RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A YDR034C-AP0C289 58 aa-4.28□□□□□ -3.09
YMR001C-AYMR001C-A NUM1Q00402 2748 aa-4.29□□□□□ -3.1
YMR001C-AYMR001C-A RPL29P05747 59 aaPredicted RBP-4.29□□□□□ -3.1
YMR001C-AYMR001C-A YSY6P38374 65 aa-4.31□□□□□ -3.1
YMR001C-AYMR001C-A YOR316C-AQ3E806 69 aa-4.32□□□□□ -3.1
YMR001C-AYMR001C-A RPO31P04051 1460 aa-4.32□□□□□ -3.1
YMR001C-AYMR001C-A YFL041W-AQ3E817 63 aa-4.35□□□□□ -3.11
YMR001C-AYMR001C-A DOP1Q03921 1698 aa-4.41□□□□□ -3.11
YMR001C-AYMR001C-A PDR5P33302 1511 aaKnown RBP-4.42□□□□□ -3.12
YMR001C-AYMR001C-A IRA1P18963 3092 aa-4.42□□□□□ -3.12
YMR001C-AYMR001C-A FLO1P32768 1537 aa-4.44□□□□□ -3.12
YMR001C-AYMR001C-A TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP-4.46□□□□□ -3.12
YMR001C-AYMR001C-A YHR213W-AQ8TGT4 77 aa-4.47□□□□□ -3.13
YMR001C-AYMR001C-A IRA2P19158 3079 aa-4.54□□□□□ -3.14
YMR001C-AYMR001C-A YMR105W-AQ8TGS8 64 aa-4.54□□□□□ -3.14
YMR001C-AYMR001C-A YIL102C-AQ2V2P5 75 aa-4.59□□□□□ -3.14
YMR001C-AYMR001C-A NUP159P40477 1460 aa-4.61□□□□□ -3.15
YMR001C-AYMR001C-A SCC2Q04002 1493 aa-4.66□□□□□ -3.16
YMR001C-AYMR001C-A YCF1P39109 1515 aaKnown RBP-4.7□□□□□ -3.16
YMR001C-AYMR001C-A YPR010C-AA5Z2X5 72 aa-4.7□□□□□ -3.16
YMR001C-AYMR001C-A PAI3P01094 68 aa-4.71□□□□□ -3.16
YMR001C-AYMR001C-A SSK2P53599 1579 aa-4.72□□□□□ -3.16
YMR001C-AYMR001C-A NUP188P52593 1655 aaKnown RBP-4.79□□□□□ -3.18
YMR001C-AYMR001C-A YBT1P32386 1661 aa-4.81□□□□□ -3.18
YMR001C-AYMR001C-A YHR073W-AP0C5N7 58 aa-4.86□□□□□ -3.19
YMR001C-AYMR001C-A MYO4P32492 1471 aa-4.88□□□□□ -3.19
YMR001C-AYMR001C-A YJL133C-AQ3E7A3 74 aa-4.95□□□□□ -3.2
YMR001C-AYMR001C-A GCN2P15442 1659 aa-5□□□□□ -3.21
YMR001C-AYMR001C-A STU1P38198 1513 aa-5.04□□□□□ -3.22
YMR001C-AYMR001C-A ULS1Q08562 1619 aa-5.05□□□□□ -3.22
YMR001C-AYMR001C-A VPS13Q07878 3144 aa-5.08□□□□□ -3.22
YMR001C-AYMR001C-A COX9P07255 59 aa-5.08□□□□□ -3.22
YMR001C-AYMR001C-A DDR2P89113 61 aa-5.08□□□□□ -3.22
YMR001C-AYMR001C-A SKI3P17883 1432 aaKnown RBP-5.1□□□□□ -3.23
YMR001C-AYMR001C-A ATG2P53855 1592 aa-5.1□□□□□ -3.23
YMR001C-AYMR001C-A BUD3P25558 1636 aa-5.13□□□□□ -3.23
YMR001C-AYMR001C-A CDC25P04821 1589 aa-5.15□□□□□ -3.23
YMR001C-AYMR001C-A YKL023C-AQ2V2P3 75 aa-5.22□□□□□ -3.25
YMR001C-AYMR001C-A VMA9Q3E7B6 73 aa-5.24□□□□□ -3.25
YMR001C-AYMR001C-A NUP170P38181 1502 aa-5.38□□□□□ -3.27
YMR001C-AYMR001C-A YLR342W-AQ3E810 57 aa-5.47□□□□□ -3.29
YMR001C-AYMR001C-A PEP1P32319 1579 aa-5.59□□□□□ -3.3
YMR001C-AYMR001C-A NUP192P47054 1683 aa-5.59□□□□□ -3.31
YMR001C-AYMR001C-A HIR3P47171 1648 aa-5.66□□□□□ -3.32
YMR001C-AYMR001C-A YJL127C-BQ3E828 52 aa-5.68□□□□□ -3.32
YMR001C-AYMR001C-A USO1P25386 1790 aa-5.68□□□□□ -3.32
YMR001C-AYMR001C-A YFR010W-AP0C5N0 62 aa-5.82□□□□□ -3.34
YMR001C-AYMR001C-A PMP3P87284 55 aa-5.84□□□□□ -3.34
YMR001C-AYMR001C-A SMX2P40204 77 aaKnown RBP-5.97□□□□□ -3.37
YMR001C-AYMR001C-A RKR1Q04781 1562 aa-5.97□□□□□ -3.37
YMR001C-AYMR001C-A YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa-6.03□□□□□ -3.37
YMR001C-AYMR001C-A SPT6P23615 1451 aaKnown RBP-6.08□□□□□ -3.38
YMR001C-AYMR001C-A HOR7Q05827 59 aa-6.25□□□□□ -3.41
YMR001C-AYMR001C-A MON2P48563 1636 aaPredicted RBP-6.3□□□□□ -3.42
YMR001C-AYMR001C-A CHC1P22137 1653 aaKnown RBP-6.61□□□□□ -3.47
YMR001C-AYMR001C-A TOM1Q03280 3268 aa-6.64□□□□□ -3.47
YMR001C-AYMR001C-A MLP2P40457 1679 aa-6.71□□□□□ -3.48
YMR001C-AYMR001C-A TOM7P53507 60 aa-6.91□□□□□ -3.52
YMR001C-AYMR001C-A NCE101Q02820 53 aa-7.51□□□□□ -3.61
YMR001C-AYMR001C-A RPL39P04650 51 aa-8.37□□□□□ -3.75
YMR001C-AYMR001C-A Q0297Q9ZZV8 51 aa-8.72□□□□□ -3.81
YMR001C-AYMR001C-A YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa-9.35□□□□□ -3.91
YMR001C-AYMR001C-A YDR034W-BQ6Q5X2 51 aa-11.49□□□□□ -4.25
Retrieved 63 of 5,963 RNA–protein pairs in 5.5 ms