RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623333.1

AP000997.3-201, humanhuman

BASIC

Gene AP000997.3, Length 2,250 nt, Biotype TEC.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP000997.3-201ENST00000623333 NLRP13Q86W25 1043 aa24.51■■□□□ 1.51
AP000997.3-201ENST00000623333 PRAM1Q96QH2 718 aa24.51■■□□□ 1.51
AP000997.3-201ENST00000623333 PTPRMP28827 1452 aa24.5■■□□□ 1.51
AP000997.3-201ENST00000623333 EVC2Q86UK5 1308 aa24.49■■□□□ 1.51
AP000997.3-201ENST00000623333 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
AP000997.3-201ENST00000623333 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.49■■□□□ 1.51
AP000997.3-201ENST00000623333 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
AP000997.3-201ENST00000623333 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.49■■□□□ 1.51
AP000997.3-201ENST00000623333 POGKQ9P215 609 aa24.49■■□□□ 1.51
AP000997.3-201ENST00000623333 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.48■■□□□ 1.51
AP000997.3-201ENST00000623333 NBR1Q14596 966 aa24.48■■□□□ 1.51
AP000997.3-201ENST00000623333 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
AP000997.3-201ENST00000623333 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa24.47■■□□□ 1.51
AP000997.3-201ENST00000623333 NUDCQ9Y266 331 aa24.47■■□□□ 1.51
AP000997.3-201ENST00000623333 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.47■■□□□ 1.51
AP000997.3-201ENST00000623333 CABP2Q9NPB3 220 aa24.46■■□□□ 1.51
AP000997.3-201ENST00000623333 NLRP1Q9C000 1473 aa24.45■■□□□ 1.51
AP000997.3-201ENST00000623333 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
AP000997.3-201ENST00000623333 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
AP000997.3-201ENST00000623333 METP08581 1390 aa24.43■■□□□ 1.5
AP000997.3-201ENST00000623333 LTKP29376 864 aa24.42■■□□□ 1.5
AP000997.3-201ENST00000623333 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
AP000997.3-201ENST00000623333 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
AP000997.3-201ENST00000623333 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.41■■□□□ 1.5
AP000997.3-201ENST00000623333 CCDC136Q96JN2 1154 aa24.41■■□□□ 1.5
AP000997.3-201ENST00000623333 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
AP000997.3-201ENST00000623333 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
AP000997.3-201ENST00000623333 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.4■■□□□ 1.5
AP000997.3-201ENST00000623333 PPP2R1AP30153 589 aa24.4■■□□□ 1.5
AP000997.3-201ENST00000623333 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.39■■□□□ 1.5
AP000997.3-201ENST00000623333 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.38■■□□□ 1.49
AP000997.3-201ENST00000623333 ABCC11Q96J66 1382 aa24.37■■□□□ 1.49
AP000997.3-201ENST00000623333 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.37■■□□□ 1.49
AP000997.3-201ENST00000623333 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
AP000997.3-201ENST00000623333 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.36■■□□□ 1.49
AP000997.3-201ENST00000623333 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.35■■□□□ 1.49
AP000997.3-201ENST00000623333 DLC1Q96QB1 1528 aa24.34■■□□□ 1.49
AP000997.3-201ENST00000623333 CDK19Q9BWU1 502 aa24.34■■□□□ 1.49
AP000997.3-201ENST00000623333 EID1Q9Y6B2 187 aa24.33■■□□□ 1.49
AP000997.3-201ENST00000623333 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
AP000997.3-201ENST00000623333 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.32■■□□□ 1.48
AP000997.3-201ENST00000623333 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
AP000997.3-201ENST00000623333 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.32■■□□□ 1.48
AP000997.3-201ENST00000623333 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.3■■□□□ 1.48
AP000997.3-201ENST00000623333 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.3■■□□□ 1.48
AP000997.3-201ENST00000623333 SLIT1O75093 1534 aa24.29■■□□□ 1.48
AP000997.3-201ENST00000623333 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.28■■□□□ 1.48
AP000997.3-201ENST00000623333 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.28■■□□□ 1.48
AP000997.3-201ENST00000623333 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.26■■□□□ 1.47
