RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591945.1

CNP-209, Transcript of 2',3'-cyclic nucleotide 3' phosphodiesterase, human

TSL 3

Gene CNP, Length 576 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNP-209	ENST00000591945	POTEA	Q6S8J7	498 aa		33.61	■■■□□ 2.97
CNP-209	ENST00000591945	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	33.6	■■■□□ 2.97
CNP-209	ENST00000591945	ORAI2	Q96SN7	254 aa		33.6	■■■□□ 2.97
CNP-209	ENST00000591945	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
CNP-209	ENST00000591945	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
CNP-209	ENST00000591945	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	33.59	■■■□□ 2.97
CNP-209	ENST00000591945	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
CNP-209	ENST00000591945	LAMC1	P11047	1609 aa		33.59	■■■□□ 2.97
CNP-209	ENST00000591945	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		33.58	■■■□□ 2.97
CNP-209	ENST00000591945	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		33.57	■■■□□ 2.96
CNP-209	ENST00000591945	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
CNP-209	ENST00000591945	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		33.51	■■■□□ 2.96
CNP-209	ENST00000591945	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		33.51	■■■□□ 2.95
CNP-209	ENST00000591945	NUTM2F	A1L443	756 aa		33.5	■■■□□ 2.95
CNP-209	ENST00000591945	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		33.49	■■■□□ 2.95
CNP-209	ENST00000591945	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		33.48	■■■□□ 2.95
CNP-209	ENST00000591945	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
CNP-209	ENST00000591945	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	33.46	■■■□□ 2.95
CNP-209	ENST00000591945	SIRT1	Q96EB6	747 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CNP-209	ENST00000591945	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		33.44	■■■□□ 2.94
CNP-209	ENST00000591945	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	33.42	■■■□□ 2.94
CNP-209	ENST00000591945	PRAM1	Q96QH2	718 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CNP-209	ENST00000591945	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		33.42	■■■□□ 2.94
CNP-209	ENST00000591945	ADGRB1	O14514	1584 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CNP-209	ENST00000591945	FOXO3	O43524	673 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CNP-209	ENST00000591945	POGK	Q9P215	609 aa		33.39	■■■□□ 2.94
CNP-209	ENST00000591945	DLC1	Q96QB1	1528 aa		33.38	■■■□□ 2.93
CNP-209	ENST00000591945	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
CNP-209	ENST00000591945	C8orf37	Q96NL8	207 aa		33.38	■■■□□ 2.93
CNP-209	ENST00000591945	AFF2	P51816	1311 aa		33.37	■■■□□ 2.93
CNP-209	ENST00000591945	STAC3	Q96MF2	364 aa		33.36	■■■□□ 2.93
CNP-209	ENST00000591945	PXDN	Q92626	1479 aa		33.36	■■■□□ 2.93
CNP-209	ENST00000591945	ADAMTS2	O95450	1211 aa		33.35	■■■□□ 2.93
CNP-209	ENST00000591945	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		33.35	■■■□□ 2.93
CNP-209	ENST00000591945	KIF1A	Q12756	1690 aa		33.33	■■■□□ 2.93
CNP-209	ENST00000591945	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
CNP-209	ENST00000591945	RXRB	P28702	533 aa		33.27	■■■□□ 2.92
CNP-209	ENST00000591945	NGLY1	Q96IV0	654 aa		33.27	■■■□□ 2.92
CNP-209	ENST00000591945	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
CNP-209	ENST00000591945	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		33.25	■■■□□ 2.91
CNP-209	ENST00000591945	ADGRB2	O60241	1585 aa		33.25	■■■□□ 2.91
CNP-209	ENST00000591945	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
CNP-209	ENST00000591945	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	33.24	■■■□□ 2.91
CNP-209	ENST00000591945	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		33.2	■■■□□ 2.91
CNP-209	ENST00000591945	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		33.2	■■■□□ 2.91
CNP-209	ENST00000591945	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
CNP-209	ENST00000591945	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CNP-209	ENST00000591945	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
CNP-209	ENST00000591945	USP32	Q8NFA0	1604 aa		33.17	■■■□□ 2.9
CNP-209	ENST00000591945	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
