RNA–Protein interactions for RNA: YDL117W

CYK3, Transcript of SH3-domain protein located in the bud neck and cytokinetic actin ring, yeastyeast

Gene CYK3, Length 2,658 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CYK3YDL117W YPR117WQ06116 2489 aa3.3□□□□□ -1.88
CYK3YDL117W YIL086CP40503 102 aa3.28□□□□□ -1.88
CYK3YDL117W YOR394C-AQ8TGJ0 55 aa3.27□□□□□ -1.89
CYK3YDL117W RPL43AP0CX25 92 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
CYK3YDL117W RPL43BP0CX26 92 aa3.26□□□□□ -1.89
CYK3YDL117W YJR128WP47162 119 aa3.25□□□□□ -1.89
CYK3YDL117W URA2P07259 2214 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CYK3YDL117W COX7P10174 60 aa3.24□□□□□ -1.89
CYK3YDL117W YHR007C-AQ07074 71 aa3.24□□□□□ -1.89
CYK3YDL117W YIL046W-AQ3E7Z4 54 aa3.24□□□□□ -1.89
CYK3YDL117W TAO3P40468 2376 aa3.22□□□□□ -1.89
CYK3YDL117W HOR7Q05827 59 aa3.22□□□□□ -1.89
CYK3YDL117W YJL144WP47009 104 aa3.22□□□□□ -1.89
CYK3YDL117W RPC10P40422 70 aa3.2□□□□□ -1.9
CYK3YDL117W TAR1Q8TGM6 124 aa3.2□□□□□ -1.9
CYK3YDL117W YGR146C-AQ8TGT9 53 aa3.2□□□□□ -1.9
CYK3YDL117W VPS13Q07878 3144 aa3.2□□□□□ -1.9
CYK3YDL117W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data3.19□□□□□ -1.9not detected
CYK3YDL117W YCR108CQ3E819 63 aa3.17□□□□□ -1.9
CYK3YDL117W LCL1Q02786 101 aa3.16□□□□□ -1.9
CYK3YDL117W OLI1P61829 76 aa3.16□□□□□ -1.9
CYK3YDL117W YBL044WP38194 122 aa3.14□□□□□ -1.91
CYK3YDL117W RPL37BP51402 88 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
CYK3YDL117W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
CYK3YDL117W IRA2P19158 3079 aa3.13□□□□□ -1.91
CYK3YDL117W YMR230W-AQ3E7B5 62 aa3.12□□□□□ -1.91
CYK3YDL117W TEL1P38110 2787 aa3.09□□□□□ -1.92
CYK3YDL117W NUM1Q00402 2748 aa3.07□□□□□ -1.92
CYK3YDL117W YJL009WP47078 108 aa3.05□□□□□ -1.92
CYK3YDL117W YOR316C-AQ3E806 69 aa3.05□□□□□ -1.92
CYK3YDL117W TOR1P35169 2470 aa3.04□□□□□ -1.92
CYK3YDL117W YBR016WP38216 128 aa3.03□□□□□ -1.92
CYK3YDL117W YHR073W-AP0C5N7 58 aa3.02□□□□□ -1.93
CYK3YDL117W HFA1P32874 2273 aa2.99□□□□□ -1.93
CYK3YDL117W TOR2P32600 2474 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CYK3YDL117W YBR072C-AQ3E794 53 aa2.94□□□□□ -1.94
CYK3YDL117W YLL066W-BQ8TGJ7 56 aa2.91□□□□□ -1.94
CYK3YDL117W HHY1P39982 102 aa2.89□□□□□ -1.95
CYK3YDL117W FMP27Q06179 2628 aa2.88□□□□□ -1.95
CYK3YDL117W YBR056W-AI2HB52 66 aa2.86□□□□□ -1.95
CYK3YDL117W RPL37AP49166 88 aaKnown RBP2.84□□□□□ -1.96
CYK3YDL117W GCN1P33892 2672 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
CYK3YDL117W YDR034C-AP0C289 58 aa2.83□□□□□ -1.96
CYK3YDL117W YHR212W-AP0CX91 67 aa2.83□□□□□ -1.96
CYK3YDL117W YGL260WP53056 76 aa2.82□□□□□ -1.96
CYK3YDL117W IRA1P18963 3092 aa2.81□□□□□ -1.96
CYK3YDL117W YOR072W-BQ3E832 53 aa2.79□□□□□ -1.96
CYK3YDL117W MEC1P38111 2368 aa2.79□□□□□ -1.96
CYK3YDL117W PRP8P33334 2413 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
CYK3YDL117W CSF1Q12150 2958 aa2.77□□□□□ -1.97
CYK3YDL117W TRA1P38811 3744 aa2.74□□□□□ -1.97
CYK3YDL117W DYN1P36022 4092 aa2.71□□□□□ -1.98
CYK3YDL117W YHR086W-AQ3E746 53 aa2.68□□□□□ -1.98
CYK3YDL117W UTP20P35194 2493 aaKnown RBP2.64□□□□□ -1.99
CYK3YDL117W Q0297Q9ZZV8 51 aa2.62□□□□□ -1.99
CYK3YDL117W YOL164W-AQ3E7A5 60 aa2.62□□□□□ -1.99
CYK3YDL117W MDN1Q12019 4910 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
CYK3YDL117W YML054C-AQ3E809 52 aa2.42□□□□□ -2.02
CYK3YDL117W YLR157W-EP0CF00 54 aa2.35□□□□□ -2.03
CYK3YDL117W Q0017Q9ZZX8 53 aa2.28□□□□□ -2.04
CYK3YDL117W YHR050W-AQ05451 56 aa2.14□□□□□ -2.07
CYK3YDL117W RPS29AP41057 56 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
CYK3YDL117W RPS29BP41058 56 aaKnown RBP1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 63 of 5,963 RNA–protein pairs in 270.3 ms