RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	PIK3C2G	O75747	1445 aa		20.79	■□□□□ 0.92
MUC1-222	ENST00000610468	LRPPRC	P42704	1394 aa	Known RBP	20.79	■□□□□ 0.92
MUC1-222	ENST00000610468	ABCC11	Q96J66	1382 aa		20.78	■□□□□ 0.92
MUC1-222	ENST00000610468	RGL3	Q3MIN7	710 aa		20.77	■□□□□ 0.92
MUC1-222	ENST00000610468	RGS12	O14924	1447 aa		20.77	■□□□□ 0.91
MUC1-222	ENST00000610468	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		20.76	■□□□□ 0.91
MUC1-222	ENST00000610468	IFT172	Q9UG01	1749 aa		20.75	■□□□□ 0.91
MUC1-222	ENST00000610468	PXDN	Q92626	1479 aa		20.75	■□□□□ 0.91
MUC1-222	ENST00000610468	ADAMTS2	O95450	1211 aa		20.75	■□□□□ 0.91
MUC1-222	ENST00000610468	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	20.75	■□□□□ 0.91
MUC1-222	ENST00000610468	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	20.75	■□□□□ 0.91
MUC1-222	ENST00000610468	ACIN1	Q9UKV3	1341 aa	Known RBP	20.75	■□□□□ 0.91
MUC1-222	ENST00000610468	MYOM2	P54296	1465 aa		20.75	■□□□□ 0.91
MUC1-222	ENST00000610468	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	20.75	■□□□□ 0.91
MUC1-222	ENST00000610468	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		20.73	■□□□□ 0.91
MUC1-222	ENST00000610468	NGLY1	Q96IV0	654 aa		20.73	■□□□□ 0.91
MUC1-222	ENST00000610468	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		20.72	■□□□□ 0.91
MUC1-222	ENST00000610468	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	20.72	■□□□□ 0.91
MUC1-222	ENST00000610468	STK26	Q9P289	416 aa		20.72	■□□□□ 0.91
MUC1-222	ENST00000610468	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		20.72	■□□□□ 0.91
MUC1-222	ENST00000610468	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		20.71	■□□□□ 0.91
MUC1-222	ENST00000610468	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		20.71	■□□□□ 0.91
MUC1-222	ENST00000610468	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	20.7	■□□□□ 0.9
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM132E	Q6IEE7	984 aa		20.7	■□□□□ 0.9
MUC1-222	ENST00000610468	SIRT1	Q96EB6	747 aa		20.69	■□□□□ 0.9
MUC1-222	ENST00000610468	FOXO3	O43524	673 aa		20.68	■□□□□ 0.9
MUC1-222	ENST00000610468	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	20.68	■□□□□ 0.9
MUC1-222	ENST00000610468	USP21	Q9UK80	565 aa		20.67	■□□□□ 0.9
MUC1-222	ENST00000610468	ATRN	O75882	1429 aa		20.67	■□□□□ 0.9
MUC1-222	ENST00000610468	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	20.66	■□□□□ 0.9
MUC1-222	ENST00000610468	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		20.64	■□□□□ 0.89
MUC1-222	ENST00000610468	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	20.64	■□□□□ 0.89
MUC1-222	ENST00000610468	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		20.64	■□□□□ 0.89
MUC1-222	ENST00000610468	NUTM2F	A1L443	756 aa		20.63	■□□□□ 0.89
MUC1-222	ENST00000610468	RAB3GAP2	Q9H2M9	1393 aa		20.61	■□□□□ 0.89
MUC1-222	ENST00000610468	KIF1A	Q12756	1690 aa		20.61	■□□□□ 0.89
MUC1-222	ENST00000610468	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		20.61	■□□□□ 0.89
MUC1-222	ENST00000610468	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		20.61	■□□□□ 0.89
MUC1-222	ENST00000610468	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	20.6	■□□□□ 0.89
MUC1-222	ENST00000610468	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		20.6	■□□□□ 0.89
MUC1-222	ENST00000610468	DLC1	Q96QB1	1528 aa		20.58	■□□□□ 0.89
MUC1-222	ENST00000610468	ADGRB1	O14514	1584 aa		20.56	■□□□□ 0.88
MUC1-222	ENST00000610468	PRAM1	Q96QH2	718 aa		20.56	■□□□□ 0.88
MUC1-222	ENST00000610468	SLIT2	O94813	1529 aa		20.56	■□□□□ 0.88
MUC1-222	ENST00000610468	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		20.55	■□□□□ 0.88
MUC1-222	ENST00000610468	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		20.55	■□□□□ 0.88
MUC1-222	ENST00000610468	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		20.55	■□□□□ 0.88
MUC1-222	ENST00000610468	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	20.54	■□□□□ 0.88
MUC1-222	ENST00000610468	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		20.53	■□□□□ 0.88
MUC1-222	ENST00000610468	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	20.53	■□□□□ 0.88
MUC1-222	ENST00000610468	SBNO1	A3KN83	1393 aa		20.53	■□□□□ 0.88
