RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UBAP1LF5GYI3 381 aa34.12■■■■□ 3.05
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TOM1O60784 492 aa34.1■■■■□ 3.05
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.09■■■■□ 3.05
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ADGRB2O60241 1585 aa34.07■■■■□ 3.05
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CADPS2Q86UW7 1296 aa34.07■■■■□ 3.04
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa33.4■■■□□ 2.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 USP6P35125 1406 aa33.39■■■□□ 2.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa33.39■■■□□ 2.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ALS2Q96Q42 1657 aa33.39■■■□□ 2.94
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PNPLA6Q8IY17 1366 aa33.38■■■□□ 2.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP33.38■■■□□ 2.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NRKQ7Z2Y5 1582 aa33.36■■■□□ 2.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP33.36■■■□□ 2.93
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP33.34■■■□□ 2.93
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