RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587269.5

SMAD2-208, Transcript of SMAD family member 2, human

TSL 3

Gene SMAD2, Length 1,042 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD2-208	ENST00000587269	LRP6	O75581	1613 aa		43.3	■■■■■ 4.52
SMAD2-208	ENST00000587269	C14orf93	Q9H972	538 aa	Known RBP	43.29	■■■■■ 4.52
SMAD2-208	ENST00000587269	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		43.28	■■■■■ 4.52
SMAD2-208	ENST00000587269	TECPR2	O15040	1411 aa		43.25	■■■■■ 4.51
SMAD2-208	ENST00000587269	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	43.25	■■■■■ 4.51
SMAD2-208	ENST00000587269	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	43.24	■■■■■ 4.51
SMAD2-208	ENST00000587269	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		43.24	■■■■■ 4.51
SMAD2-208	ENST00000587269	MYOM2	P54296	1465 aa		43.2	■■■■■ 4.51
SMAD2-208	ENST00000587269	NUTM2F	A1L443	756 aa		43.19	■■■■■ 4.5
SMAD2-208	ENST00000587269	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		43.18	■■■■■ 4.5
SMAD2-208	ENST00000587269	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		43.18	■■■■■ 4.5
SMAD2-208	ENST00000587269	SIRT1	Q96EB6	747 aa		43.18	■■■■■ 4.5
SMAD2-208	ENST00000587269	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		43.17	■■■■■ 4.5
SMAD2-208	ENST00000587269	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	43.17	■■■■■ 4.5
SMAD2-208	ENST00000587269	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		43.16	■■■■■ 4.5
SMAD2-208	ENST00000587269	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		43.15	■■■■■ 4.5
SMAD2-208	ENST00000587269	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		43.15	■■■■■ 4.5
SMAD2-208	ENST00000587269	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		43.14	■■■■■ 4.5
SMAD2-208	ENST00000587269	NRXN1	Q9ULB1	1477 aa		43.13	■■■■■ 4.5
SMAD2-208	ENST00000587269	C8orf37	Q96NL8	207 aa		43.13	■■■■■ 4.49
SMAD2-208	ENST00000587269	LAMC1	P11047	1609 aa		43.12	■■■■■ 4.49
SMAD2-208	ENST00000587269	AFF2	P51816	1311 aa		43.11	■■■■■ 4.49
SMAD2-208	ENST00000587269	POGK	Q9P215	609 aa		43.1	■■■■■ 4.49
SMAD2-208	ENST00000587269	FOXO3	O43524	673 aa		43.09	■■■■■ 4.49
SMAD2-208	ENST00000587269	ADAMTS2	O95450	1211 aa		43.08	■■■■■ 4.49
SMAD2-208	ENST00000587269	RXRB	P28702	533 aa		43.08	■■■■■ 4.49
SMAD2-208	ENST00000587269	STAC3	Q96MF2	364 aa		43.08	■■■■■ 4.49
SMAD2-208	ENST00000587269	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	43.06	■■■■■ 4.48
SMAD2-208	ENST00000587269	NGLY1	Q96IV0	654 aa		43.05	■■■■■ 4.48
SMAD2-208	ENST00000587269	PRAM1	Q96QH2	718 aa		43.05	■■■■■ 4.48
SMAD2-208	ENST00000587269	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	43.02	■■■■■ 4.48
SMAD2-208	ENST00000587269	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		42.97	■■■■■ 4.47
SMAD2-208	ENST00000587269	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	42.96	■■■■■ 4.47
SMAD2-208	ENST00000587269	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		42.94	■■■■■ 4.46
SMAD2-208	ENST00000587269	PXDN	Q92626	1479 aa		42.9	■■■■■ 4.46
SMAD2-208	ENST00000587269	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		42.9	■■■■■ 4.46
SMAD2-208	ENST00000587269	DLC1	Q96QB1	1528 aa		42.89	■■■■■ 4.46
SMAD2-208	ENST00000587269	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		42.88	■■■■■ 4.45
SMAD2-208	ENST00000587269	PSME1	Q06323	249 aa		42.87	■■■■■ 4.45
SMAD2-208	ENST00000587269	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	42.86	■■■■■ 4.45
SMAD2-208	ENST00000587269	KIF1A	Q12756	1690 aa		42.86	■■■■■ 4.45
SMAD2-208	ENST00000587269	USP21	Q9UK80	565 aa		42.85	■■■■■ 4.45
SMAD2-208	ENST00000587269	ADGRB1	O14514	1584 aa		42.82	■■■■■ 4.45
SMAD2-208	ENST00000587269	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	42.82	■■■■■ 4.45
SMAD2-208	ENST00000587269	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	42.81	■■■■■ 4.44
SMAD2-208	ENST00000587269	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	42.81	■■■■■ 4.44
SMAD2-208	ENST00000587269	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		42.79	■■■■■ 4.44
SMAD2-208	ENST00000587269	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	42.78	■■■■■ 4.44
SMAD2-208	ENST00000587269	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	42.78	■■■■■ 4.44
SMAD2-208	ENST00000587269	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	42.77	■■■■■ 4.44