MUC1-222	ENST00000610468	ADGRB2	O60241	1585 aa		20.53	■□□□□ 0.88
MUC1-222	ENST00000610468	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		20.52	■□□□□ 0.88
MUC1-222	ENST00000610468	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	20.52	■□□□□ 0.88
MUC1-222	ENST00000610468	USP32	Q8NFA0	1604 aa		20.52	■□□□□ 0.88
MUC1-222	ENST00000610468	PSME1	Q06323	249 aa		20.51	■□□□□ 0.87
MUC1-222	ENST00000610468	EP400	Q96L91	3159 aa		20.51	■□□□□ 0.87
MUC1-222	ENST00000610468	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		20.5	■□□□□ 0.87
MUC1-222	ENST00000610468	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	20.49	■□□□□ 0.87
MUC1-222	ENST00000610468	ARHGEF10	O15013	1369 aa		20.48	■□□□□ 0.87
MUC1-222	ENST00000610468	STAC3	Q96MF2	364 aa		20.48	■□□□□ 0.87
MUC1-222	ENST00000610468	POGK	Q9P215	609 aa		20.48	■□□□□ 0.87
MUC1-222	ENST00000610468	GLI3	P10071	1580 aa		20.47	■□□□□ 0.87
MUC1-222	ENST00000610468	HRC	P23327	699 aa		20.47	■□□□□ 0.87
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC125	Q86Z20	511 aa		20.46	■□□□□ 0.87
MUC1-222	ENST00000610468	SRCAP	Q6ZRS2	3230 aa		20.46	■□□□□ 0.87
MUC1-222	ENST00000610468	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		20.45	■□□□□ 0.86
MUC1-222	ENST00000610468	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		20.45	■□□□□ 0.86
MUC1-222	ENST00000610468	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	20.45	■□□□□ 0.86
MUC1-222	ENST00000610468	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	20.44	■□□□□ 0.86
MUC1-222	ENST00000610468	VPS72	Q15906	364 aa		20.43	■□□□□ 0.86
MUC1-222	ENST00000610468	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		20.43	■□□□□ 0.86
MUC1-222	ENST00000610468	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		20.43	■□□□□ 0.86
MUC1-222	ENST00000610468	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	20.42	■□□□□ 0.86
MUC1-222	ENST00000610468	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		20.42	■□□□□ 0.86
MUC1-222	ENST00000610468	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		20.42	■□□□□ 0.86
MUC1-222	ENST00000610468	ABCA3	Q99758	1704 aa		20.41	■□□□□ 0.86
MUC1-222	ENST00000610468	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	20.41	■□□□□ 0.86
MUC1-222	ENST00000610468	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		20.41	■□□□□ 0.86
MUC1-222	ENST00000610468	ONECUT3	O60422	494 aa	Predicted RBP	20.4	■□□□□ 0.86
MUC1-222	ENST00000610468	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	20.4	■□□□□ 0.86
MUC1-222	ENST00000610468	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	20.39	■□□□□ 0.86
MUC1-222	ENST00000610468	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		20.39	■□□□□ 0.86
MUC1-222	ENST00000610468	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	20.39	■□□□□ 0.85
MUC1-222	ENST00000610468	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		20.39	■□□□□ 0.85
MUC1-222	ENST00000610468	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	20.38	■□□□□ 0.85
MUC1-222	ENST00000610468	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		20.38	■□□□□ 0.85
MUC1-222	ENST00000610468	FAM83G	A6ND36	823 aa		20.38	■□□□□ 0.85
MUC1-222	ENST00000610468	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		20.38	■□□□□ 0.85
MUC1-222	ENST00000610468	ALS2	Q96Q42	1657 aa		20.36	■□□□□ 0.85
MUC1-222	ENST00000610468	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		20.36	■□□□□ 0.85
MUC1-222	ENST00000610468	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		20.35	■□□□□ 0.85
MUC1-222	ENST00000610468	ATP7B	P35670	1465 aa		20.35	■□□□□ 0.85
MUC1-222	ENST00000610468	PLEKHG5	O94827	1062 aa		20.33	■□□□□ 0.85
MUC1-222	ENST00000610468	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	20.32	■□□□□ 0.84
MUC1-222	ENST00000610468	NRAP	Q86VF7	1730 aa		20.31	■□□□□ 0.84
MUC1-222	ENST00000610468	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	20.3	■□□□□ 0.84
MUC1-222	ENST00000610468	BTG4	Q9NY30	223 aa		20.3	■□□□□ 0.84
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	20.3	■□□□□ 0.84
MUC1-222	ENST00000610468	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	20.29	■□□□□ 0.84

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