RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550632.5

USP15-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 3

Gene USP15, Length 728 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-216ENST00000550632 APLP2Q06481 763 aa23.05■■□□□ 1.28
USP15-216ENST00000550632 BRWD3Q6RI45 1802 aa23.05■■□□□ 1.28
USP15-216ENST00000550632 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
USP15-216ENST00000550632 HRCP23327 699 aa23.04■■□□□ 1.28
USP15-216ENST00000550632 ROBO2Q9HCK4 1378 aa23.02■■□□□ 1.28
USP15-216ENST00000550632 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.02■■□□□ 1.28
USP15-216ENST00000550632 UNC5CLQ8IV45 518 aa23.02■■□□□ 1.28
USP15-216ENST00000550632 SEPT12Q8IYM1 358 aa23■■□□□ 1.27
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USP15-216ENST00000550632 NUP155O75694 1391 aa22.99■■□□□ 1.27
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USP15-216ENST00000550632 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
USP15-216ENST00000550632 NPHP3Q7Z494 1330 aa22.98■■□□□ 1.27
USP15-216ENST00000550632 FOXO3O43524 673 aa22.97■■□□□ 1.27
USP15-216ENST00000550632 SLIT2O94813 1529 aa22.96■■□□□ 1.27
USP15-216ENST00000550632 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa22.94■■□□□ 1.26
USP15-216ENST00000550632 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.94■■□□□ 1.26
USP15-216ENST00000550632 KRT27Q7Z3Y8 459 aa22.92■■□□□ 1.26
USP15-216ENST00000550632 NUTM2FA1L443 756 aa22.91■■□□□ 1.26
USP15-216ENST00000550632 BAG6P46379 1132 aa22.91■■□□□ 1.26
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USP15-216ENST00000550632 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
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USP15-216ENST00000550632 MYT1Q01538 1121 aa22.86■■□□□ 1.25
USP15-216ENST00000550632 VPS72Q15906 364 aa22.86■■□□□ 1.25
USP15-216ENST00000550632 CLTCL1P53675 1640 aa22.86■■□□□ 1.25
USP15-216ENST00000550632 HFM1A2PYH4 1435 aa22.85■■□□□ 1.25
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USP15-216ENST00000550632 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa22.83■■□□□ 1.25
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USP15-216ENST00000550632 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.83■■□□□ 1.25
USP15-216ENST00000550632 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.82■■□□□ 1.24
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USP15-216ENST00000550632 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
USP15-216ENST00000550632 FAM182BQ5T319 152 aa22.81■■□□□ 1.24
USP15-216ENST00000550632 ROCK1Q13464 1354 aa22.8■■□□□ 1.24
USP15-216ENST00000550632 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.8■■□□□ 1.24
USP15-216ENST00000550632 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.78■■□□□ 1.24
USP15-216ENST00000550632 VGFO15240 615 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
USP15-216ENST00000550632 ITGAEP38570 1179 aa22.78■■□□□ 1.24
USP15-216ENST00000550632 NAIPQ13075 1403 aa22.78■■□□□ 1.24
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USP15-216ENST00000550632 KRT28Q7Z3Y7 464 aa22.77■■□□□ 1.24
USP15-216ENST00000550632 WAPLQ7Z5K2 1190 aa22.75■■□□□ 1.23
USP15-216ENST00000550632 KIF1BO60333 1816 aa22.75■■□□□ 1.23
USP15-216ENST00000550632 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
USP15-216ENST00000550632 STK26Q9P289 416 aa22.73■■□□□ 1.23
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USP15-216ENST00000550632 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.72■■□□□ 1.23
USP15-216ENST00000550632 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.72■■□□□ 1.23
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USP15-216ENST00000550632 BTG4Q9NY30 223 aa22.65■■□□□ 1.22
USP15-216ENST00000550632 DISP2A7MBM2 1401 aa22.65■■□□□ 1.22
USP15-216ENST00000550632 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.64■■□□□ 1.21
USP15-216ENST00000550632 NRAPQ86VF7 1730 aa22.63■■□□□ 1.21
USP15-216ENST00000550632 PSME1Q06323 249 aa22.63■■□□□ 1.21
USP15-216ENST00000550632 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.62■■□□□ 1.21
USP15-216ENST00000550632 TRIM37O94972 964 aa22.62■■□□□ 1.21
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USP15-216ENST00000550632 PPLO60437 1756 aa22.62■■□□□ 1.21
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USP15-216ENST00000550632 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
USP15-216ENST00000550632 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.59■■□□□ 1.21
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USP15-216ENST00000550632 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
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USP15-216ENST00000550632 SBNO1A3KN83 1393 aa22.57■■□□□ 1.2
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USP15-216ENST00000550632 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa22.57■■□□□ 1.2
USP15-216ENST00000550632 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.55■■□□□ 1.2
USP15-216ENST00000550632 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.55■■□□□ 1.2
USP15-216ENST00000550632 ADGRB2O60241 1585 aa22.55■■□□□ 1.2
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USP15-216ENST00000550632 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.53■■□□□ 1.2
USP15-216ENST00000550632 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.53■■□□□ 1.2
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USP15-216ENST00000550632 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.51■■□□□ 1.19
USP15-216ENST00000550632 SPON1Q9HCB6 807 aa22.51■■□□□ 1.19
USP15-216ENST00000550632 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.5■■□□□ 1.19
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USP15-216ENST00000550632 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.49■■□□□ 1.19
USP15-216ENST00000550632 PARD3Q8TEW0 1356 aa22.49■■□□□ 1.19
USP15-216ENST00000550632 RREB1Q92766 1687 aa22.49■■□□□ 1.19
USP15-216ENST00000550632 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
USP15-216ENST00000550632 KCNQ2O43526 872 aa22.48■■□□□ 1.19
USP15-216ENST00000550632 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.192e-8■■■□□ 14.6
USP15-216ENST00000550632 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.48■■□□□ 1.19
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