RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639439.1

PTPRVP-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRVP, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-204ENST00000639439 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.83■■□□□ 1.25
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PTPRVP-204ENST00000639439 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.81■■□□□ 1.24
PTPRVP-204ENST00000639439 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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PTPRVP-204ENST00000639439 STAC3Q96MF2 364 aa22.79■■□□□ 1.24
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PTPRVP-204ENST00000639439 AFF2P51816 1311 aa22.67■■□□□ 1.22
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PTPRVP-204ENST00000639439 KIF1AQ12756 1690 aa22.62■■□□□ 1.21
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PTPRVP-204ENST00000639439 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.59■■□□□ 1.21
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PTPRVP-204ENST00000639439 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
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PTPRVP-204ENST00000639439 PLEKHG3A1L390 1219 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRVP-204ENST00000639439 ABCA3Q99758 1704 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRVP-204ENST00000639439 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRVP-204ENST00000639439 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRVP-204ENST00000639439 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRVP-204ENST00000639439 VPS72Q15906 364 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRVP-204ENST00000639439 ACEP12821 1306 aa22.29■■□□□ 1.16
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