RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 SIRT1Q96EB6 747 aa27.77■■■□□ 2.04
LTBR-211ENST00000543190 ORAI2Q96SN7 254 aa27.75■■■□□ 2.03
LTBR-211ENST00000543190 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
LTBR-211ENST00000543190 RGL3Q3MIN7 710 aa27.73■■■□□ 2.03
LTBR-211ENST00000543190 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.72■■■□□ 2.03
LTBR-211ENST00000543190 AFF2P51816 1311 aa27.72■■■□□ 2.03
LTBR-211ENST00000543190 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
LTBR-211ENST00000543190 PXDNQ92626 1479 aa27.71■■■□□ 2.03
LTBR-211ENST00000543190 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
LTBR-211ENST00000543190 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
LTBR-211ENST00000543190 RXRBP28702 533 aa27.71■■■□□ 2.03
LTBR-211ENST00000543190 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
LTBR-211ENST00000543190 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
LTBR-211ENST00000543190 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.7■■■□□ 2.03
LTBR-211ENST00000543190 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.68■■■□□ 2.02
LTBR-211ENST00000543190 KIF1AQ12756 1690 aa27.68■■■□□ 2.02
LTBR-211ENST00000543190 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
LTBR-211ENST00000543190 HRCP23327 699 aa27.67■■■□□ 2.02
LTBR-211ENST00000543190 DLC1Q96QB1 1528 aa27.64■■■□□ 2.02
LTBR-211ENST00000543190 WAPLQ7Z5K2 1190 aa27.63■■■□□ 2.01
LTBR-211ENST00000543190 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.62■■■□□ 2.01
LTBR-211ENST00000543190 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP27.62■■■□□ 2.01
LTBR-211ENST00000543190 ESCO1Q5FWF5 840 aa27.62■■■□□ 2.01
LTBR-211ENST00000543190 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.62■■■□□ 2.01
LTBR-211ENST00000543190 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
LTBR-211ENST00000543190 STAC3Q96MF2 364 aa27.61■■■□□ 2.01
LTBR-211ENST00000543190 C8orf37Q96NL8 207 aa27.61■■■□□ 2.01
LTBR-211ENST00000543190 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
LTBR-211ENST00000543190 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.6■■■□□ 2.01
LTBR-211ENST00000543190 STK26Q9P289 416 aa27.6■■■□□ 2.01
LTBR-211ENST00000543190 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
LTBR-211ENST00000543190 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
LTBR-211ENST00000543190 ADGRB1O14514 1584 aa27.58■■■□□ 2.01
LTBR-211ENST00000543190 ADGRB2O60241 1585 aa27.57■■■□□ 2
LTBR-211ENST00000543190 NGLY1Q96IV0 654 aa27.57■■■□□ 2
LTBR-211ENST00000543190 RGS12O14924 1447 aa27.56■■■□□ 2
LTBR-211ENST00000543190 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
LTBR-211ENST00000543190 FOXO3O43524 673 aa27.55■■■□□ 2
LTBR-211ENST00000543190 CFAP70Q5T0N1 1121 aa27.54■■■□□ 2
LTBR-211ENST00000543190 ADAMTS2O95450 1211 aa27.53■■■□□ 2
LTBR-211ENST00000543190 ATRNO75882 1429 aa27.52■■■□□ 2
LTBR-211ENST00000543190 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.51■■□□□ 1.99
LTBR-211ENST00000543190 ANKARQ7Z5J8 1434 aa27.5■■□□□ 1.99
LTBR-211ENST00000543190 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
LTBR-211ENST00000543190 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.5■■□□□ 1.99
LTBR-211ENST00000543190 USP21Q9UK80 565 aa27.49■■□□□ 1.99
LTBR-211ENST00000543190 USP32Q8NFA0 1604 aa27.48■■□□□ 1.99
LTBR-211ENST00000543190 SBNO1A3KN83 1393 aa27.45■■□□□ 1.98
LTBR-211ENST00000543190 PRAM1Q96QH2 718 aa27.44■■□□□ 1.98
LTBR-211ENST00000543190 SLIT2O94813 1529 aa27.44■■□□□ 1.98
LTBR-211ENST00000543190 EP400Q96L91 3159 aa27.44■■□□□ 1.98
LTBR-211ENST00000543190 TNS3Q68CZ2 1445 aa27.43■■□□□ 1.98
LTBR-211ENST00000543190 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.43■■□□□ 1.98
