RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591848.1

AFG3L2-204, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene AFG3L2, Length 446 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2-204ENST00000591848 LRP6O75581 1613 aa25.39■■□□□ 1.66
AFG3L2-204ENST00000591848 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
AFG3L2-204ENST00000591848 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.37■■□□□ 1.65
AFG3L2-204ENST00000591848 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.36■■□□□ 1.65
AFG3L2-204ENST00000591848 TECPR2O15040 1411 aa25.36■■□□□ 1.65
AFG3L2-204ENST00000591848 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
AFG3L2-204ENST00000591848 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
AFG3L2-204ENST00000591848 SIRT1Q96EB6 747 aa25.34■■□□□ 1.65
AFG3L2-204ENST00000591848 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.64
AFG3L2-204ENST00000591848 PNPLA6Q8IY17 1366 aa25.32■■□□□ 1.64
AFG3L2-204ENST00000591848 MYOM2P54296 1465 aa25.32■■□□□ 1.64
AFG3L2-204ENST00000591848 NUTM2FA1L443 756 aa25.31■■□□□ 1.64
AFG3L2-204ENST00000591848 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.31■■□□□ 1.64
AFG3L2-204ENST00000591848 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa25.31■■□□□ 1.64
AFG3L2-204ENST00000591848 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.3■■□□□ 1.64
AFG3L2-204ENST00000591848 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.3■■□□□ 1.64
AFG3L2-204ENST00000591848 KNDC1Q76NI1 1749 aa25.29■■□□□ 1.64
AFG3L2-204ENST00000591848 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.29■■□□□ 1.64
AFG3L2-204ENST00000591848 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.29■■□□□ 1.64
AFG3L2-204ENST00000591848 LAMC1P11047 1609 aa25.27■■□□□ 1.64
AFG3L2-204ENST00000591848 FOXO3O43524 673 aa25.27■■□□□ 1.64
AFG3L2-204ENST00000591848 STAC3Q96MF2 364 aa25.27■■□□□ 1.64
AFG3L2-204ENST00000591848 C8orf37Q96NL8 207 aa25.27■■□□□ 1.64
AFG3L2-204ENST00000591848 AFF2P51816 1311 aa25.27■■□□□ 1.64
AFG3L2-204ENST00000591848 RXRBP28702 533 aa25.26■■□□□ 1.63
AFG3L2-204ENST00000591848 POGKQ9P215 609 aa25.26■■□□□ 1.63
AFG3L2-204ENST00000591848 ADAMTS2O95450 1211 aa25.25■■□□□ 1.63
AFG3L2-204ENST00000591848 NGLY1Q96IV0 654 aa25.24■■□□□ 1.63
AFG3L2-204ENST00000591848 PRAM1Q96QH2 718 aa25.24■■□□□ 1.63
AFG3L2-204ENST00000591848 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
AFG3L2-204ENST00000591848 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
AFG3L2-204ENST00000591848 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
AFG3L2-204ENST00000591848 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.18■■□□□ 1.62
AFG3L2-204ENST00000591848 FMN2Q9NZ56 1722 aa25.17■■□□□ 1.62
AFG3L2-204ENST00000591848 PHF8Q9UPP1 1060 aa25.16■■□□□ 1.62
AFG3L2-204ENST00000591848 PXDNQ92626 1479 aa25.15■■□□□ 1.62
AFG3L2-204ENST00000591848 KRT28Q7Z3Y7 464 aa25.15■■□□□ 1.62
AFG3L2-204ENST00000591848 DLC1Q96QB1 1528 aa25.14■■□□□ 1.62
AFG3L2-204ENST00000591848 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
AFG3L2-204ENST00000591848 PSME1Q06323 249 aa25.13■■□□□ 1.61
AFG3L2-204ENST00000591848 USP21Q9UK80 565 aa25.13■■□□□ 1.61
AFG3L2-204ENST00000591848 KIF1AQ12756 1690 aa25.11■■□□□ 1.61
AFG3L2-204ENST00000591848 ADGRB1O14514 1584 aa25.1■■□□□ 1.61
AFG3L2-204ENST00000591848 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
AFG3L2-204ENST00000591848 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.1■■□□□ 1.61
AFG3L2-204ENST00000591848 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
AFG3L2-204ENST00000591848 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
AFG3L2-204ENST00000591848 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
AFG3L2-204ENST00000591848 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
AFG3L2-204ENST00000591848 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
