RNA–Protein interactions for RNA: YLR116W

MSL5, Transcript of Component of commitment complex, yeast

Gene MSL5, Length 1,431 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSL5	YLR116W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.14	□□□□□ -1.59	RIP-Chip
MSL5	YLR116W	KAP122	P32767	1081 aa		5.14	□□□□□ -1.59
MSL5	YLR116W	PRK1	P40494	810 aa		5.14	□□□□□ -1.59
MSL5	YLR116W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
MSL5	YLR116W	NGR1	P32831	672 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
MSL5	YLR116W	APM2	P38700	605 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MSL5	YLR116W	YPL034W	Q03083	165 aa		5.13	□□□□□ -1.59
MSL5	YLR116W	GAL2	P13181	574 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MSL5	YLR116W	VAN1	P23642	535 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MSL5	YLR116W	MAC1	P35192	417 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MSL5	YLR116W	HXT5	P38695	592 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MSL5	YLR116W	CWH41	P53008	833 aa		5.12	□□□□□ -1.59
MSL5	YLR116W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
MSL5	YLR116W	BUD9	P53226	547 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MSL5	YLR116W	GIS4	Q04233	774 aa		5.11	□□□□□ -1.59
MSL5	YLR116W	RPC31	P17890	251 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MSL5	YLR116W	ROM1	P53046	1155 aa		5.1	□□□□□ -1.59
MSL5	YLR116W	TRS33	Q99394	268 aa		5.09	□□□□□ -1.59
MSL5	YLR116W	QDR2	P40474	542 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	AI3	P03877	415 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	YNR040W	P53736	256 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	RRM3	P38766	723 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	SLP1	Q12232	587 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	SAC7	P17121	654 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	IDI1	P15496	288 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	SFA1	P32771	386 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	TGL4	P36165	910 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	CAB1	Q04430	367 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	OMA1	P36163	345 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	LEO1	P38439	464 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	DYS1	P38791	387 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	ECM23	Q02710	187 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	YOR296W	Q08748	1289 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	MRPL33	P20084	86 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	GAS5	Q08193	484 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MSL5	YLR116W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	TTI1	P36097	1038 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	GIP1	P38229	639 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	ITC1	P53125	1264 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	RSC2	Q06488	889 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	VMA3	P25515	160 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	COQ2	P32378	372 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	UBX7	P38349	436 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	INP52	P50942	1183 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	MRP10	O75012	95 aa		5	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	SUV3	P32580	737 aa		5	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	LDH1	P38139	375 aa		5	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	RSC6	P25632	483 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	ISW1	P38144	1129 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	BSD2	P38356	321 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	KAE1	P36132	386 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	YBR197C	P38306	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	YBR287W	P38355	427 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	GIP2	P40036	548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	MED7	Q08278	222 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	TED1	P40533	473 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	DSE4	P53753	1117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	PUF6	Q04373	656 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MSL5	YLR116W	IRC24	P40580	263 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	PPT1	P53043	513 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	CPS1	P27614	576 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	ISC10	P32645	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	SAF1	P38352	637 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	CHS2	P14180	963 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	FIR1	P40020	876 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	YIL165C	P40446	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	YJL181W	P46987	611 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	PUN1	Q06991	263 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	MSN1	P22148	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	LEM3	P42838	414 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	PUP1	P25043	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	LIP5	P32875	414 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	YKR073C	P36153	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	TOS1	P38288	455 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	DMA2	P53924	522 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	TRP3	P00937	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	SRS2	P12954	1174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	AKR1	P39010	764 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	GUP1	P53154	560 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MSL5	YLR116W	PAN5	P38787	379 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSL5	YLR116W	AIM46	P38885	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSL5	YLR116W	HXT8	P40886	569 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSL5	YLR116W	AVT1	P47082	602 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSL5	YLR116W	YGR130C	P53278	816 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSL5	YLR116W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MSL5	YLR116W	REC8	Q12188	680 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MSL5	YLR116W	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
MSL5	YLR116W	FUS1	P11710	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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