LTBR-211ENST00000543190 NUTM2FA1L443 756 aa27.42■■□□□ 1.98
LTBR-211ENST00000543190 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.42■■□□□ 1.98
LTBR-211ENST00000543190 ABCA3Q99758 1704 aa27.41■■□□□ 1.98
LTBR-211ENST00000543190 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP27.41■■□□□ 1.98
LTBR-211ENST00000543190 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP27.4■■□□□ 1.98
LTBR-211ENST00000543190 PSME1Q06323 249 aa27.4■■□□□ 1.98
LTBR-211ENST00000543190 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.4■■□□□ 1.98
LTBR-211ENST00000543190 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
LTBR-211ENST00000543190 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa27.38■■□□□ 1.97
LTBR-211ENST00000543190 ATAD2Q6PL18 1390 aa27.38■■□□□ 1.97
LTBR-211ENST00000543190 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
LTBR-211ENST00000543190 ARHGEF10O15013 1369 aa27.37■■□□□ 1.97
LTBR-211ENST00000543190 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.36■■□□□ 1.97
LTBR-211ENST00000543190 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.36■■□□□ 1.97
LTBR-211ENST00000543190 POGKQ9P215 609 aa27.36■■□□□ 1.97
LTBR-211ENST00000543190 ALS2Q96Q42 1657 aa27.35■■□□□ 1.97
LTBR-211ENST00000543190 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
LTBR-211ENST00000543190 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.33■■□□□ 1.97
LTBR-211ENST00000543190 GLI3P10071 1580 aa27.32■■□□□ 1.96
LTBR-211ENST00000543190 ITSN1Q15811 1721 aa27.32■■□□□ 1.96
LTBR-211ENST00000543190 PLCH1Q4KWH8 1693 aa27.31■■□□□ 1.96
LTBR-211ENST00000543190 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP27.29■■□□□ 1.96
LTBR-211ENST00000543190 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.29■■□□□ 1.96
LTBR-211ENST00000543190 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa27.28■■□□□ 1.96
LTBR-211ENST00000543190 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.28■■□□□ 1.96
LTBR-211ENST00000543190 WASLO00401 505 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
LTBR-211ENST00000543190 PRR36Q9H6K5 1346 aa27.27■■□□□ 1.96
LTBR-211ENST00000543190 CCDC125Q86Z20 511 aa27.27■■□□□ 1.96
LTBR-211ENST00000543190 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa27.27■■□□□ 1.96
LTBR-211ENST00000543190 BRWD3Q6RI45 1802 aa27.24■■□□□ 1.95
LTBR-211ENST00000543190 ATP7BP35670 1465 aa27.24■■□□□ 1.95
LTBR-211ENST00000543190 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.23■■□□□ 1.95
LTBR-211ENST00000543190 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
LTBR-211ENST00000543190 VPS72Q15906 364 aa27.23■■□□□ 1.95
LTBR-211ENST00000543190 NRAPQ86VF7 1730 aa27.23■■□□□ 1.95
LTBR-211ENST00000543190 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
LTBR-211ENST00000543190 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa27.21■■□□□ 1.95
LTBR-211ENST00000543190 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa27.21■■□□□ 1.95
LTBR-211ENST00000543190 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
LTBR-211ENST00000543190 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
LTBR-211ENST00000543190 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.18■■□□□ 1.94
LTBR-211ENST00000543190 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa27.16■■□□□ 1.94
LTBR-211ENST00000543190 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
LTBR-211ENST00000543190 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
LTBR-211ENST00000543190 FAM83GA6ND36 823 aa27.14■■□□□ 1.94
LTBR-211ENST00000543190 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
LTBR-211ENST00000543190 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
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