RNA–Protein interactions for RNA: Q0143

Q0143, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0143, Length 153 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0143	Q0143	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
Q0143	Q0143	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.65	□□□□□ -1.67
Q0143	Q0143	SDH1	Q00711	640 aa		4.64	□□□□□ -1.67
Q0143	Q0143	SLP1	Q12232	587 aa		4.64	□□□□□ -1.67
Q0143	Q0143	MLF3	P32047	452 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Q0143	Q0143	SOH1	P38633	127 aa		4.63	□□□□□ -1.67
Q0143	Q0143	TY4B-P	A0A0B7P3V8	1104 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Q0143	Q0143	SWI5	P08153	709 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Q0143	Q0143	YPT53	P36019	220 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Q0143	Q0143	TY4A-H	Q6Q5P6	413 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Q0143	Q0143	DFG16	Q99234	619 aa		4.62	□□□□□ -1.67
Q0143	Q0143	MSB1	P21339	1137 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
Q0143	Q0143	REC8	Q12188	680 aa		4.61	□□□□□ -1.67
Q0143	Q0143	MTO1	P53070	669 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Q0143	Q0143	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Q0143	Q0143	TED1	P40533	473 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Q0143	Q0143	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
Q0143	Q0143	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
Q0143	Q0143	HDA2	Q06629	674 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Q0143	Q0143	MRP10	O75012	95 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Q0143	Q0143	CBC2	Q08920	208 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
Q0143	Q0143	ATG3	P40344	310 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Q0143	Q0143	SKP1	P52286	194 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Q0143	Q0143	DSE4	P53753	1117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Q0143	Q0143	MCM1	P11746	286 aa		4.56	□□□□□ -1.68
Q0143	Q0143	YNR040W	P53736	256 aa		4.55	□□□□□ -1.68
Q0143	Q0143	APM2	P38700	605 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Q0143	Q0143	GIP2	P40036	548 aa		4.54	□□□□□ -1.68
Q0143	Q0143	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
Q0143	Q0143	YHL008C	P38750	627 aa		4.53	□□□□□ -1.68
Q0143	Q0143	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
Q0143	Q0143	CDA2	Q06703	312 aa		4.52	□□□□□ -1.69
Q0143	Q0143	THI80	P35202	319 aa		4.51	□□□□□ -1.69
Q0143	Q0143	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
Q0143	Q0143	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
Q0143	Q0143	AIM9	P40053	627 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
Q0143	Q0143	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
Q0143	Q0143	FLR1	P38124	548 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Q0143	Q0143	YNR065C	P53751	1116 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Q0143	Q0143	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
Q0143	Q0143	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
Q0143	Q0143	AIM7	Q12156	149 aa		4.48	□□□□□ -1.69
Q0143	Q0143	IDI1	P15496	288 aa		4.47	□□□□□ -1.69
Q0143	Q0143	SPT5	P27692	1063 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
Q0143	Q0143	CSE4	P36012	229 aa		4.47	□□□□□ -1.69
Q0143	Q0143	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
Q0143	Q0143	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
Q0143	Q0143	YDJ1	P25491	409 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
Q0143	Q0143	KAP122	P32767	1081 aa		4.45	□□□□□ -1.7
Q0143	Q0143	NFS1	P25374	497 aa		4.44	□□□□□ -1.7
Q0143	Q0143	NTH2	P35172	780 aa		4.43	□□□□□ -1.7
Q0143	Q0143	YFL034W	P43564	1073 aa		4.42	□□□□□ -1.7
Q0143	Q0143	MSH6	Q03834	1242 aa		4.41	□□□□□ -1.7
Q0143	Q0143	YML122C	Q03207	126 aa		4.4	□□□□□ -1.71
Q0143	Q0143	UTP4	Q06679	776 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
Q0143	Q0143	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
Q0143	Q0143	HSP78	P33416	811 aa		4.39	□□□□□ -1.71
Q0143	Q0143	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
Q0143	Q0143	YPP1	P46951	817 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Q0143	Q0143	NCE103	P53615	221 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Q0143	Q0143	GIC2	Q06648	383 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Q0143	Q0143	NSI1	Q12457	570 aa		4.38	□□□□□ -1.71
Q0143	Q0143	RPC31	P17890	251 aa		4.37	□□□□□ -1.71
Q0143	Q0143	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
Q0143	Q0143	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
Q0143	Q0143	PAN5	P38787	379 aa		4.34	□□□□□ -1.71
Q0143	Q0143	ITC1	P53125	1264 aa		4.34	□□□□□ -1.71
Q0143	Q0143	PNS1	Q12412	539 aa		4.34	□□□□□ -1.71
Q0143	Q0143	CYT1	P07143	309 aa		4.31	□□□□□ -1.72
Q0143	Q0143	SCD5	P34758	872 aa		4.31	□□□□□ -1.72
Q0143	Q0143	YBL036C	P38197	257 aa		4.31	□□□□□ -1.72
Q0143	Q0143	YJL181W	P46987	611 aa		4.31	□□□□□ -1.72
Q0143	Q0143	PDI1	P17967	522 aa	Known RBP	4.3	□□□□□ -1.72
Q0143	Q0143	MMM1	P41800	426 aa		4.29	□□□□□ -1.72
Q0143	Q0143	RSC2	Q06488	889 aa		4.29	□□□□□ -1.72
Q0143	Q0143	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
Q0143	Q0143	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
Q0143	Q0143	QDR2	P40474	542 aa		4.28	□□□□□ -1.72
Q0143	Q0143	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
Q0143	Q0143	CIT3	P43635	486 aa		4.27	□□□□□ -1.73
Q0143	Q0143	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.26	□□□□□ -1.73
Q0143	Q0143	LEM3	P42838	414 aa		4.24	□□□□□ -1.73
Q0143	Q0143	GUP1	P53154	560 aa		4.24	□□□□□ -1.73
Q0143	Q0143	TSC13	Q99190	310 aa		4.24	□□□□□ -1.73
Q0143	Q0143	KIP3	P53086	805 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
Q0143	Q0143	RIM8	P53179	542 aa		4.23	□□□□□ -1.73
Q0143	Q0143	RCM1	P53972	490 aa		4.23	□□□□□ -1.73
Q0143	Q0143	ELG1	Q12050	791 aa		4.23	□□□□□ -1.73
Q0143	Q0143	HXT5	P38695	592 aa		4.22	□□□□□ -1.73
Q0143	Q0143	PPT1	P53043	513 aa		4.22	□□□□□ -1.73
Q0143	Q0143	YOR296W	Q08748	1289 aa		4.21	□□□□□ -1.74
Q0143	Q0143	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
Q0143	Q0143	ERS1	P17261	260 aa		4.2	□□□□□ -1.74
Q0143	Q0143	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
Q0143	Q0143	ADP1	P25371	1049 aa		4.2	□□□□□ -1.74
Q0143	Q0143	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
Q0143	Q0143	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
Q0143	Q0143	TOD6	P34219	525 aa		4.19	□□□□□ -1.74
Q0143	Q0143	SPO71	Q03868	1245 aa		4.19	□□□□□ -1.74
Q0143	Q0143	SUP45	P12385	437 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18 ms