RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635555.1

LINC00466-210, long intergenic non-protein coding RNA 466, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00466, Length 1,016 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00466-210ENST00000635555 PHOX2BQ99453 314 aa12.55□□□□□ -0.4
LINC00466-210ENST00000635555 SYNJ2O15056 1496 aa12.54□□□□□ -0.4
LINC00466-210ENST00000635555 APLP1P51693 650 aa12.54□□□□□ -0.4
LINC00466-210ENST00000635555 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
LINC00466-210ENST00000635555 CCDC102AQ96A19 550 aa12.53□□□□□ -0.4
LINC00466-210ENST00000635555 KCNC4Q03721 635 aa12.52□□□□□ -0.41
LINC00466-210ENST00000635555 SULF1Q8IWU6 871 aa12.52□□□□□ -0.41
LINC00466-210ENST00000635555 CLIP1P30622 1438 aa12.52□□□□□ -0.41
LINC00466-210ENST00000635555 KMT5BQ4FZB7 885 aa12.51□□□□□ -0.41
LINC00466-210ENST00000635555 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP12.51□□□□□ -0.41
LINC00466-210ENST00000635555 SLC10A3P09131 477 aa12.5□□□□□ -0.41
LINC00466-210ENST00000635555 TJAP1Q5JTD0 557 aa12.49□□□□□ -0.41
LINC00466-210ENST00000635555 CUL7Q14999 1698 aa12.48□□□□□ -0.41
LINC00466-210ENST00000635555 GRIN2AQ12879 1464 aa12.48□□□□□ -0.41
LINC00466-210ENST00000635555 FHAD1B1AJZ9 1412 aa12.48□□□□□ -0.41
LINC00466-210ENST00000635555 CFHP08603 1231 aa12.48□□□□□ -0.41
LINC00466-210ENST00000635555 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
LINC00466-210ENST00000635555 NLRP7Q8WX94 980 aa12.48□□□□□ -0.41
LINC00466-210ENST00000635555 IL21Q9HBE4 155 aa12.48□□□□□ -0.41
LINC00466-210ENST00000635555 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa12.48□□□□□ -0.41
LINC00466-210ENST00000635555 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa12.48□□□□□ -0.41
LINC00466-210ENST00000635555 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa12.48□□□□□ -0.41
LINC00466-210ENST00000635555 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
LINC00466-210ENST00000635555 MTRQ99707 1265 aa12.47□□□□□ -0.41
LINC00466-210ENST00000635555 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.46□□□□□ -0.42
LINC00466-210ENST00000635555 CEP170Q5SW79 1584 aa12.45□□□□□ -0.42
LINC00466-210ENST00000635555 DDX11L8A8MPP1 907 aa12.45□□□□□ -0.42
LINC00466-210ENST00000635555 RDH13Q8NBN7 331 aa12.45□□□□□ -0.42
LINC00466-210ENST00000635555 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa12.45□□□□□ -0.42
LINC00466-210ENST00000635555 ARHGEF11O15085 1522 aa12.45□□□□□ -0.42
LINC00466-210ENST00000635555 ARAP1Q96P48 1450 aa12.45□□□□□ -0.42
LINC00466-210ENST00000635555 VPS8Q8N3P4 1428 aa12.45□□□□□ -0.42
LINC00466-210ENST00000635555 CLCN1P35523 988 aa12.44□□□□□ -0.42
LINC00466-210ENST00000635555 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa12.43□□□□□ -0.42
LINC00466-210ENST00000635555 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP12.43□□□□□ -0.42
LINC00466-210ENST00000635555 A0A0G2JS52 829 aa12.42□□□□□ -0.42
LINC00466-210ENST00000635555 PCGF6Q9BYE7 350 aa12.42□□□□□ -0.42
LINC00466-210ENST00000635555 GPCPD1Q9NPB8 672 aa12.42□□□□□ -0.42
LINC00466-210ENST00000635555 CYB5RLQ6IPT4 315 aa12.41□□□□□ -0.42
LINC00466-210ENST00000635555 NUP160Q12769 1436 aa12.4□□□□□ -0.42
LINC00466-210ENST00000635555 TMUB1Q9BVT8 246 aa12.4□□□□□ -0.42
LINC00466-210ENST00000635555 GCGRP47871 477 aa12.39□□□□□ -0.43
LINC00466-210ENST00000635555 COPS2P61201 443 aa12.39□□□□□ -0.43
LINC00466-210ENST00000635555 AMHR2Q16671 573 aa12.39□□□□□ -0.43
LINC00466-210ENST00000635555 AK7Q96M32 723 aa12.39□□□□□ -0.43
LINC00466-210ENST00000635555 ZPR1O75312 459 aa12.37□□□□□ -0.43
LINC00466-210ENST00000635555 RGS20O76081 388 aa12.37□□□□□ -0.43
LINC00466-210ENST00000635555 CD46P15529 392 aa12.37□□□□□ -0.43
LINC00466-210ENST00000635555 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa12.37□□□□□ -0.43
LINC00466-210ENST00000635555 ZNF516Q92618 1163 aa12.37□□□□□ -0.43
LINC00466-210ENST00000635555 NR1I2O75469 434 aa12.35□□□□□ -0.43
LINC00466-210ENST00000635555 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
LINC00466-210ENST00000635555 TRIM66O15016 1216 aa12.34□□□□□ -0.43
LINC00466-210ENST00000635555 ATP6V1AP38606 617 aa12.34□□□□□ -0.43
LINC00466-210ENST00000635555 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 GRIPAP1Q4V328 841 aa12.33□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 SHROOM2Q13796 1616 aa12.33□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 ERCC6L2Q5T890 1561 aa12.32□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 FUT2Q10981 343 aa12.32□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa12.32□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 EFCAB5A4FU69 1503 aa12.32□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 MORN1Q5T089 497 aa12.3□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 SCUBE3Q8IX30 993 aa12.3□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 MAP3K1Q13233 1512 aa12.3□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 USP46P62068 366 aa12.29□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 SLC24A3Q9HC58 644 aa12.29□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 SAMD9Q5K651 1589 aa12.29□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa12.28□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 KDM4AO75164 1064 aa12.28□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 GGCXP38435 758 aa12.28□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 IQGAP2Q13576 1575 aa12.27□□□□□ -0.44
LINC00466-210ENST00000635555 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 NKX2-3Q8TAU0 364 aa12.27□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 PPP1R18Q6NYC8 613 aa12.26□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 PARP9Q8IXQ6 854 aa12.25□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 ADH1BP00325 375 aa12.24□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 PDE4DQ08499 809 aa12.24□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 UGGT2Q9NYU1 1516 aa12.23□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa12.23□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 FHOD3Q2V2M9 1422 aa12.22□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa12.22□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 TLL1O43897 1013 aa12.22□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 NUTM1Q86Y26 1132 aa12.22□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 HRCP23327 699 aa12.21□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 Q3C1V9 767 aa12.21□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 SPSB2Q99619 263 aa12.21□□□□□ -0.45
LINC00466-210ENST00000635555 THAP11Q96EK4 314 aa12.2□□□□□ -0.46
LINC00466-210ENST00000635555 HOXA2O43364 376 aa12.19□□□□□ -0.46
LINC00466-210ENST00000635555 FMN1Q68DA7 1419 aa12.19□□□□□ -0.46
LINC00466-210ENST00000635555 BRICD5Q6PL45 260 aa12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.1 ms