RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W SPP41P38904 1435 aa5.93□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W DIT1P21623 536 aa5.93□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W SHM1P37292 490 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W ATG3P40344 310 aa5.93□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W TIF1P10081 395 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W JJJ2P46997 583 aa5.92□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W KRE33P53914 1056 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W SYT1Q06836 1226 aa5.92□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W THI72Q08579 599 aa5.92□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W TY1B-DR3Q99231 1755 aa5.91□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W ENO1P00924 437 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W NSG2P53898 299 aa5.91□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W ADE12P80210 433 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W MRX10Q05648 414 aa5.91□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W DNF2Q12675 1612 aa5.91□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W IRE1P32361 1115 aa5.9□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W RTG2P32608 588 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W YFL066CP43538 392 aa5.9□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W IOC4Q04213 475 aa5.9□□□□□ -1.46
PIR3YKL163W SMC4Q12267 1418 aa5.9□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W SWI5P08153 709 aa5.89□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W YML020WQ03722 664 aa5.89□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W PHM7Q12252 991 aa5.89□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W TSC11P40061 1430 aa5.89□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W POL1P13382 1468 aa5.89□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W AI1P03875 834 aa5.88□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W LSB3P43603 459 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W AIM9P40053 627 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W PSH1Q12161 406 aa5.87□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W NTE1Q04958 1679 aa5.86□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W NUP170P38181 1502 aa5.86□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W VTH1P40438 1549 aa5.86□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W VTH2P40890 1549 aa5.86□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W YOR1P53049 1477 aa5.86□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W PDC6P26263 563 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W RPL34BP40525 121 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W SBE2P42223 864 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W ORC1P54784 914 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W YPQ2Q06328 317 aa5.86□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa5.86□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W RPS31P05759 152 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W NOP7P53261 605 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W STU1P38198 1513 aa5.84□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W PDI1P17967 522 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W NTH2P35172 780 aa5.84□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W MRPL16P38064 232 aa5.84□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W MET10P39692 1035 aa5.84□□□□□ -1.47
PIR3YKL163W PEP12P32854 288 aa5.83□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W YNL165WP53891 406 aa5.83□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W TY1B-ER2Q03619 1755 aa5.83□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W TY1B-MR1Q04214 1755 aa5.83□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W TY1B-NL1Q12112 1755 aa5.83□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W TY1B-GR1Q12141 1755 aa5.83□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W TY1B-BLQ12490 1755 aa5.83□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W SNT2P53127 1403 aa5.82□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W YOR093CQ12275 1648 aa5.82□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W STB3Q12427 513 aa5.82□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W MYO4P32492 1471 aa5.82□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W FPS1P23900 669 aa5.81□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W KTR7P40504 517 aa5.81□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W SSA1P10591 642 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W TDA6Q06466 467 aa5.8□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W GPM1P00950 247 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W SPR3P41901 512 aa5.79□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W YFL034WP43564 1073 aa5.79□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W TSC13Q99190 310 aa5.79□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W GEF1P37020 779 aa5.78□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W ALD2P47771 506 aa5.78□□□□□ -1.48
PIR3YKL163W LEU1P07264 779 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W CCT8P47079 568 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W ACS2P52910 683 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W YNR014WP53719 212 aa5.77□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W YPR053CQ6Q5F3 151 aa5.77□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W Q0182Q9ZZW1 134 aa5.77□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W SPO14P36126 1683 aa5.77□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W ULS1Q08562 1619 aa5.77□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W MLF3P32047 452 aa5.76□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W TRM3Q07527 1436 aa5.75□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W CYT1P07143 309 aa5.75□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W MCM1P11746 286 aa5.75□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W SLD2P34252 453 aa5.75□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W TY1A-DR2Q03964 440 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W YMR187CQ03236 431 aa5.74□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W STH1P32597 1359 aa5.74□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W DOP1Q03921 1698 aa5.74□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W IQG1Q12280 1495 aa5.73□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W PDC5P16467 563 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W RGP1P16664 663 aa5.73□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W PHO87P25360 923 aa5.73□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W MSC7P38694 644 aa5.73□□□□□ -1.49
PIR3YKL163W SKN7P38889 622 aa5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.8 ms