RNA–Protein interactions for RNA: YHR209W

CRG1, Transcript of S-AdoMet-dependent methyltransferase involved in lipid homeostasis, yeast

Gene CRG1, Length 876 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CRG1	YHR209W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.62	not detected
CRG1	YHR209W	YBR287W	P38355	427 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	ECM23	Q02710	187 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	NHA1	Q99271	985 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	RPC31	P17890	251 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	DYS1	P38791	387 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	UBX7	P38349	436 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	TPS3	P38426	1054 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	TAT1	P38085	619 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	QDR2	P40474	542 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	SLP1	Q12232	587 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	YDR215C	Q12240	137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	MRPL33	P20084	86 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	ALG14	P38242	237 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	PRK1	P40494	810 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	CAB1	Q04430	367 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	RSC2	Q06488	889 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	CPS1	P27614	576 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	LDH1	P38139	375 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CRG1	YHR209W	SRS2	P12954	1174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	PUP1	P25043	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	VMA3	P25515	160 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	GIP1	P38229	639 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	SUV3	P32580	737 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	ISW1	P38144	1129 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	YBR197C	P38306	217 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	ALD4	P46367	519 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	GIS4	Q04233	774 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	LSB6	P42951	607 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	FOX2	Q02207	900 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	PUN1	Q06991	263 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	IDI1	P15496	288 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	SFA1	P32771	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	RRN6	P32786	894 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	YNR040W	P53736	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	FIR1	P40020	876 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	ITC1	P53125	1264 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	BUD9	P53226	547 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	AI3	P03877	415 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	ISC10	P32645	267 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	LEM3	P42838	414 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
CRG1	YHR209W	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	SAC7	P17121	654 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	PRY1	P47032	299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	YPL034W	Q03083	165 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CRG1	YHR209W	RRM3	P38766	723 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	RLF2	Q12495	606 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	YIL165C	P40446	119 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	HXT8	P40886	569 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	DSE4	P53753	1117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	PNP1	Q05788	311 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	MCA1	Q08601	432 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	MSN1	P22148	382 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	RSC6	P25632	483 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	BSD2	P38356	321 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	GUP1	P53154	560 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	SMC1	P32908	1225 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	GIP2	P40036	548 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	PPT1	P53043	513 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	NOB1	Q08444	459 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	APC11	Q12157	165 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	AIM46	P38885	310 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	COQ2	P32378	372 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	MAC1	P35192	417 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	NTA1	P40354	457 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CRG1	YHR209W	EMG1	Q06287	252 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CRG1	YHR209W	SOG2	Q08817	791 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CRG1	YHR209W	MRP10	O75012	95 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CRG1	YHR209W	FUS1	P11710	512 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CRG1	YHR209W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CRG1	YHR209W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
CRG1	YHR209W	YML083C	Q04526	418 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CRG1	YHR209W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CRG1	YHR209W	KAE1	P36132	386 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CRG1	YHR209W	RAD55	P38953	406 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CRG1	YHR209W	TED1	P40533	473 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CRG1	YHR209W	YJL181W	P46987	611 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CRG1	YHR209W	SUB2	Q07478	446 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CRG1	YHR209W	SAF1	P38352	637 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CRG1	YHR209W	RGD2	P43556	714 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CRG1	YHR209W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CRG1	YHR209W	RPL34A	P87262	121 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65

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