RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, human

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUF60-222	ENST00000533362	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PUF60-222	ENST00000533362	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		32	■■■□□ 2.71
PUF60-222	ENST00000533362	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	32	■■■□□ 2.71
PUF60-222	ENST00000533362	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PUF60-222	ENST00000533362	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
PUF60-222	ENST00000533362	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PUF60-222	ENST00000533362	PIP4K2B	P78356	416 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PUF60-222	ENST00000533362	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PUF60-222	ENST00000533362	SLAIN2	Q9P270	581 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PUF60-222	ENST00000533362	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
PUF60-222	ENST00000533362	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
PUF60-222	ENST00000533362	ADGRB2	O60241	1585 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PUF60-222	ENST00000533362	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	31.9	■■■□□ 2.7
PUF60-222	ENST00000533362	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PUF60-222	ENST00000533362	MST1R	Q04912	1400 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PUF60-222	ENST00000533362	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	31.86	■■■□□ 2.69
PUF60-222	ENST00000533362	ROBO1	Q9Y6N7	1651 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PUF60-222	ENST00000533362	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PUF60-222	ENST00000533362	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PUF60-222	ENST00000533362	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
PUF60-222	ENST00000533362	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PUF60-222	ENST00000533362	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PUF60-222	ENST00000533362	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		31.76	■■■□□ 2.68
PUF60-222	ENST00000533362	BRINP3	Q76B58	766 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PUF60-222	ENST00000533362	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
PUF60-222	ENST00000533362	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PUF60-222	ENST00000533362	AHDC1	Q5TGY3	1603 aa	Predicted RBP	31.71	■■■□□ 2.67
PUF60-222	ENST00000533362	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PUF60-222	ENST00000533362	HSPA1L	P34931	641 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PUF60-222	ENST00000533362	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		31.7	■■■□□ 2.67
PUF60-222	ENST00000533362	NUTM2F	A1L443	756 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PUF60-222	ENST00000533362	KIF1A	Q12756	1690 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PUF60-222	ENST00000533362	PHLPP1	O60346	1717 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PUF60-222	ENST00000533362	SLC24A1	O60721	1099 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PUF60-222	ENST00000533362	ORAI2	Q96SN7	254 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PUF60-222	ENST00000533362	CDK19	Q9BWU1	502 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PUF60-222	ENST00000533362	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PUF60-222	ENST00000533362	EVC2	Q86UK5	1308 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PUF60-222	ENST00000533362	USP47	Q96K76	1375 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PUF60-222	ENST00000533362	USP32	Q8NFA0	1604 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PUF60-222	ENST00000533362	ITSN1	Q15811	1721 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PUF60-222	ENST00000533362	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
PUF60-222	ENST00000533362	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		31.62	■■■□□ 2.65
PUF60-222	ENST00000533362	ATP7B	P35670	1465 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PUF60-222	ENST00000533362	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PUF60-222	ENST00000533362	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	31.59	■■■□□ 2.65
PUF60-222	ENST00000533362	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	31.58	■■■□□ 2.65
PUF60-222	ENST00000533362	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PUF60-222	ENST00000533362	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	31.58	■■■□□ 2.65
PUF60-222	ENST00000533362	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PUF60-222	ENST00000533362	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		31.55	■■■□□ 2.64
PUF60-222	ENST00000533362	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		31.54	■■■□□ 2.64
PUF60-222	ENST00000533362	CABP2	Q9NPB3	220 aa		31.53	■■■□□ 2.64
PUF60-222	ENST00000533362	FOXO3	O43524	673 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PUF60-222	ENST00000533362	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	31.52	■■■□□ 2.64
PUF60-222	ENST00000533362	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PUF60-222	ENST00000533362	JCAD	Q9P266	1359 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PUF60-222	ENST00000533362	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	31.51	■■■□□ 2.64
PUF60-222	ENST00000533362	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	31.51	■■■□□ 2.63
PUF60-222	ENST00000533362	TESK2	Q96S53	571 aa		31.5	■■■□□ 2.63
PUF60-222	ENST00000533362	PXDN	Q92626	1479 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PUF60-222	ENST00000533362	PSME1	Q06323	249 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PUF60-222	ENST00000533362	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	31.49	■■■□□ 2.63
PUF60-222	ENST00000533362	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PUF60-222	ENST00000533362	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
PUF60-222	ENST00000533362	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PUF60-222	ENST00000533362	TMF1	P82094	1093 aa		31.47	■■■□□ 2.63
PUF60-222	ENST00000533362	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	31.47	■■■□□ 2.63
PUF60-222	ENST00000533362	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		31.45	■■■□□ 2.63
PUF60-222	ENST00000533362	SHPRH	Q149N8	1683 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PUF60-222	ENST00000533362	CDCA8	Q53HL2	280 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PUF60-222	ENST00000533362	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PUF60-222	ENST00000533362	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
PUF60-222	ENST00000533362	SBNO1	A3KN83	1393 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PUF60-222	ENST00000533362	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
PUF60-222	ENST00000533362	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PUF60-222	ENST00000533362	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
PUF60-222	ENST00000533362	CABP1	Q9NZU7	370 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PUF60-222	ENST00000533362	ACE	P12821	1306 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PUF60-222	ENST00000533362	NINL	Q9Y2I6	1382 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PUF60-222	ENST00000533362	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PUF60-222	ENST00000533362	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PUF60-222	ENST00000533362	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	31.36	■■■□□ 2.61
PUF60-222	ENST00000533362	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PUF60-222	ENST00000533362	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		31.35	■■■□□ 2.61
PUF60-222	ENST00000533362	ARHGEF10	O15013	1369 aa		31.34	■■■□□ 2.61
PUF60-222	ENST00000533362	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
PUF60-222	ENST00000533362	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
PUF60-222	ENST00000533362	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
PUF60-222	ENST00000533362	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
PUF60-222	ENST00000533362	TMC1	Q8TDI8	760 aa		31.3	■■■□□ 2.6
PUF60-222	ENST00000533362	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
PUF60-222	ENST00000533362	USP6	P35125	1406 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PUF60-222	ENST00000533362	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
PUF60-222	ENST00000533362	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PUF60-222	ENST00000533362	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PUF60-222	ENST00000533362	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.59
PUF60-222	ENST00000533362	AKAP12	Q02952	1782 aa		31.25	■■■□□ 2.59
PUF60-222	ENST00000533362	ALS2	Q96Q42	1657 aa		31.25	■■■□□ 2.59
PUF60-222	ENST00000533362	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	31.24	■■■□□ 2.59

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