6.24□□□□□ -3.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YOL131WQ08270 108 aa-6.26□□□□□ -3.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BCK1Q01389 1478 aa-6.28□□□□□ -3.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 LTE1P07866 1435 aa-6.28□□□□□ -3.41
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YCR075W-AQ3E830 75 aa-6.33□□□□□ -3.42
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SSK2P53599 1579 aa-6.35□□□□□ -3.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ULS1Q08562 1619 aa-6.37□□□□□ -3.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YCF1P39109 1515 aaKnown RBP-6.39□□□□□ -3.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ZEO1Q08245 113 aa-6.4□□□□□ -3.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ESC1Q03661 1658 aaKnown RBP-6.4□□□□□ -3.43
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IML1P47170 1584 aa-6.41□□□□□ -3.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YOL166W-AQ8TGJ1 51 aa-6.42□□□□□ -3.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DOP1Q03921 1698 aa-6.43□□□□□ -3.44
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VMR1P38735 1592 aa-6.5□□□□□ -3.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP-6.5□□□□□ -3.45
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GCN2P15442 1659 aa-6.55□□□□□ -3.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YJL133C-AQ3E7A3 74 aa-6.58□□□□□ -3.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YFL041W-AQ3E817 63 aa-6.58□□□□□ -3.46
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 UFD4P33202 1483 aa-6.6□□□□□ -3.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YSY6P38374 65 aa-6.61□□□□□ -3.47
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPR010C-AA5Z2X5 72 aa-6.68□□□□□ -3.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NUP188P52593 1655 aaKnown RBP-6.7□□□□□ -3.48
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YBT1P32386 1661 aa-6.81□□□□□ -3.5
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CDC25P04821 1589 aa-6.91□□□□□ -3.51
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DDR2P89113 61 aa-6.93□□□□□ -3.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 STU1P38198 1513 aa-6.93□□□□□ -3.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YIL102C-AQ2V2P5 75 aa-6.96□□□□□ -3.52
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 COX9P07255 59 aa-7.01□□□□□ -3.53
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SCC2Q04002 1493 aa-7.05□□□□□ -3.54
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YHR213W-AQ8TGT4 77 aa-7.09□□□□□ -3.54
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ATG2P53855 1592 aa-7.12□□□□□ -3.55
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NUP159P40477 1460 aa-7.27□□□□□ -3.57
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BUD3P25558 1636 aa-7.29□□□□□ -3.58
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PAI3P01094 68 aa-7.29□□□□□ -3.58
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HIR3P47171 1648 aa-7.31□□□□□ -3.58
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TOM1Q03280 3268 aa-7.35□□□□□ -3.59
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MYO4P32492 1471 aa-7.4□□□□□ -3.59
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLR342W-AQ3E810 57 aa-7.4□□□□□ -3.59
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YJL127C-BQ3E828 52 aa-7.46□□□□□ -3.6
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa-7.47□□□□□ -3.61
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SKI3P17883 1432 aaKnown RBP-7.52□□□□□ -3.61
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PMP3P87284 55 aa-7.53□□□□□ -3.61
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NUP170P38181 1502 aa-7.58□□□□□ -3.62
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YKL023C-AQ2V2P3 75 aa-7.71□□□□□ -3.64
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 USO1P25386 1790 aa-7.79□□□□□ -3.66
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VMA9Q3E7B6 73 aa-7.82□□□□□ -3.66
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NUP192P47054 1683 aa-7.83□□□□□ -3.66
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PEP1P32319 1579 aa-7.84□□□□□ -3.67
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SMX2P40204 77 aaKnown RBP-7.94□□□□□ -3.68
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MON2P48563 1636 aaPredicted RBP-8□□□□□ -3.69
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HOR7Q05827 59 aa-8.04□□□□□ -3.7
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CHC1P22137 1653 aaKnown RBP-8.19□□□□□ -3.72
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RKR1Q04781 1562 aa-8.22□□□□□ -3.72
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SPT6P23615 1451 aaKnown RBP-8.32□□□□□ -3.74
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TOM7P53507 60 aa-8.36□□□□□ -3.75
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MLP2P40457 1679 aa-8.47□□□□□ -3.77
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YFR010W-AP0C5N0 62 aa-8.56□□□□□ -3.78
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 NCE101Q02820 53 aa-9.42□□□□□ -3.92
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 Q0297Q9ZZV8 51 aa-10□□□□□ -4.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPL39P04650 51 aa-10.02□□□□□ -4.01
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa-11.04□□□□□ -4.18
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa-12.58□□□□□ -4.42
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