RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP32.29■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 KIAA1958Q8N8K9 716 aa32.29■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 TFAP2BQ92481 460 aa32.29■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP32.29■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 CYLDQ9NQC7 956 aa32.29■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 NAGPAQ9UK23 515 aa32.29■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 TULP2O00295 520 aa32.28■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP32.28■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 MBD3O95983 291 aa32.28■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 IRF1P10914 325 aa32.28■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 NR1H3Q13133 447 aa32.28■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 MAN2A1Q16706 1144 aa32.28■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 DGKKQ5KSL6 1271 aa32.28■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 TRIM65Q6PJ69 517 aa32.28■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 UBA3Q8TBC4 463 aa32.28■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 IER2Q9BTL4 223 aa32.28■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa32.28■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 TBX18O95935 607 aa32.27■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 SP9P0CG40 484 aa32.27■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 RARGP13631 454 aa32.27■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 KRT5P13647 590 aa32.27■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 BRD2P25440 801 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 RAB41Q5JT25 222 aa32.27■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 SCD5Q86SK9 330 aa32.27■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP32.27■■■□□ 2.76
INO80B-201ENST00000233331 CALCAP01258 141 aa32.26■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 SETSIPP0DME0 302 aa32.26■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 SLC9A1P19634 815 aa32.26■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 PSEN1P49768 467 aa32.26■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 TKTL1P51854 596 aa32.26■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 ZNF132P52740 706 aa32.26■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP32.26■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 EXOC3L4Q17RC7 722 aa32.26■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 LCLAT1Q6UWP7 414 aa32.26■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 LRRC4Q9HBW1 653 aa32.26■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 NUDT5Q9UKK9 219 aa32.26■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 FBXO4Q9UKT5 387 aa32.26■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 E2F8A0AVK6 867 aa32.25■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 RALAP11233 206 aa32.25■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 NBL1P41271 181 aa32.25■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 CCINQ13939 588 aa32.25■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 TMEM196Q5HYL7 178 aa32.25■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP32.25■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 FSTL4Q6MZW2 842 aa32.25■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 GJB7Q6PEY0 223 aa32.25■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 Q6ZS52 159 aa32.25■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 EXOC4Q96A65 974 aa32.25■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 P2RY13Q9BPV8 354 aa32.25■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 ZSWIM1Q9BR11 485 aa32.25■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 TBC1D14Q9P2M4 693 aa32.25■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP32.25■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 M0QYV0 167 aa32.24■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 MDM4O15151 490 aa32.24■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 CYP17A1P05093 508 aa32.24■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 PLA2G4AP47712 749 aa32.24■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 MRE11P49959 708 aa32.24■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 MFAP3P55082 362 aa32.24■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 STILQ15468 1287 aa32.24■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 C10orf120Q5SQS8 335 aa32.24■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 SASS6Q6UVJ0 657 aa32.24■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa32.24■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 TADA2BQ86TJ2 420 aa32.24■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa32.24■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 ULBP1Q9BZM6 244 aa32.24■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 KCNJ18B7U540 433 aa32.23■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 GALK1P51570 392 aa32.23■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 APBA1Q02410 837 aa32.23■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 GAS6Q14393 721 aa32.23■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 KCNJ12Q14500 433 aa32.23■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 CNGA2Q16280 664 aa32.23■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 PKDCCQ504Y2 493 aa32.23■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 KLHDC10Q6PID8 442 aa32.23■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 ARHGAP18Q8N392 663 aa32.23■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 CD101Q93033 1021 aa32.23■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 WBP2Q969T9 261 aa32.23■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 FAM81BQ96LP2 452 aa32.23■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 CLIC5Q9NZA1 410 aa32.23■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 APEX2Q9UBZ4 518 aa32.23■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 DNMT3LQ9UJW3 386 aa32.23■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 CNTN6Q9UQ52 1028 aa32.23■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa32.23■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 ZBED1O96006 694 aa32.22■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 PON1P27169 355 aa32.22■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP32.22■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 GOLGA8FQ08AF8 430 aa32.22■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa32.22■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 ADIGQ0VDE8 80 aa32.22■■■□□ 2.75
INO80B-201ENST00000233331 DHCR24Q15392 516 aa32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms