RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRM-211ENST00000580170 IFT57Q9NWB7 429 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa25.81■■□□□ 1.72
PTPRM-211ENST00000580170 KIF21BO75037 1637 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRM-211ENST00000580170 ERICH2A1L162 156 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRM-211ENST00000580170 MRE11P49959 708 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRM-211ENST00000580170 PSME1Q06323 249 aa25.79■■□□□ 1.72
PTPRM-211ENST00000580170 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
PTPRM-211ENST00000580170 VPS37DQ86XT2 251 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.78■■□□□ 1.72
PTPRM-211ENST00000580170 NASPP49321 788 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
PTPRM-211ENST00000580170 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRM-211ENST00000580170 CABP2Q9NPB3 220 aa25.77■■□□□ 1.72
PTPRM-211ENST00000580170 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.76■■□□□ 1.72
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.76■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.76■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 IGF1RP08069 1367 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 NINLQ9Y2I6 1382 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.75■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 STAC3Q96MF2 364 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 PRDM2Q13029 1718 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 RIC3Q7Z5B4 369 aa25.74■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 IL27Q8NEV9 243 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 WWC1Q8IX03 1113 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 TRAK2O60296 914 aa25.73■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC66A2RUB6 948 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 MNS1Q8NEH6 495 aa25.72■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 MTHFSP49914 203 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 CNTROBQ8N137 903 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 RNF214Q8ND24 703 aa25.71■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.7■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.7■■□□□ 1.71
PTPRM-211ENST00000580170 WASHC4Q2M389 1173 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 PPP2R1AP30153 589 aa25.7■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 PSMA5P28066 241 aa25.69■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 NCOA2Q15596 1464 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC27Q2M243 656 aa25.68■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 MSH5O43196 834 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 OLFM4Q6UX06 510 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.67■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 ACBD3Q9H3P7 528 aa25.66■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 FSD1Q9BTV5 496 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.65■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
PTPRM-211ENST00000580170 PDILTQ8N807 584 aa25.64■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 RUFY1Q96T51 708 aa25.64■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 HSP90B2PQ58FF3 399 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 NUTM2GQ5VZR2 741 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.63■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 SDF4Q9BRK5 362 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 AK7Q96M32 723 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 TSPY26PQ9H489 355 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 NEK4P51957 841 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 RBM10P98175 930 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.62■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 GNAI3P08754 354 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.61■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 KDM4AO75164 1064 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 AKNAQ7Z591 1439 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 FYB1O15117 783 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 MBD3O95983 291 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 RABEP1Q15276 862 aa25.6■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM5Q9C035 493 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 GCC1Q96CN9 775 aa25.59■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 PRKAR2BP31323 418 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 PDE3AQ14432 1141 aa25.58■■□□□ 1.69
PTPRM-211ENST00000580170 BCAR3O75815 825 aa25.58■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 MCM2P49736 904 aa25.57■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.56■■□□□ 1.68
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
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