RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511309.5

PRELID1-208, Transcript of PRELI domain containing 1, human

TSL 2

Gene PRELID1, Length 778 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRELID1-208	ENST00000511309	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	32.02	■■■□□ 2.72
PRELID1-208	ENST00000511309	PTCH1	Q13635	1447 aa		32.01	■■■□□ 2.72
PRELID1-208	ENST00000511309	TONSL	Q96HA7	1378 aa		32.01	■■■□□ 2.71
PRELID1-208	ENST00000511309	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
PRELID1-208	ENST00000511309	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32	■■■□□ 2.71
PRELID1-208	ENST00000511309	CCER1	Q8TC90	406 aa	Predicted RBP	31.99	■■■□□ 2.71
PRELID1-208	ENST00000511309	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		31.99	■■■□□ 2.71
PRELID1-208	ENST00000511309	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		31.98	■■■□□ 2.71
PRELID1-208	ENST00000511309	ABCC11	Q96J66	1382 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PRELID1-208	ENST00000511309	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		31.97	■■■□□ 2.71
PRELID1-208	ENST00000511309	ADGRB1	O14514	1584 aa		31.96	■■■□□ 2.71
PRELID1-208	ENST00000511309	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		31.95	■■■□□ 2.7
PRELID1-208	ENST00000511309	TECPR2	O15040	1411 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PRELID1-208	ENST00000511309	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
PRELID1-208	ENST00000511309	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
PRELID1-208	ENST00000511309	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PRELID1-208	ENST00000511309	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	31.94	■■■□□ 2.7
PRELID1-208	ENST00000511309	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		31.94	■■■□□ 2.7
PRELID1-208	ENST00000511309	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		31.91	■■■□□ 2.7
PRELID1-208	ENST00000511309	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		31.9	■■■□□ 2.7
PRELID1-208	ENST00000511309	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PRELID1-208	ENST00000511309	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	31.89	■■■□□ 2.7
PRELID1-208	ENST00000511309	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		31.89	■■■□□ 2.7
PRELID1-208	ENST00000511309	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
PRELID1-208	ENST00000511309	PRAM1	Q96QH2	718 aa		31.86	■■■□□ 2.69
PRELID1-208	ENST00000511309	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	31.85	■■■□□ 2.69
PRELID1-208	ENST00000511309	POGK	Q9P215	609 aa		31.85	■■■□□ 2.69
PRELID1-208	ENST00000511309	SIRT1	Q96EB6	747 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PRELID1-208	ENST00000511309	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PRELID1-208	ENST00000511309	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		31.84	■■■□□ 2.69
PRELID1-208	ENST00000511309	AFF2	P51816	1311 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PRELID1-208	ENST00000511309	RXRB	P28702	533 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PRELID1-208	ENST00000511309	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PRELID1-208	ENST00000511309	DLC1	Q96QB1	1528 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PRELID1-208	ENST00000511309	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		31.82	■■■□□ 2.69
PRELID1-208	ENST00000511309	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
PRELID1-208	ENST00000511309	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	31.78	■■■□□ 2.68
PRELID1-208	ENST00000511309	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PRELID1-208	ENST00000511309	C8orf37	Q96NL8	207 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PRELID1-208	ENST00000511309	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
PRELID1-208	ENST00000511309	ORAI2	Q96SN7	254 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PRELID1-208	ENST00000511309	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PRELID1-208	ENST00000511309	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	31.71	■■■□□ 2.67
PRELID1-208	ENST00000511309	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	31.71	■■■□□ 2.67
PRELID1-208	ENST00000511309	NUTM2F	A1L443	756 aa		31.7	■■■□□ 2.67
PRELID1-208	ENST00000511309	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
PRELID1-208	ENST00000511309	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
PRELID1-208	ENST00000511309	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PRELID1-208	ENST00000511309	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PRELID1-208	ENST00000511309	ADAMTS2	O95450	1211 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PRELID1-208	ENST00000511309	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PRELID1-208	ENST00000511309	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.66
PRELID1-208	ENST00000511309	NGLY1	Q96IV0	654 aa		31.64	■■■□□ 2.66
PRELID1-208	ENST00000511309	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		31.64	■■■□□ 2.66
PRELID1-208	ENST00000511309	RGS12	O14924	1447 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PRELID1-208	ENST00000511309	ADGRB2	O60241	1585 aa		31.62	■■■□□ 2.65
PRELID1-208	ENST00000511309	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PRELID1-208	ENST00000511309	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
PRELID1-208	ENST00000511309	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		31.59	■■■□□ 2.65
PRELID1-208	ENST00000511309	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		31.59	■■■□□ 2.65
PRELID1-208	ENST00000511309	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	31.58	■■■□□ 2.65
PRELID1-208	ENST00000511309	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	31.57	■■■□□ 2.64
PRELID1-208	ENST00000511309	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	31.56	■■■□□ 2.64
PRELID1-208	ENST00000511309	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
PRELID1-208	ENST00000511309	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		31.55	■■■□□ 2.64
PRELID1-208	ENST00000511309	USP21	Q9UK80	565 aa		31.53	■■■□□ 2.64
PRELID1-208	ENST00000511309	PXDN	Q92626	1479 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PRELID1-208	ENST00000511309	USP32	Q8NFA0	1604 aa		31.5	■■■□□ 2.63
PRELID1-208	ENST00000511309	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	31.5	■■■□□ 2.63
PRELID1-208	ENST00000511309	CDK19	Q9BWU1	502 aa		31.5	■■■□□ 2.63
PRELID1-208	ENST00000511309	FOXO3	O43524	673 aa		31.49	■■■□□ 2.63
PRELID1-208	ENST00000511309	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	31.49	■■■□□ 2.63
PRELID1-208	ENST00000511309	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	31.48	■■■□□ 2.63
PRELID1-208	ENST00000511309	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PRELID1-208	ENST00000511309	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PRELID1-208	ENST00000511309	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PRELID1-208	ENST00000511309	ATRN	O75882	1429 aa		31.45	■■■□□ 2.63
PRELID1-208	ENST00000511309	KIF1A	Q12756	1690 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PRELID1-208	ENST00000511309	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PRELID1-208	ENST00000511309	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	31.43	■■■□□ 2.62
PRELID1-208	ENST00000511309	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PRELID1-208	ENST00000511309	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
PRELID1-208	ENST00000511309	CABP2	Q9NPB3	220 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PRELID1-208	ENST00000511309	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	31.4	■■■□□ 2.62
PRELID1-208	ENST00000511309	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PRELID1-208	ENST00000511309	ATP7B	P35670	1465 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PRELID1-208	ENST00000511309	EVC2	Q86UK5	1308 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PRELID1-208	ENST00000511309	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PRELID1-208	ENST00000511309	ITSN1	Q15811	1721 aa		31.38	■■■□□ 2.61
PRELID1-208	ENST00000511309	USP47	Q96K76	1375 aa		31.37	■■■□□ 2.61
PRELID1-208	ENST00000511309	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		31.36	■■■□□ 2.61
PRELID1-208	ENST00000511309	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PRELID1-208	ENST00000511309	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		31.33	■■■□□ 2.61
PRELID1-208	ENST00000511309	PSME1	Q06323	249 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PRELID1-208	ENST00000511309	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PRELID1-208	ENST00000511309	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		31.32	■■■□□ 2.6
PRELID1-208	ENST00000511309	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PRELID1-208	ENST00000511309	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
PRELID1-208	ENST00000511309	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	31.28	■■■□□ 2.6
PRELID1-208	ENST00000511309	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		31.27	■■■□□ 2.6

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