RNA–Protein interactions for RNA: YBL048W

RRT1, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene RRT1, Length 312 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT1YBL048W PGM2P37012 569 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RRT1YBL048W NCL1P38205 684 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RRT1YBL048W BUD9P53226 547 aa6.82□□□□□ -1.32
RRT1YBL048W ALG14P38242 237 aa6.81□□□□□ -1.32
RRT1YBL048W CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
RRT1YBL048W RPC31P17890 251 aa6.8□□□□□ -1.32
RRT1YBL048W SIS2P36024 562 aa6.8□□□□□ -1.32
RRT1YBL048W KTR7P40504 517 aa6.8□□□□□ -1.32
RRT1YBL048W NAR1P23503 491 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RRT1YBL048W APM2P38700 605 aa6.79□□□□□ -1.32
RRT1YBL048W ROM1P53046 1155 aa6.79□□□□□ -1.32
RRT1YBL048W YNR040WP53736 256 aa6.79□□□□□ -1.32
RRT1YBL048W GIS4Q04233 774 aa6.79□□□□□ -1.32
RRT1YBL048W GAL2P13181 574 aa6.78□□□□□ -1.32
RRT1YBL048W AI3P03877 415 aa6.75□□□□□ -1.33
RRT1YBL048W VAN1P23642 535 aa6.72□□□□□ -1.33
RRT1YBL048W PGM1P33401 570 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
RRT1YBL048W QDR2P40474 542 aa6.72□□□□□ -1.33
RRT1YBL048W MRP10O75012 95 aa6.7□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W IDI1P15496 288 aa6.7□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W SAC7P17121 654 aa6.7□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W SUV3P32580 737 aa6.7□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W SFA1P32771 386 aa6.7□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W MAC1P35192 417 aa6.7□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W TGL4P36165 910 aa6.7□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W YER156CP40093 338 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W INP52P50942 1183 aa6.7□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W ITC1P53125 1264 aa6.7□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W CAB1Q04430 367 aa6.7□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W NAB2P32505 525 aaKnown RBP RIP-Chip data6.69□□□□□ -1.34not detected
RRT1YBL048W RRM3P38766 723 aa6.69□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W CWH41P53008 833 aa6.69□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W ALO1P54783 526 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W GAS5Q08193 484 aa6.69□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W TTI1P36097 1038 aa6.68□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W ARI1P53111 347 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W SLP1Q12232 587 aa6.68□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W TRS33Q99394 268 aa6.68□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W VMA3P25515 160 aa6.67□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W YOR296WQ08748 1289 aa6.67□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W MRPL33P20084 86 aa6.66□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W OMA1P36163 345 aa6.65□□□□□ -1.34
RRT1YBL048W GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
RRT1YBL048W TY4B-PA0A0B7P3V8 1104 aa6.64□□□□□ -1.35
RRT1YBL048W LEO1P38439 464 aa6.64□□□□□ -1.35
RRT1YBL048W DYS1P38791 387 aa6.64□□□□□ -1.35
RRT1YBL048W ECM23Q02710 187 aa6.64□□□□□ -1.35
RRT1YBL048W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa6.64□□□□□ -1.35
RRT1YBL048W YBR197CP38306 217 aa6.63□□□□□ -1.35
RRT1YBL048W GIP1P38229 639 aa6.62□□□□□ -1.35
RRT1YBL048W LDH1P38139 375 aa6.6□□□□□ -1.35
RRT1YBL048W BSD2P38356 321 aa6.6□□□□□ -1.35
RRT1YBL048W GIP2P40036 548 aa6.6□□□□□ -1.35
RRT1YBL048W RSC6P25632 483 aa6.59□□□□□ -1.35
RRT1YBL048W UBX7P38349 436 aa6.59□□□□□ -1.35
RRT1YBL048W TY1A-NL1Q12391 440 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RRT1YBL048W TED1P40533 473 aa6.58□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W FOX2Q02207 900 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W RSC2Q06488 889 aa6.58□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W COQ2P32378 372 aa6.57□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W KAE1P36132 386 aa6.57□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W ISW1P38144 1129 aa6.57□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W YIL165CP40446 119 aa6.57□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W YLR122CQ12312 125 aa6.57□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W TRP3P00937 484 aa6.56□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W ALD4P46367 519 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W SOK2P53438 785 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W PUF6Q04373 656 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W MED7Q08278 222 aa6.56□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W PUP1P25043 261 aa6.55□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W YKR073CP36153 106 aa6.55□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W IRC24P40580 263 aa6.55□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W DSE4P53753 1117 aa6.55□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W MSN1P22148 382 aa6.54□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W ISC10P32645 267 aa6.54□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W SAF1P38352 637 aa6.54□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W PPT1P53043 513 aa6.53□□□□□ -1.36
RRT1YBL048W CPS1P27614 576 aa6.52□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W INP51P40559 946 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W YJL181WP46987 611 aa6.51□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W GUP1P53154 560 aa6.51□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W EMG1Q06287 252 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W PUN1Q06991 263 aa6.51□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W SRS2P12954 1174 aa6.5□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W PUB1P32588 453 aaKnown RBP RIP-Chip data6.5□□□□□ -1.37not detected
RRT1YBL048W CTH1P47976 325 aa6.5□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W BIO5P53744 561 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W DMA2P53924 522 aa6.5□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W SOG2Q08817 791 aa6.5□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W REC8Q12188 680 aa6.5□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W LEM3P42838 414 aa6.49□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W PUF3Q07807 879 aaKnown RBP RIP-Chip data6.49□□□□□ -1.37not detected
RRT1YBL048W CHS2P14180 963 aa6.48□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W TOS1P38288 455 aa6.48□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W YBR287WP38355 427 aa6.48□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W PAN5P38787 379 aa6.48□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W CWC15Q03772 175 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W NAM7P30771 971 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W TFA2P36145 328 aa6.47□□□□□ -1.37
RRT1YBL048W AVT1P47082 602 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 58 ms