CNP-209	ENST00000591945	PSME1	Q06323	249 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CNP-209	ENST00000591945	USP21	Q9UK80	565 aa		33.15	■■■□□ 2.9
CNP-209	ENST00000591945	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
CNP-209	ENST00000591945	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		33.14	■■■□□ 2.9
CNP-209	ENST00000591945	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		33.13	■■■□□ 2.89
CNP-209	ENST00000591945	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		33.12	■■■□□ 2.89
CNP-209	ENST00000591945	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
CNP-209	ENST00000591945	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		33.11	■■■□□ 2.89
CNP-209	ENST00000591945	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
CNP-209	ENST00000591945	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		33.09	■■■□□ 2.89
CNP-209	ENST00000591945	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
CNP-209	ENST00000591945	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CNP-209	ENST00000591945	PLEKHG5	O94827	1062 aa		33.08	■■■□□ 2.89
CNP-209	ENST00000591945	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
CNP-209	ENST00000591945	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
CNP-209	ENST00000591945	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
CNP-209	ENST00000591945	RGS12	O14924	1447 aa		33.07	■■■□□ 2.88
CNP-209	ENST00000591945	SBNO1	A3KN83	1393 aa		33.07	■■■□□ 2.88
CNP-209	ENST00000591945	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CNP-209	ENST00000591945	ARHGEF10	O15013	1369 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CNP-209	ENST00000591945	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		33.03	■■■□□ 2.88
CNP-209	ENST00000591945	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		33.03	■■■□□ 2.88
CNP-209	ENST00000591945	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		33.01	■■■□□ 2.87
CNP-209	ENST00000591945	ATRN	O75882	1429 aa		33.01	■■■□□ 2.87
CNP-209	ENST00000591945	NEUROD1	Q13562	356 aa		33	■■■□□ 2.87
CNP-209	ENST00000591945	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		33	■■■□□ 2.87
CNP-209	ENST00000591945	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	32.99	■■■□□ 2.87
CNP-209	ENST00000591945	ATP7B	P35670	1465 aa		32.99	■■■□□ 2.87
CNP-209	ENST00000591945	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		32.99	■■■□□ 2.87
CNP-209	ENST00000591945	ITSN1	Q15811	1721 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CNP-209	ENST00000591945	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	32.96	■■■□□ 2.87
CNP-209	ENST00000591945	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
CNP-209	ENST00000591945	CDK19	Q9BWU1	502 aa		32.96	■■■□□ 2.87
CNP-209	ENST00000591945	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	32.96	■■■□□ 2.87
CNP-209	ENST00000591945	ABCA3	Q99758	1704 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CNP-209	ENST00000591945	SLIT2	O94813	1529 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CNP-209	ENST00000591945	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
CNP-209	ENST00000591945	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	32.91	■■■□□ 2.86
CNP-209	ENST00000591945	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		32.9	■■■□□ 2.86
CNP-209	ENST00000591945	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
CNP-209	ENST00000591945	ALS2	Q96Q42	1657 aa		32.89	■■■□□ 2.86
CNP-209	ENST00000591945	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	32.87	■■■□□ 2.85
CNP-209	ENST00000591945	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		32.85	■■■□□ 2.85
CNP-209	ENST00000591945	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		32.85	■■■□□ 2.85
CNP-209	ENST00000591945	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		32.85	■■■□□ 2.85
CNP-209	ENST00000591945	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		32.85	■■■□□ 2.85
CNP-209	ENST00000591945	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	32.84	■■■□□ 2.85
CNP-209	ENST00000591945	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CNP-209	ENST00000591945	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	32.83	■■■□□ 2.85
CNP-209	ENST00000591945	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		32.83	■■■□□ 2.85

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 149.7 ms