RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508242.1

MRPS35P2-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S35 pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene MRPS35P2, Length 191 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS35P2-201ENST00000508242 STK17AQ9UEE5 414 aa7.48□□□□□ -1.21
MRPS35P2-201ENST00000508242 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.47□□□□□ -1.21
MRPS35P2-201ENST00000508242 RDH13Q8NBN7 331 aa7.47□□□□□ -1.21
MRPS35P2-201ENST00000508242 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
MRPS35P2-201ENST00000508242 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
MRPS35P2-201ENST00000508242 GNPATO15228 680 aa7.46□□□□□ -1.22
MRPS35P2-201ENST00000508242 HPS1Q92902 700 aa7.46□□□□□ -1.22
MRPS35P2-201ENST00000508242 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.46□□□□□ -1.22
MRPS35P2-201ENST00000508242 TRIM47Q96LD4 638 aa7.46□□□□□ -1.22
MRPS35P2-201ENST00000508242 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
MRPS35P2-201ENST00000508242 MMP16P51512 607 aa7.45□□□□□ -1.22
MRPS35P2-201ENST00000508242 TRIM32Q13049 653 aa7.45□□□□□ -1.22
MRPS35P2-201ENST00000508242 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
MRPS35P2-201ENST00000508242 SKOR1P84550 965 aa7.44□□□□□ -1.22
MRPS35P2-201ENST00000508242 RSPH4AQ5TD94 716 aa7.44□□□□□ -1.22
MRPS35P2-201ENST00000508242 DXOO77932 396 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
MRPS35P2-201ENST00000508242 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
MRPS35P2-201ENST00000508242 HLA-CQ95604 372 aa7.41□□□□□ -1.22
MRPS35P2-201ENST00000508242 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
MRPS35P2-201ENST00000508242 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.38□□□□□ -1.23
MRPS35P2-201ENST00000508242 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
MRPS35P2-201ENST00000508242 CD46P15529 392 aa7.38□□□□□ -1.23
MRPS35P2-201ENST00000508242 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.38□□□□□ -1.23
MRPS35P2-201ENST00000508242 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
MRPS35P2-201ENST00000508242 SULF1Q8IWU6 871 aa7.37□□□□□ -1.23
MRPS35P2-201ENST00000508242 SIAH2O43255 324 aa7.36□□□□□ -1.23
MRPS35P2-201ENST00000508242 TRIM46Q7Z4K8 759 aa7.36□□□□□ -1.23
MRPS35P2-201ENST00000508242 P3H3Q8IVL6 736 aa7.36□□□□□ -1.23
MRPS35P2-201ENST00000508242 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
MRPS35P2-201ENST00000508242 SENP2Q9HC62 589 aa7.35□□□□□ -1.23
MRPS35P2-201ENST00000508242 GMPRP36959 345 aa7.34□□□□□ -1.23
MRPS35P2-201ENST00000508242 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
MRPS35P2-201ENST00000508242 ERBB4Q15303 1308 aa7.32□□□□□ -1.24
MRPS35P2-201ENST00000508242 BMP1P13497 986 aa7.32□□□□□ -1.24
MRPS35P2-201ENST00000508242 WNT7BP56706 349 aa7.32□□□□□ -1.24
MRPS35P2-201ENST00000508242 GUCA2AQ02747 115 aa7.32□□□□□ -1.24
MRPS35P2-201ENST00000508242 Q3C1V9 767 aa7.32□□□□□ -1.24
MRPS35P2-201ENST00000508242 KIFC2Q96AC6 838 aa7.32□□□□□ -1.24
MRPS35P2-201ENST00000508242 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
MRPS35P2-201ENST00000508242 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
MRPS35P2-201ENST00000508242 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
MRPS35P2-201ENST00000508242 HOXA2O43364 376 aa7.3□□□□□ -1.24
MRPS35P2-201ENST00000508242 KDM4AO75164 1064 aa7.3□□□□□ -1.24
MRPS35P2-201ENST00000508242 VEGFBP49765 207 aa7.3□□□□□ -1.24
MRPS35P2-201ENST00000508242 ALDH1A1P00352 501 aa7.29□□□□□ -1.24
MRPS35P2-201ENST00000508242 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.29□□□□□ -1.24
MRPS35P2-201ENST00000508242 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.29□□□□□ -1.24
