RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524255.5

SFTPC-210, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SFTPC, Length 681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-210ENST00000524255 ADAMTS2O95450 1211 aa24.5■■□□□ 1.51
SFTPC-210ENST00000524255 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.48■■□□□ 1.51
SFTPC-210ENST00000524255 NGLY1Q96IV0 654 aa24.46■■□□□ 1.51
SFTPC-210ENST00000524255 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.45■■□□□ 1.51
SFTPC-210ENST00000524255 C1orf167Q5SNV9 1468 aa24.45■■□□□ 1.51
SFTPC-210ENST00000524255 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa24.44■■□□□ 1.5
SFTPC-210ENST00000524255 TONSLQ96HA7 1378 aa24.44■■□□□ 1.5
SFTPC-210ENST00000524255 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.44■■□□□ 1.5
SFTPC-210ENST00000524255 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.43■■□□□ 1.5
SFTPC-210ENST00000524255 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.42■■□□□ 1.5
SFTPC-210ENST00000524255 VGFO15240 615 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SFTPC-210ENST00000524255 ORAI2Q96SN7 254 aa24.4■■□□□ 1.5
SFTPC-210ENST00000524255 ATAD2Q6PL18 1390 aa24.4■■□□□ 1.5
SFTPC-210ENST00000524255 LAMC1P11047 1609 aa24.39■■□□□ 1.5
SFTPC-210ENST00000524255 USP21Q9UK80 565 aa24.39■■□□□ 1.49
SFTPC-210ENST00000524255 PPLO60437 1756 aa24.39■■□□□ 1.49
SFTPC-210ENST00000524255 STAC3Q96MF2 364 aa24.37■■□□□ 1.49
SFTPC-210ENST00000524255 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.37■■□□□ 1.49
SFTPC-210ENST00000524255 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SFTPC-210ENST00000524255 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa24.36■■□□□ 1.49
SFTPC-210ENST00000524255 PTCH1Q13635 1447 aa24.36■■□□□ 1.49
SFTPC-210ENST00000524255 IFT172Q9UG01 1749 aa24.36■■□□□ 1.49
SFTPC-210ENST00000524255 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa24.36■■□□□ 1.49
SFTPC-210ENST00000524255 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
SFTPC-210ENST00000524255 MYOM2P54296 1465 aa24.32■■□□□ 1.48
SFTPC-210ENST00000524255 ATRNO75882 1429 aa24.32■■□□□ 1.48
SFTPC-210ENST00000524255 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
SFTPC-210ENST00000524255 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
SFTPC-210ENST00000524255 EP400Q96L91 3159 aa24.27■■□□□ 1.48
SFTPC-210ENST00000524255 NRXN1Q9ULB1 1477 aa24.26■■□□□ 1.47
SFTPC-210ENST00000524255 ZRANB1Q9UGI0 708 aa24.26■■□□□ 1.47
SFTPC-210ENST00000524255 PIK3C2GO75747 1445 aa24.25■■□□□ 1.47
SFTPC-210ENST00000524255 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.25■■□□□ 1.47
SFTPC-210ENST00000524255 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
SFTPC-210ENST00000524255 BCL9LQ86UU0 1499 aa24.24■■□□□ 1.47
SFTPC-210ENST00000524255 PXDNQ92626 1479 aa24.23■■□□□ 1.47
SFTPC-210ENST00000524255 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.22■■□□□ 1.47
SFTPC-210ENST00000524255 ESCO1Q5FWF5 840 aa24.22■■□□□ 1.47
SFTPC-210ENST00000524255 CFAP70Q5T0N1 1121 aa24.22■■□□□ 1.47
SFTPC-210ENST00000524255 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SFTPC-210ENST00000524255 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.21■■□□□ 1.47
SFTPC-210ENST00000524255 NPHP3Q7Z494 1330 aa24.21■■□□□ 1.47
SFTPC-210ENST00000524255 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SFTPC-210ENST00000524255 FOXO3O43524 673 aa24.18■■□□□ 1.46
SFTPC-210ENST00000524255 NUTM2FA1L443 756 aa24.16■■□□□ 1.46
SFTPC-210ENST00000524255 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SFTPC-210ENST00000524255 TMEM132EQ6IEE7 984 aa24.15■■□□□ 1.46
SFTPC-210ENST00000524255 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.14■■□□□ 1.45
SFTPC-210ENST00000524255 CCDC125Q86Z20 511 aa24.14■■□□□ 1.45