AP000997.3-201ENST00000623333 A0A1W2PP64 1363 aa24.25■■□□□ 1.47
AP000997.3-201ENST00000623333 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.25■■□□□ 1.47
AP000997.3-201ENST00000623333 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.25■■□□□ 1.47
AP000997.3-201ENST00000623333 MORC1Q86VD1 984 aa24.25■■□□□ 1.47
AP000997.3-201ENST00000623333 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
AP000997.3-201ENST00000623333 TECPR2O15040 1411 aa24.24■■□□□ 1.47
AP000997.3-201ENST00000623333 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
AP000997.3-201ENST00000623333 SIRT1Q96EB6 747 aa24.24■■□□□ 1.47
AP000997.3-201ENST00000623333 CABP1Q9NZU7 370 aa24.24■■□□□ 1.47
AP000997.3-201ENST00000623333 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.23■■□□□ 1.47
AP000997.3-201ENST00000623333 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.22■■□□□ 1.47
AP000997.3-201ENST00000623333 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.22■■□□□ 1.47
AP000997.3-201ENST00000623333 MED14O60244 1454 aa24.22■■□□□ 1.47
AP000997.3-201ENST00000623333 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
AP000997.3-201ENST00000623333 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.22■■□□□ 1.47
AP000997.3-201ENST00000623333 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
AP000997.3-201ENST00000623333 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
AP000997.3-201ENST00000623333 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.2■■□□□ 1.46
AP000997.3-201ENST00000623333 CPS1P31327 1500 aa24.19■■□□□ 1.46
AP000997.3-201ENST00000623333 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.19■■□□□ 1.46
AP000997.3-201ENST00000623333 USP32Q8NFA0 1604 aa24.19■■□□□ 1.46
AP000997.3-201ENST00000623333 PTPRUQ92729 1446 aa24.18■■□□□ 1.46
AP000997.3-201ENST00000623333 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
AP000997.3-201ENST00000623333 TBX22Q9Y458 520 aa24.18■■□□□ 1.46
AP000997.3-201ENST00000623333 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
AP000997.3-201ENST00000623333 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
AP000997.3-201ENST00000623333 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
AP000997.3-201ENST00000623333 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.16■■□□□ 1.46
AP000997.3-201ENST00000623333 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
AP000997.3-201ENST00000623333 INSRP06213 1382 aa24.14■■□□□ 1.46
AP000997.3-201ENST00000623333 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.14■■□□□ 1.45
AP000997.3-201ENST00000623333 USP35Q9P2H5 1018 aa24.14■■□□□ 1.45
AP000997.3-201ENST00000623333 NSD2O96028 1365 aa24.13■■□□□ 1.45
AP000997.3-201ENST00000623333 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.13■■□□□ 1.45
AP000997.3-201ENST00000623333 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
AP000997.3-201ENST00000623333 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
AP000997.3-201ENST00000623333 FYB1O15117 783 aa24.12■■□□□ 1.45
AP000997.3-201ENST00000623333 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.1■■□□□ 1.45
AP000997.3-201ENST00000623333 MS4A1P11836 297 aa24.09■■□□□ 1.45
AP000997.3-201ENST00000623333 MTHFSP49914 203 aa24.09■■□□□ 1.45
AP000997.3-201ENST00000623333 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
AP000997.3-201ENST00000623333 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
AP000997.3-201ENST00000623333 PDE4AP27815 886 aa24.09■■□□□ 1.45
AP000997.3-201ENST00000623333 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.09■■□□□ 1.45
AP000997.3-201ENST00000623333 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
AP000997.3-201ENST00000623333 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.08■■□□□ 1.45
AP000997.3-201ENST00000623333 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.08■■□□□ 1.45
AP000997.3-201ENST00000623333 DIP2AQ14689 1571 aa24.08■■□□□ 1.44
AP000997.3-201ENST00000623333 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.44
AP000997.3-201ENST00000623333 BACH2Q9BYV9 841 aa24.08■■□□□ 1.44
AP000997.3-201ENST00000623333 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.5 ms