RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRP6O75581 1613 aa34.22■■■■□ 3.07
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MYOM2P54296 1465 aa34.22■■■■□ 3.07
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CFAP70Q5T0N1 1121 aa34.22■■■■□ 3.07
HOXC-AS1-201ENST00000505700 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP34.21■■■■□ 3.07
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NRXN1Q9ULB1 1477 aa34.2■■■■□ 3.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KNDC1Q76NI1 1749 aa34.19■■■■□ 3.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa34.17■■■■□ 3.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa34.16■■■■□ 3.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ESCO1Q5FWF5 840 aa34.16■■■■□ 3.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa34.16■■■■□ 3.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LAMC1P11047 1609 aa34.15■■■■□ 3.06
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUTM2FA1L443 756 aa34.13■■■■□ 3.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DCAF11Q8TEB1 546 aa34.13■■■■□ 3.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SIRT1Q96EB6 747 aa34.13■■■■□ 3.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PNPLA6Q8IY17 1366 aa34.11■■■■□ 3.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NPHP3Q7Z494 1330 aa34.05■■■■□ 3.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP34.04■■■■□ 3.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 STAC3Q96MF2 364 aa34.04■■■■□ 3.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRAM1Q96QH2 718 aa34.04■■■■□ 3.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FOXO3O43524 673 aa34.03■■■■□ 3.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 POGKQ9P215 609 aa34.03■■■■□ 3.04
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FMN2Q9NZ56 1722 aa34.01■■■■□ 3.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AFF2P51816 1311 aa34■■■■□ 3.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C8orf37Q96NL8 207 aa33.99■■■■□ 3.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADAMTS2O95450 1211 aa33.98■■■■□ 3.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRAK1Q9UPV9 953 aa33.98■■■■□ 3.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADGRB1O14514 1584 aa33.96■■■■□ 3.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DLC1Q96QB1 1528 aa33.95■■■■□ 3.03
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PXDNQ92626 1479 aa33.94■■■■□ 3.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RXRBP28702 533 aa33.92■■■■□ 3.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NGLY1Q96IV0 654 aa33.92■■■■□ 3.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIF1AQ12756 1690 aa33.9■■■■□ 3.02
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PHF8Q9UPP1 1060 aa33.88■■■■□ 3.01
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRT28Q7Z3Y7 464 aa33.86■■■■□ 3.01
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP33.86■■■■□ 3.01
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP33.85■■■■□ 3.01
HOXC-AS1-201ENST00000505700 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP33.85■■■■□ 3.01
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PSME1Q06323 249 aa33.81■■■■□ 3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa33.8■■■■□ 3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ADGRB2O60241 1585 aa33.8■■■■□ 3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKARQ7Z5J8 1434 aa33.79■■■■□ 3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa33.78■■■■□ 3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP21Q9UK80 565 aa33.78■■■■□ 3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WASLO00401 505 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
HOXC-AS1-201ENST00000505700 USP32Q8NFA0 1604 aa33.75■■■□□ 2.99
HOXC-AS1-201ENST00000505700 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP33.73■■■□□ 2.99
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP33.73■■■□□ 2.99
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LMOD2Q6P5Q4 547 aa33.72■■■□□ 2.99
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa33.71■■■□□ 2.99
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.99
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNS3Q68CZ2 1445 aa33.7■■■□□ 2.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLEKHG5O94827 1062 aa33.69■■■□□ 2.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP33.69■■■□□ 2.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NBPF1Q3BBV0 1214 aa33.68■■■□□ 2.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRR36Q9H6K5 1346 aa33.68■■■□□ 2.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SBNO1A3KN83 1393 aa33.68■■■□□ 2.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TULP4Q9NRJ4 1543 aa33.68■■■□□ 2.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SIN3AQ96ST3 1273 aa33.67■■■□□ 2.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NEUROD1Q13562 356 aa33.65■■■□□ 2.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 L3MBTL2Q969R5 705 aa33.65■■■□□ 2.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CABLES1Q8TDN4 633 aa33.64■■■□□ 2.98
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPRASP1Q5JY77 1395 aa33.63■■■□□ 2.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RGS12O14924 1447 aa33.62■■■□□ 2.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARHGEF10O15013 1369 aa33.62■■■□□ 2.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP33.61■■■□□ 2.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CDK19Q9BWU1 502 aa33.6■■■□□ 2.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATRNO75882 1429 aa33.6■■■□□ 2.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BCL9LQ86UU0 1499 aa33.59■■■□□ 2.97
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ITSN1Q15811 1721 aa33.54■■■□□ 2.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 UNC5CLQ8IV45 518 aa33.54■■■□□ 2.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP33.53■■■□□ 2.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP7BP35670 1465 aa33.53■■■□□ 2.96
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLIT2O94813 1529 aa33.51■■■□□ 2.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP33.51■■■□□ 2.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ABCA3Q99758 1704 aa33.49■■■□□ 2.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC61Q9Y6R9 512 aa33.48■■■□□ 2.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP33.48■■■□□ 2.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ALS2Q96Q42 1657 aa33.47■■■□□ 2.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP33.46■■■□□ 2.95
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM83GA6ND36 823 aa33.43■■■□□ 2.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACEP12821 1306 aa33.43■■■□□ 2.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa33.42■■■□□ 2.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP33.42■■■□□ 2.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATAD2Q6PL18 1390 aa33.41■■■□□ 2.94
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PLCH1Q4KWH8 1693 aa33.41■■■□□ 2.94
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