RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeastyeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR104WYKR104W NSG2P53898 299 aa8.08□□□□□ -1.12
YKR104WYKR104W CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
YKR104WYKR104W THI72Q08579 599 aa8.08□□□□□ -1.12
YKR104WYKR104W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
YKR104WYKR104W RPC31P17890 251 aa8.07□□□□□ -1.12
YKR104WYKR104W KNS1P32350 737 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
YKR104WYKR104W VMA3P25515 160 aa8.06□□□□□ -1.12
YKR104WYKR104W MSC7P38694 644 aa8.06□□□□□ -1.12
YKR104WYKR104W APM2P38700 605 aa8.06□□□□□ -1.12
YKR104WYKR104W MTC5Q03897 1148 aa8.06□□□□□ -1.12
YKR104WYKR104W PDC5P16467 563 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
YKR104WYKR104W ISC10P32645 267 aa8.05□□□□□ -1.12
YKR104WYKR104W RRN6P32786 894 aa8.05□□□□□ -1.12
YKR104WYKR104W MET1P36150 593 aa8.05□□□□□ -1.12
YKR104WYKR104W LDH1P38139 375 aa8.05□□□□□ -1.12
YKR104WYKR104W MDJ1P35191 511 aa8.03□□□□□ -1.12
YKR104WYKR104W YFL066CP43538 392 aa8.03□□□□□ -1.12
YKR104WYKR104W PNP1Q05788 311 aa8.03□□□□□ -1.12
YKR104WYKR104W RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
YKR104WYKR104W YOR296WQ08748 1289 aa8.02□□□□□ -1.13
YKR104WYKR104W YBR287WP38355 427 aa8.01□□□□□ -1.13
YKR104WYKR104W YNR014WP53719 212 aa8.01□□□□□ -1.13
YKR104WYKR104W GIP1P38229 639 aa7.99□□□□□ -1.13
YKR104WYKR104W ISW1P38144 1129 aa7.98□□□□□ -1.13
YKR104WYKR104W BOI2P39969 1040 aa7.98□□□□□ -1.13
YKR104WYKR104W PRK1P40494 810 aa7.98□□□□□ -1.13
YKR104WYKR104W SBE2P42223 864 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
YKR104WYKR104W YNR040WP53736 256 aa7.98□□□□□ -1.13
YKR104WYKR104W FUR4P05316 633 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
YKR104WYKR104W SSA1P10591 642 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
YKR104WYKR104W TDA6Q06466 467 aa7.97□□□□□ -1.13
YKR104WYKR104W YPR053CQ6Q5F3 151 aa7.97□□□□□ -1.13
YKR104WYKR104W MCX1P38323 520 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
YKR104WYKR104W TPS3P38426 1054 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
YKR104WYKR104W YER156CP40093 338 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
YKR104WYKR104W ITC1P53125 1264 aa7.96□□□□□ -1.14
YKR104WYKR104W FIR1P40020 876 aa7.95□□□□□ -1.14
YKR104WYKR104W LSO1Q3E827 93 aa7.95□□□□□ -1.14
YKR104WYKR104W BSD2P38356 321 aa7.94□□□□□ -1.14
YKR104WYKR104W HXT8P40886 569 aa7.94□□□□□ -1.14
YKR104WYKR104W RSC2Q06488 889 aa7.94□□□□□ -1.14
YKR104WYKR104W MSN1P22148 382 aa7.93□□□□□ -1.14
YKR104WYKR104W YMR187CQ03236 431 aa7.93□□□□□ -1.14
YKR104WYKR104W APC11Q12157 165 aa7.93□□□□□ -1.14
YKR104WYKR104W IDI1P15496 288 aa7.92□□□□□ -1.14
YKR104WYKR104W NHA1Q99271 985 aa7.92□□□□□ -1.14
YKR104WYKR104W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data7.91□□□□□ -1.14not detected
YKR104WYKR104W ALG14P38242 237 aa7.91□□□□□ -1.14
YKR104WYKR104W SMC1P32908 1225 aa7.89□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W PGM2P37012 569 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W SKN7P38889 622 aa7.89□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W YIL165CP40446 119 aa7.89□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W SUT1P53032 299 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W GIS4Q04233 774 aa7.89□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W KAR5Q04746 504 aa7.89□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W BOI1P38041 980 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W BOL3P39724 118 aa7.88□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W LSB3P43603 459 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W SLP1Q12232 587 aa7.87□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W NAR1P23503 491 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W GEF1P37020 779 aa7.86□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W NTA1P40354 457 aa7.86□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W CDC3P32457 520 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W AIM46P38885 310 aa7.85□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W RAD55P38953 406 aa7.84□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W CCT8P47079 568 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W PPT1P53043 513 aa7.84□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W EMG1Q06287 252 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W YDR215CQ12240 137 aa7.84□□□□□ -1.15
YKR104WYKR104W RPB10P22139 70 aa7.83□□□□□ -1.16
YKR104WYKR104W KTR2P33550 425 aa7.83□□□□□ -1.16
YKR104WYKR104W RGD2P43556 714 aa7.83□□□□□ -1.16
YKR104WYKR104W IRS4P36115 615 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
YKR104WYKR104W GLO3P38682 493 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
YKR104WYKR104W ATG1P53104 897 aa7.82□□□□□ -1.16
YKR104WYKR104W MRP10O75012 95 aa7.81□□□□□ -1.16
YKR104WYKR104W YCK2P23292 546 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
YKR104WYKR104W TAT1P38085 619 aa7.81□□□□□ -1.16
YKR104WYKR104W QDR1P40475 563 aa7.8□□□□□ -1.16
YKR104WYKR104W UFD2P54860 961 aa7.8□□□□□ -1.16
YKR104WYKR104W PSY2P40164 858 aa7.79□□□□□ -1.16
YKR104WYKR104W YJL181WP46987 611 aa7.79□□□□□ -1.16
YKR104WYKR104W ACF4P47129 309 aa7.79□□□□□ -1.16
YKR104WYKR104W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
YKR104WYKR104W INP51P40559 946 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
YKR104WYKR104W LEM3P42838 414 aa7.78□□□□□ -1.16
YKR104WYKR104W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
YKR104WYKR104W GUP1P53154 560 aa7.77□□□□□ -1.17
YKR104WYKR104W BUD9P53226 547 aa7.77□□□□□ -1.17
YKR104WYKR104W FUS1P11710 512 aa7.76□□□□□ -1.17
YKR104WYKR104W RRM3P38766 723 aa7.76□□□□□ -1.17
YKR104WYKR104W GIP2P40036 548 aa7.76□□□□□ -1.17
YKR104WYKR104W PRY1P47032 299 aa7.76□□□□□ -1.17
YKR104WYKR104W SFA1P32771 386 aa7.75□□□□□ -1.17
YKR104WYKR104W SOK2P53438 785 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
YKR104WYKR104W BIO5P53744 561 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
YKR104WYKR104W SOG2Q08817 791 aa7.75□□□□□ -1.17
YKR104WYKR104W TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa7.74□□□□□ -1.17
YKR104WYKR104W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa7.74□□□□□ -1.17
YKR104WYKR104W AI3P03877 415 aa7.73□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.4 ms