RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574899.1

PHF23-211, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 3

Gene PHF23, Length 370 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-211ENST00000574899 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
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PHF23-211ENST00000574899 LAMC1P11047 1609 aa34.26■■■■□ 3.07
PHF23-211ENST00000574899 CFAP70Q5T0N1 1121 aa34.25■■■■□ 3.07
PHF23-211ENST00000574899 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa34.24■■■■□ 3.07
PHF23-211ENST00000574899 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.16■■■■□ 3.06
PHF23-211ENST00000574899 PNPLA6Q8IY17 1366 aa34.14■■■■□ 3.06
PHF23-211ENST00000574899 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
PHF23-211ENST00000574899 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
PHF23-211ENST00000574899 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
PHF23-211ENST00000574899 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
PHF23-211ENST00000574899 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.13■■■■□ 3.05
PHF23-211ENST00000574899 ADGRB1O14514 1584 aa34.13■■■■□ 3.05
PHF23-211ENST00000574899 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
PHF23-211ENST00000574899 NUTM2FA1L443 756 aa34.11■■■■□ 3.05
PHF23-211ENST00000574899 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
PHF23-211ENST00000574899 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.11■■■■□ 3.05
PHF23-211ENST00000574899 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
PHF23-211ENST00000574899 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
PHF23-211ENST00000574899 SIRT1Q96EB6 747 aa34.09■■■■□ 3.05
PHF23-211ENST00000574899 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.08■■■■□ 3.05
PHF23-211ENST00000574899 DLC1Q96QB1 1528 aa34.05■■■■□ 3.04
PHF23-211ENST00000574899 PXDNQ92626 1479 aa34.03■■■■□ 3.04
PHF23-211ENST00000574899 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.03■■■■□ 3.04
PHF23-211ENST00000574899 PRAM1Q96QH2 718 aa34.03■■■■□ 3.04
PHF23-211ENST00000574899 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
PHF23-211ENST00000574899 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
PHF23-211ENST00000574899 FOXO3O43524 673 aa33.98■■■■□ 3.03
PHF23-211ENST00000574899 TRAK1Q9UPV9 953 aa33.97■■■■□ 3.03
PHF23-211ENST00000574899 NPHP3Q7Z494 1330 aa33.97■■■■□ 3.03
PHF23-211ENST00000574899 KIF1AQ12756 1690 aa33.96■■■■□ 3.03
PHF23-211ENST00000574899 USP32Q8NFA0 1604 aa33.95■■■■□ 3.03
PHF23-211ENST00000574899 AFF2P51816 1311 aa33.95■■■■□ 3.03
PHF23-211ENST00000574899 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
PHF23-211ENST00000574899 ADGRB2O60241 1585 aa33.94■■■■□ 3.02
PHF23-211ENST00000574899 POGKQ9P215 609 aa33.93■■■■□ 3.02
PHF23-211ENST00000574899 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP33.93■■■■□ 3.02
PHF23-211ENST00000574899 STAC3Q96MF2 364 aa33.92■■■■□ 3.02
PHF23-211ENST00000574899 C8orf37Q96NL8 207 aa33.91■■■■□ 3.02
PHF23-211ENST00000574899 ADAMTS2O95450 1211 aa33.9■■■■□ 3.02
PHF23-211ENST00000574899 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP33.87■■■■□ 3.01
PHF23-211ENST00000574899 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
PHF23-211ENST00000574899 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa33.85■■■■□ 3.01
PHF23-211ENST00000574899 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP33.84■■■■□ 3.01
PHF23-211ENST00000574899 PHF8Q9UPP1 1060 aa33.84■■■■□ 3.01
PHF23-211ENST00000574899 KRT28Q7Z3Y7 464 aa33.8■■■■□ 3
PHF23-211ENST00000574899 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa33.79■■■■□ 3
PHF23-211ENST00000574899 ANKARQ7Z5J8 1434 aa33.79■■■■□ 3
PHF23-211ENST00000574899 NGLY1Q96IV0 654 aa33.79■■■■□ 3
PHF23-211ENST00000574899 PRR36Q9H6K5 1346 aa33.79■■■■□ 3
PHF23-211ENST00000574899 RXRBP28702 533 aa33.78■■■■□ 3
PHF23-211ENST00000574899 SIN3AQ96ST3 1273 aa33.77■■■■□ 3
PHF23-211ENST00000574899 TULP4Q9NRJ4 1543 aa33.76■■■■□ 3
PHF23-211ENST00000574899 NBPF1Q3BBV0 1214 aa33.76■■■□□ 2.99
PHF23-211ENST00000574899 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa33.76■■■□□ 2.99
PHF23-211ENST00000574899 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
PHF23-211ENST00000574899 WASLO00401 505 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
PHF23-211ENST00000574899 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
PHF23-211ENST00000574899 TNS3Q68CZ2 1445 aa33.71■■■□□ 2.99
PHF23-211ENST00000574899 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
PHF23-211ENST00000574899 L3MBTL2Q969R5 705 aa33.7■■■□□ 2.99
PHF23-211ENST00000574899 ABCA3Q99758 1704 aa33.7■■■□□ 2.98
PHF23-211ENST00000574899 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
PHF23-211ENST00000574899 USP21Q9UK80 565 aa33.68■■■□□ 2.98
PHF23-211ENST00000574899 RGS12O14924 1447 aa33.68■■■□□ 2.98
PHF23-211ENST00000574899 SBNO1A3KN83 1393 aa33.67■■■□□ 2.98
PHF23-211ENST00000574899 PSME1Q06323 249 aa33.66■■■□□ 2.98
PHF23-211ENST00000574899 ATP7BP35670 1465 aa33.65■■■□□ 2.98
PHF23-211ENST00000574899 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
PHF23-211ENST00000574899 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP33.65■■■□□ 2.98
PHF23-211ENST00000574899 ITSN1Q15811 1721 aa33.65■■■□□ 2.98
PHF23-211ENST00000574899 BCL9LQ86UU0 1499 aa33.64■■■□□ 2.98
PHF23-211ENST00000574899 CABLES1Q8TDN4 633 aa33.64■■■□□ 2.98
PHF23-211ENST00000574899 ALS2Q96Q42 1657 aa33.64■■■□□ 2.98
PHF23-211ENST00000574899 ATRNO75882 1429 aa33.63■■■□□ 2.97
PHF23-211ENST00000574899 PLEKHG5O94827 1062 aa33.63■■■□□ 2.97
PHF23-211ENST00000574899 NEUROD1Q13562 356 aa33.63■■■□□ 2.97
PHF23-211ENST00000574899 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa33.61■■■□□ 2.97
PHF23-211ENST00000574899 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa33.6■■■□□ 2.97
PHF23-211ENST00000574899 LMOD2Q6P5Q4 547 aa33.59■■■□□ 2.97
PHF23-211ENST00000574899 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
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PHF23-211ENST00000574899 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP33.58■■■□□ 2.97
PHF23-211ENST00000574899 CDK19Q9BWU1 502 aa33.58■■■□□ 2.97
PHF23-211ENST00000574899 QRICH2Q9H0J4 1663 aa33.56■■■□□ 2.96
PHF23-211ENST00000574899 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP33.56■■■□□ 2.96
PHF23-211ENST00000574899 SLIT2O94813 1529 aa33.56■■■□□ 2.96
PHF23-211ENST00000574899 ARHGEF10O15013 1369 aa33.56■■■□□ 2.96
PHF23-211ENST00000574899 PLCH1Q4KWH8 1693 aa33.55■■■□□ 2.96
PHF23-211ENST00000574899 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa33.54■■■□□ 2.96
PHF23-211ENST00000574899 GPRASP1Q5JY77 1395 aa33.53■■■□□ 2.96
PHF23-211ENST00000574899 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP33.52■■■□□ 2.96
PHF23-211ENST00000574899 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP33.5■■■□□ 2.95
PHF23-211ENST00000574899 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP33.49■■■□□ 2.95
PHF23-211ENST00000574899 GLI3P10071 1580 aa33.48■■■□□ 2.95
PHF23-211ENST00000574899 UNC5CLQ8IV45 518 aa33.47■■■□□ 2.95
PHF23-211ENST00000574899 NWD2Q9ULI1 1742 aa33.47■■■□□ 2.95
PHF23-211ENST00000574899 NBPF8Q3BBV2 869 aa33.45■■■□□ 2.95
PHF23-211ENST00000574899 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
PHF23-211ENST00000574899 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
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