AFG3L2-204ENST00000591848 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
AFG3L2-204ENST00000591848 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.06■■□□□ 1.6
AFG3L2-204ENST00000591848 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
AFG3L2-204ENST00000591848 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
AFG3L2-204ENST00000591848 ANKARQ7Z5J8 1434 aa25.04■■□□□ 1.6
AFG3L2-204ENST00000591848 LMOD2Q6P5Q4 547 aa25.04■■□□□ 1.6
AFG3L2-204ENST00000591848 WASLO00401 505 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
AFG3L2-204ENST00000591848 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
AFG3L2-204ENST00000591848 ADGRB2O60241 1585 aa25.01■■□□□ 1.59
AFG3L2-204ENST00000591848 SBNO1A3KN83 1393 aa25■■□□□ 1.59
AFG3L2-204ENST00000591848 PLEKHG5O94827 1062 aa24.99■■□□□ 1.59
AFG3L2-204ENST00000591848 TNS3Q68CZ2 1445 aa24.99■■□□□ 1.59
AFG3L2-204ENST00000591848 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
AFG3L2-204ENST00000591848 RGS12O14924 1447 aa24.97■■□□□ 1.59
AFG3L2-204ENST00000591848 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.97■■□□□ 1.59
AFG3L2-204ENST00000591848 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
AFG3L2-204ENST00000591848 ARHGEF10O15013 1369 aa24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2-204ENST00000591848 CABLES1Q8TDN4 633 aa24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2-204ENST00000591848 USP32Q8NFA0 1604 aa24.96■■□□□ 1.59
AFG3L2-204ENST00000591848 ATRNO75882 1429 aa24.95■■□□□ 1.59
AFG3L2-204ENST00000591848 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.95■■□□□ 1.58
AFG3L2-204ENST00000591848 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.94■■□□□ 1.58
AFG3L2-204ENST00000591848 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.94■■□□□ 1.58
AFG3L2-204ENST00000591848 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.94■■□□□ 1.58
AFG3L2-204ENST00000591848 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.93■■□□□ 1.58
AFG3L2-204ENST00000591848 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
AFG3L2-204ENST00000591848 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.92■■□□□ 1.58
AFG3L2-204ENST00000591848 CDK19Q9BWU1 502 aa24.92■■□□□ 1.58
AFG3L2-204ENST00000591848 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
AFG3L2-204ENST00000591848 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.92■■□□□ 1.58
AFG3L2-204ENST00000591848 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
AFG3L2-204ENST00000591848 NEUROD1Q13562 356 aa24.89■■□□□ 1.58
AFG3L2-204ENST00000591848 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.89■■□□□ 1.58
AFG3L2-204ENST00000591848 SIN3AQ96ST3 1273 aa24.89■■□□□ 1.58
AFG3L2-204ENST00000591848 SLIT2O94813 1529 aa24.86■■□□□ 1.57
AFG3L2-204ENST00000591848 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.86■■□□□ 1.57
AFG3L2-204ENST00000591848 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
AFG3L2-204ENST00000591848 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.84■■□□□ 1.57
AFG3L2-204ENST00000591848 FAM83GA6ND36 823 aa24.83■■□□□ 1.57
AFG3L2-204ENST00000591848 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
AFG3L2-204ENST00000591848 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.56
AFG3L2-204ENST00000591848 ITSN1Q15811 1721 aa24.82■■□□□ 1.56
AFG3L2-204ENST00000591848 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
AFG3L2-204ENST00000591848 ATP7BP35670 1465 aa24.82■■□□□ 1.56
AFG3L2-204ENST00000591848 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
AFG3L2-204ENST00000591848 VPS72Q15906 364 aa24.81■■□□□ 1.56
AFG3L2-204ENST00000591848 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2-204ENST00000591848 ACEP12821 1306 aa24.79■■□□□ 1.56
AFG3L2-204ENST00000591848 PLEKHG3A1L390 1219 aa24.78■■□□□ 1.56
AFG3L2-204ENST00000591848 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.8 ms