SFTPC-210ENST00000524255 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
SFTPC-210ENST00000524255 GLI3P10071 1580 aa24.12■■□□□ 1.45
SFTPC-210ENST00000524255 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
SFTPC-210ENST00000524255 RALGAPBQ86X10 1494 aa24.12■■□□□ 1.45
SFTPC-210ENST00000524255 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa24.11■■□□□ 1.45
SFTPC-210ENST00000524255 STK26Q9P289 416 aa24.11■■□□□ 1.45
SFTPC-210ENST00000524255 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.1■■□□□ 1.45
SFTPC-210ENST00000524255 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.1■■□□□ 1.45
SFTPC-210ENST00000524255 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
SFTPC-210ENST00000524255 SLIT2O94813 1529 aa24.09■■□□□ 1.45
SFTPC-210ENST00000524255 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
SFTPC-210ENST00000524255 UNC5CLQ8IV45 518 aa24.08■■□□□ 1.45
SFTPC-210ENST00000524255 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
SFTPC-210ENST00000524255 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.07■■□□□ 1.44
SFTPC-210ENST00000524255 DEFB132Q7Z7B7 95 aa24.07■■□□□ 1.44
SFTPC-210ENST00000524255 ADGRB1O14514 1584 aa24.06■■□□□ 1.44
SFTPC-210ENST00000524255 USP32Q8NFA0 1604 aa24.06■■□□□ 1.44
SFTPC-210ENST00000524255 TECPR2O15040 1411 aa24.05■■□□□ 1.44
SFTPC-210ENST00000524255 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa24.05■■□□□ 1.44
SFTPC-210ENST00000524255 BRWD3Q6RI45 1802 aa24.05■■□□□ 1.44
SFTPC-210ENST00000524255 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SFTPC-210ENST00000524255 PLEKHG5O94827 1062 aa24.04■■□□□ 1.44
SFTPC-210ENST00000524255 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.04■■□□□ 1.44
SFTPC-210ENST00000524255 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.04■■□□□ 1.44
SFTPC-210ENST00000524255 TRAK1Q9UPV9 953 aa24.02■■□□□ 1.44
SFTPC-210ENST00000524255 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.02■■□□□ 1.44
SFTPC-210ENST00000524255 KIF1AQ12756 1690 aa24.02■■□□□ 1.44
SFTPC-210ENST00000524255 ABCC11Q96J66 1382 aa24.01■■□□□ 1.43
SFTPC-210ENST00000524255 KNDC1Q76NI1 1749 aa24.01■■□□□ 1.43
SFTPC-210ENST00000524255 SEPT12Q8IYM1 358 aa24■■□□□ 1.43
SFTPC-210ENST00000524255 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.99■■□□□ 1.43
SFTPC-210ENST00000524255 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.99■■□□□ 1.43
SFTPC-210ENST00000524255 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
SFTPC-210ENST00000524255 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
SFTPC-210ENST00000524255 PLCH1Q4KWH8 1693 aa23.97■■□□□ 1.43
SFTPC-210ENST00000524255 TNS3Q68CZ2 1445 aa23.96■■□□□ 1.43
SFTPC-210ENST00000524255 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
SFTPC-210ENST00000524255 VPS72Q15906 364 aa23.94■■□□□ 1.42
SFTPC-210ENST00000524255 SIRT1Q96EB6 747 aa23.94■■□□□ 1.42
SFTPC-210ENST00000524255 POGKQ9P215 609 aa23.94■■□□□ 1.42
SFTPC-210ENST00000524255 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
SFTPC-210ENST00000524255 ABCA3Q99758 1704 aa23.93■■□□□ 1.42
SFTPC-210ENST00000524255 PRAM1Q96QH2 718 aa23.93■■□□□ 1.42
SFTPC-210ENST00000524255 LRP5O75197 1615 aa23.92■■□□□ 1.42
SFTPC-210ENST00000524255 PHF8Q9UPP1 1060 aa23.92■■□□□ 1.42
SFTPC-210ENST00000524255 DLC1Q96QB1 1528 aa23.92■■□□□ 1.42
SFTPC-210ENST00000524255 NWD2Q9ULI1 1742 aa23.91■■□□□ 1.42
SFTPC-210ENST00000524255 LMOD2Q6P5Q4 547 aa23.91■■□□□ 1.42
SFTPC-210ENST00000524255 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
SFTPC-210ENST00000524255 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
SFTPC-210ENST00000524255 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.9■■□□□ 1.42
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