SMAD2-208	ENST00000587269	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	42.77	■■■■■ 4.44
SMAD2-208	ENST00000587269	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		42.76	■■■■■ 4.44
SMAD2-208	ENST00000587269	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	42.76	■■■■■ 4.44
SMAD2-208	ENST00000587269	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	42.75	■■■■■ 4.43
SMAD2-208	ENST00000587269	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		42.74	■■■■■ 4.43
SMAD2-208	ENST00000587269	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		42.72	■■■■■ 4.43
SMAD2-208	ENST00000587269	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	42.69	■■■■■ 4.42
SMAD2-208	ENST00000587269	PLEKHG5	O94827	1062 aa		42.68	■■■■■ 4.42
SMAD2-208	ENST00000587269	ADGRB2	O60241	1585 aa		42.66	■■■■■ 4.42
SMAD2-208	ENST00000587269	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	42.66	■■■■■ 4.42
SMAD2-208	ENST00000587269	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		42.65	■■■■■ 4.42
SMAD2-208	ENST00000587269	SBNO1	A3KN83	1393 aa		42.63	■■■■■ 4.41
SMAD2-208	ENST00000587269	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		42.63	■■■■■ 4.41
SMAD2-208	ENST00000587269	ARHGEF10	O15013	1369 aa		42.61	■■■■■ 4.41
SMAD2-208	ENST00000587269	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	42.6	■■■■■ 4.41
SMAD2-208	ENST00000587269	RGS12	O14924	1447 aa		42.6	■■■■■ 4.41
SMAD2-208	ENST00000587269	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	42.59	■■■■■ 4.41
SMAD2-208	ENST00000587269	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		42.56	■■■■■ 4.4
SMAD2-208	ENST00000587269	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		42.56	■■■■■ 4.4
SMAD2-208	ENST00000587269	USP32	Q8NFA0	1604 aa		42.56	■■■■■ 4.4
SMAD2-208	ENST00000587269	ATRN	O75882	1429 aa		42.55	■■■■■ 4.4
SMAD2-208	ENST00000587269	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		42.53	■■■■■ 4.4
SMAD2-208	ENST00000587269	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	42.52	■■■■■ 4.4
SMAD2-208	ENST00000587269	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		42.52	■■■■■ 4.4
SMAD2-208	ENST00000587269	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		42.51	■■■■■ 4.4
SMAD2-208	ENST00000587269	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		42.51	■■■■■ 4.4
SMAD2-208	ENST00000587269	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	42.51	■■■■■ 4.4
SMAD2-208	ENST00000587269	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		42.51	■■■■■ 4.4
SMAD2-208	ENST00000587269	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	42.5	■■■■■ 4.39
SMAD2-208	ENST00000587269	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	42.49	■■■■■ 4.39
SMAD2-208	ENST00000587269	CDK19	Q9BWU1	502 aa		42.49	■■■■■ 4.39
SMAD2-208	ENST00000587269	NEUROD1	Q13562	356 aa		42.48	■■■■■ 4.39
SMAD2-208	ENST00000587269	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		42.46	■■■■■ 4.39
SMAD2-208	ENST00000587269	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		42.44	■■■■■ 4.38
SMAD2-208	ENST00000587269	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		42.42	■■■■■ 4.38
SMAD2-208	ENST00000587269	SLIT2	O94813	1529 aa		42.41	■■■■■ 4.38
SMAD2-208	ENST00000587269	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	42.4	■■■■■ 4.38
SMAD2-208	ENST00000587269	ITSN1	Q15811	1721 aa		42.37	■■■■■ 4.37
SMAD2-208	ENST00000587269	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		42.37	■■■■■ 4.37
SMAD2-208	ENST00000587269	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	42.37	■■■■■ 4.37
SMAD2-208	ENST00000587269	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	42.35	■■■■■ 4.37
SMAD2-208	ENST00000587269	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
SMAD2-208	ENST00000587269	ATP7B	P35670	1465 aa		42.34	■■■■■ 4.37
SMAD2-208	ENST00000587269	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	42.33	■■■■■ 4.37
SMAD2-208	ENST00000587269	FAM83G	A6ND36	823 aa		42.32	■■■■■ 4.37
SMAD2-208	ENST00000587269	VPS72	Q15906	364 aa		42.3	■■■■■ 4.36
SMAD2-208	ENST00000587269	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		42.3	■■■■■ 4.36
SMAD2-208	ENST00000587269	ACE	P12821	1306 aa		42.28	■■■■■ 4.36
SMAD2-208	ENST00000587269	ABCA3	Q99758	1704 aa		42.27	■■■■■ 4.36
SMAD2-208	ENST00000587269	ALS2	Q96Q42	1657 aa		42.26	■■■■■ 4.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms