RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561726.1

TNRC6A-208, Transcript of trinucleotide repeat containing 6A, humanhuman

TSL 4

Gene TNRC6A, Length 543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6A-208ENST00000561726 PRR20EP86478 221 aa6.54□□□□□ -1.36
TNRC6A-208ENST00000561726 PRR20CP86479 221 aa6.54□□□□□ -1.36
TNRC6A-208ENST00000561726 PRR20DP86480 221 aa6.54□□□□□ -1.36
TNRC6A-208ENST00000561726 PRR20BP86481 221 aa6.54□□□□□ -1.36
TNRC6A-208ENST00000561726 PRR20AP86496 221 aa6.54□□□□□ -1.36
TNRC6A-208ENST00000561726 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
TNRC6A-208ENST00000561726 AMHR2Q16671 573 aa6.54□□□□□ -1.36
TNRC6A-208ENST00000561726 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.54□□□□□ -1.36
TNRC6A-208ENST00000561726 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TNRC6A-208ENST00000561726 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
TNRC6A-208ENST00000561726 RPIAP49247 311 aa6.53□□□□□ -1.36
TNRC6A-208ENST00000561726 FOXC1Q12948 553 aa6.53□□□□□ -1.36
TNRC6A-208ENST00000561726 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TNRC6A-208ENST00000561726 PKD2L1Q9P0L9 805 aa6.53□□□□□ -1.36
TNRC6A-208ENST00000561726 MMP16P51512 607 aa6.52□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 TRIM66O15016 1216 aa6.51□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 SPIRE2Q8WWL2 714 aa6.51□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 PCDHGC3Q9UN70 934 aa6.51□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 FAM187AA6NFU0 413 aa6.5□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 FDX1P10109 184 aa6.5□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 NDUFV2P19404 249 aa6.5□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 PKDCCQ504Y2 493 aa6.5□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.5□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 AK7Q96M32 723 aa6.5□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 MOXD2PA6NHM9 499 aa6.49□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 DGAT1O75907 488 aa6.49□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 CCDC24Q8N4L8 307 aa6.49□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.49□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 C6orf229H3BNL8 230 aa6.48□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 MS4A1P11836 297 aa6.48□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 MYT1Q01538 1121 aa6.48□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 JUNDP17535 347 aa6.47□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 TRIM32Q13049 653 aa6.47□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 RETREG3Q86VR2 466 aa6.47□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 BCANQ96GW7 911 aa6.47□□□□□ -1.37
TNRC6A-208ENST00000561726 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.46□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.46□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 TOR4AQ9NXH8 423 aa6.46□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 PDE4DQ08499 809 aa6.45□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 CYP4X1Q8N118 509 aa6.45□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 ZNF787Q6DD87 383 aa6.44□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 ARXQ96QS3 562 aa6.44□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.44□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 WNT7AO00755 349 aa6.43□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 ST8SIA5O15466 376 aa6.43□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 MRGPRX2Q96LB1 330 aa6.43□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa6.43□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 SKOR1P84550 965 aa6.42□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 MTMR2Q13614 643 aa6.42□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 PRR7Q8TB68 274 aa6.42□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 AAASQ9NRG9 546 aa6.42□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 POTECB2RU33 542 aa6.41□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.41□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 J3QL48 77 aa6.4□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 SPTLC1O15269 473 aa6.4□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.4□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 SMPD1P17405 629 aa6.4□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 GJA5P36382 358 aa6.4□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 RIC3Q7Z5B4 369 aa6.4□□□□□ -1.38
TNRC6A-208ENST00000561726 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.39□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 AVPP01185 164 aa6.39□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 WNT7BP56706 349 aa6.39□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 PTPRNQ16849 979 aa6.39□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa6.39□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.39□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 DACH1Q9UI36 760 aa6.39□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 CFAP99D6REC4 459 aa6.38□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 HRCP23327 699 aa6.38□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 MYSM1Q5VVJ2 828 aa6.38□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 CRIPAKQ8N1N5 446 aa6.38□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 CABLES1Q8TDN4 633 aa6.38□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 LIMD1Q9UGP4 676 aa6.38□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 AXIN1O15169 862 aa6.37□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 KCNH2Q12809 1159 aa6.37□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 DESI1Q6ICB0 168 aa6.37□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.37□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.37□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa6.37□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 SH3BP2P78314 561 aa6.36□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 LINC01559Q495D7 138 aa6.36□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 BAP1Q92560 729 aa6.36□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 SIAH2O43255 324 aa6.35□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 QPCTQ16769 361 aa6.35□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 CTC1Q2NKJ3 1217 aa6.35□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.35□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 LYPD8Q6UX82 237 aa6.35□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.35□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 HPS1Q92902 700 aa6.35□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 ALDH1A1P00352 501 aa6.34□□□□□ -1.39
TNRC6A-208ENST00000561726 CTHP32929 405 aa6.34□□□□□ -1.39
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