RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491084.5

KRTCAP2-208, Transcript of keratinocyte associated protein 2, human

TSL 3

Gene KRTCAP2, Length 598 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRTCAP2-208	ENST00000491084	GCNT4	Q9P109	453 aa		11.42	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	NXF1	Q9UBU9	619 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	RAB23	Q9ULC3	237 aa		11.42	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PATJ	Q8NI35	1801 aa		11.42	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	ATG13	O75143	517 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PDGFRB	P09619	1106 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	CNR2	P34972	360 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	IFNAR2	P48551	515 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PPP3CA	Q08209	521 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	FZD5	Q13467	585 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	MTF1	Q14872	753 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	ZACN	Q401N2	412 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	DDX42	Q86XP3	938 aa	Known RBP eCLIP	11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	STKLD1	Q8NE28	680 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	NELL1	Q92832	810 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	MRPL45	Q9BRJ2	306 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	GKN1	Q9NS71	199 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	COMMD8	Q9NX08	183 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	NCDN	Q9UBB6	729 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	USP34	Q70CQ2	3546 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		11.41	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SHISA7	A6NL88	538 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	LILRB5	O75023	590 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	ATP2C2	O75185	946 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	TADA3	O75528	432 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	GFPT2	O94808	682 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	NFATC1	O95644	943 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	TRIM49	P0CI25	452 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	TRIM49C	P0CI26	452 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SLC9A1	P19634	815 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	DRD1	P21728	446 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PIK3CA	P42336	1068 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	GCLM	P48507	274 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KLK7	P49862	253 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	CDR1	P51861	262 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	DLG4	P78352	724 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	FOXK2	Q01167	660 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	USP4	Q13107	963 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	FBXO43	Q4G163	708 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	CBWD6	Q4V339	395 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	WDR59	Q6PJI9	974 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SV2A	Q7L0J3	742 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	RRAGA	Q7L523	313 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	UNC93A	Q86WB7	457 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	ZNF516	Q92618	1163 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	FAM84A	Q96KN4	292 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	CRACR2A	Q9BSW2	395 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	EPC1	Q9H2F5	836 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SIX2	Q9NPC8	291 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	RAB20	Q9NX57	234 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	DUS2	Q9NX74	493 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		11.4	□□□□□ -0.58
KRTCAP2-208	ENST00000491084		F8VP50	259 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
KRTCAP2-208	ENST00000491084	EPHB6	O15197	1021 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KRTCAP2-208	ENST00000491084	HCRT	O43612	131 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SERPING1	P05155	500 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KRTCAP2-208	ENST00000491084	FER	P16591	822 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KRTCAP2-208	ENST00000491084	HDC	P19113	662 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SDHB	P21912	280 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KRTCAP2-208	ENST00000491084	PRKCI	P41743	596 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KRTCAP2-208	ENST00000491084	STAT1	P42224	750 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KRTCAP2-208	ENST00000491084	SOX9	P48436	509 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KRTCAP2-208	ENST00000491084	MFAP3	P55082	362 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KRTCAP2-208	ENST00000491084	JAM2	P57087	298 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KRTCAP2-208	ENST00000491084	KRT83	P78385	493 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KRTCAP2-208	ENST00000491084	GCNT1	Q02742	428 aa		11.39	□□□□□ -0.59
KRTCAP2-208	ENST00000491084	CCIN	Q13939	588 aa		11.39	□□□□□ -0.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82 ms