RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa27.35■■□□□ 1.97
PITX1-204ENST00000504936 POGKQ9P215 609 aa27.35■■□□□ 1.97
PITX1-204ENST00000504936 DLC1Q96QB1 1528 aa27.34■■□□□ 1.97
PITX1-204ENST00000504936 MST1RQ04912 1400 aa27.33■■□□□ 1.97
PITX1-204ENST00000504936 PRAM1Q96QH2 718 aa27.32■■□□□ 1.96
PITX1-204ENST00000504936 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.31■■□□□ 1.96
PITX1-204ENST00000504936 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.29■■□□□ 1.96
PITX1-204ENST00000504936 C1orf167Q5SNV9 1468 aa27.26■■□□□ 1.95
PITX1-204ENST00000504936 NUTM2FA1L443 756 aa27.26■■□□□ 1.95
PITX1-204ENST00000504936 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
PITX1-204ENST00000504936 BRINP3Q76B58 766 aa27.25■■□□□ 1.95
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PITX1-204ENST00000504936 NHSL1Q5SYE7 1610 aa27.24■■□□□ 1.95
PITX1-204ENST00000504936 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
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PITX1-204ENST00000504936 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
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PITX1-204ENST00000504936 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
PITX1-204ENST00000504936 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
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PITX1-204ENST00000504936 ORAI2Q96SN7 254 aa27.17■■□□□ 1.94
PITX1-204ENST00000504936 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
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PITX1-204ENST00000504936 NPHP3Q7Z494 1330 aa27.06■■□□□ 1.92
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PITX1-204ENST00000504936 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
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PITX1-204ENST00000504936 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.01■■□□□ 1.91
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PITX1-204ENST00000504936 PSME1Q06323 249 aa26.92■■□□□ 1.9
PITX1-204ENST00000504936 KRT28Q7Z3Y7 464 aa26.92■■□□□ 1.9
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PITX1-204ENST00000504936 LRP6O75581 1613 aa26.91■■□□□ 1.9
PITX1-204ENST00000504936 EVC2Q86UK5 1308 aa26.9■■□□□ 1.9
PITX1-204ENST00000504936 CABP2Q9NPB3 220 aa26.9■■□□□ 1.9
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PITX1-204ENST00000504936 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PITX1-204ENST00000504936 PLEKHG5O94827 1062 aa26.86■■□□□ 1.89
PITX1-204ENST00000504936 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.86■■□□□ 1.89
PITX1-204ENST00000504936 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
PITX1-204ENST00000504936 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa26.85■■□□□ 1.89
PITX1-204ENST00000504936 CCDC61Q9Y6R9 512 aa26.85■■□□□ 1.89
PITX1-204ENST00000504936 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.83■■□□□ 1.89
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PITX1-204ENST00000504936 ACEP12821 1306 aa26.79■■□□□ 1.88
PITX1-204ENST00000504936 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.78■■□□□ 1.88
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PITX1-204ENST00000504936 AKAP12Q02952 1782 aa26.76■■□□□ 1.87
PITX1-204ENST00000504936 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
PITX1-204ENST00000504936 PLEKHG3A1L390 1219 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX1-204ENST00000504936 CABP1Q9NZU7 370 aa26.74■■□□□ 1.87
PITX1-204ENST00000504936 AFF2P51816 1311 aa26.7■■□□□ 1.87
PITX1-204ENST00000504936 TMC1Q8TDI8 760 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX1-204ENST00000504936 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.7■■□□□ 1.86
PITX1-204ENST00000504936 NGLY1Q96IV0 654 aa26.7■■□□□ 1.86
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