MRPS35P2-201ENST00000508242 H3BM21 787 aa7.28□□□□□ -1.24
MRPS35P2-201ENST00000508242 JUNDP17535 347 aa7.27□□□□□ -1.25
MRPS35P2-201ENST00000508242 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.26□□□□□ -1.25
MRPS35P2-201ENST00000508242 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.26□□□□□ -1.25
MRPS35P2-201ENST00000508242 SH3BP2P78314 561 aa7.25□□□□□ -1.25
MRPS35P2-201ENST00000508242 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
MRPS35P2-201ENST00000508242 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.25□□□□□ -1.25
MRPS35P2-201ENST00000508242 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.25□□□□□ -1.25
MRPS35P2-201ENST00000508242 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.25□□□□□ -1.25
MRPS35P2-201ENST00000508242 GSK3AP49840 483 aa7.24□□□□□ -1.25
MRPS35P2-201ENST00000508242 IRF6O14896 467 aa7.23□□□□□ -1.25
MRPS35P2-201ENST00000508242 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
MRPS35P2-201ENST00000508242 USP46P62068 366 aa7.23□□□□□ -1.25
MRPS35P2-201ENST00000508242 MAP2K5Q13163 448 aa7.23□□□□□ -1.25
MRPS35P2-201ENST00000508242 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.23□□□□□ -1.25
MRPS35P2-201ENST00000508242 IRF7Q92985 503 aa7.23□□□□□ -1.25
MRPS35P2-201ENST00000508242 ZFP42Q96MM3 310 aa7.23□□□□□ -1.25
MRPS35P2-201ENST00000508242 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.22□□□□□ -1.25
MRPS35P2-201ENST00000508242 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 RETREG3Q86VR2 466 aa7.2□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 EHBP1Q8NDI1 1231 aa7.2□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 TLL2Q9Y6L7 1015 aa7.2□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 SOBPA7XYQ1 873 aa7.19□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 VSIG8P0DPA2 414 aa7.19□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 TIMP2P16035 220 aa7.17□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 CCDC102AQ96A19 550 aa7.17□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.17□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.16□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 LINC01559Q495D7 138 aa7.16□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 BAP1Q92560 729 aa7.16□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.16□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.16□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.15□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 NNTQ13423 1086 aa7.15□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 MPNDQ8N594 471 aa7.15□□□□□ -1.26
MRPS35P2-201ENST00000508242 FDX1P10109 184 aa7.14□□□□□ -1.27
MRPS35P2-201ENST00000508242 MS4A1P11836 297 aa7.14□□□□□ -1.27
MRPS35P2-201ENST00000508242 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
MRPS35P2-201ENST00000508242 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.14□□□□□ -1.27
MRPS35P2-201ENST00000508242 NDUFV2P19404 249 aa7.13□□□□□ -1.27
MRPS35P2-201ENST00000508242 PTPRNQ16849 979 aa7.13□□□□□ -1.27
MRPS35P2-201ENST00000508242 ZNF511Q8NB15 262 aa7.13□□□□□ -1.27
MRPS35P2-201ENST00000508242 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
MRPS35P2-201ENST00000508242 KCNH2Q12809 1159 aa7.12□□□□□ -1.27
MRPS35P2-201ENST00000508242 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.12□□□□□ -1.27
MRPS35P2-201ENST00000508242 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.12□□□□□ -1.27
MRPS35P2-201ENST00000508242 KRT76Q01546 638 aa7.11□□□□□ -1.27
MRPS35P2-201ENST00000508242 MOXD2PA6NHM9 499 aa7.1□□□□□ -1.27
MRPS35P2-201ENST00000508242 C6orf229H3BNL8 230 aa7.1□□□□□ -1.27
MRPS35P2-201ENST00000508242 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms