RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497115.5

ETV1-223, Transcript of ETS variant 1, human

TSL 4

Gene ETV1, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ETV1-223	ENST00000497115	RNF40	O75150	1001 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ETV1-223	ENST00000497115	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		11.23	□□□□□ -0.61
ETV1-223	ENST00000497115	PRR14	Q9BWN1	585 aa		11.22	□□□□□ -0.61
ETV1-223	ENST00000497115	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
ETV1-223	ENST00000497115	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ETV1-223	ENST00000497115	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
ETV1-223	ENST00000497115	ANKK1	Q8NFD2	765 aa		11.19	□□□□□ -0.62
ETV1-223	ENST00000497115	WWC1	Q8IX03	1113 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ETV1-223	ENST00000497115	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		11.18	□□□□□ -0.62
ETV1-223	ENST00000497115	C6orf229	H3BNL8	230 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ETV1-223	ENST00000497115	MORN1	Q5T089	497 aa		11.17	□□□□□ -0.62
ETV1-223	ENST00000497115		Q3C1V9	767 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ETV1-223	ENST00000497115	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
ETV1-223	ENST00000497115	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		11.16	□□□□□ -0.62
ETV1-223	ENST00000497115	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ETV1-223	ENST00000497115	CFAP99	D6REC4	459 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ETV1-223	ENST00000497115	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ETV1-223	ENST00000497115	STAC3	Q96MF2	364 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ETV1-223	ENST00000497115	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		11.15	□□□□□ -0.62
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
ETV1-223	ENST00000497115	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	RETREG3	Q86VR2	466 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	ARID3A	Q99856	593 aa		11.14	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	ABL2	P42684	1182 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	DESI1	Q6ICB0	168 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	PRR7	Q8TB68	274 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		11.12	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	PPP4C	P60510	307 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		11.11	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	BCAM	P50895	628 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	TSC1	Q92574	1164 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	WNT2B	Q93097	391 aa		11.09	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
ETV1-223	ENST00000497115	GPR37L1	O60883	481 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ETV1-223	ENST00000497115	APLP1	P51693	650 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ETV1-223	ENST00000497115	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.08	□□□□□ -0.64
ETV1-223	ENST00000497115	IRF5	Q13568	498 aa		11.06	□□□□□ -0.64
ETV1-223	ENST00000497115	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.06	□□□□□ -0.64
ETV1-223	ENST00000497115	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		11.06	□□□□□ -0.64
ETV1-223	ENST00000497115	NR1I2	O75469	434 aa		11.05	□□□□□ -0.64
ETV1-223	ENST00000497115	BRICD5	Q6PL45	260 aa		11.05	□□□□□ -0.64
ETV1-223	ENST00000497115	USB1	Q9BQ65	265 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
ETV1-223	ENST00000497115	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		11.04	□□□□□ -0.64
ETV1-223	ENST00000497115	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		11.04	□□□□□ -0.64
ETV1-223	ENST00000497115	LYPD8	Q6UX82	237 aa		11.03	□□□□□ -0.64
ETV1-223	ENST00000497115	THAP11	Q96EK4	314 aa		11.03	□□□□□ -0.64
ETV1-223	ENST00000497115	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		11.03	□□□□□ -0.64
ETV1-223	ENST00000497115	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		11.03	□□□□□ -0.64
ETV1-223	ENST00000497115	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
ETV1-223	ENST00000497115	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	11.02	□□□□□ -0.65
ETV1-223	ENST00000497115	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		11.02	□□□□□ -0.65
ETV1-223	ENST00000497115	POM121C	A8CG34	1229 aa		11.01	□□□□□ -0.65
ETV1-223	ENST00000497115	PNMA1	Q8ND90	353 aa		11.01	□□□□□ -0.65
ETV1-223	ENST00000497115	GLMN	Q92990	594 aa		11.01	□□□□□ -0.65
ETV1-223	ENST00000497115	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		11	□□□□□ -0.65
ETV1-223	ENST00000497115	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		11	□□□□□ -0.65
ETV1-223	ENST00000497115	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		11	□□□□□ -0.65
ETV1-223	ENST00000497115	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
ETV1-223	ENST00000497115	WBP1L	Q9NX94	342 aa		11	□□□□□ -0.65
ETV1-223	ENST00000497115	NR6A1	Q15406	480 aa		10.99	□□□□□ -0.65
ETV1-223	ENST00000497115	JUND	P17535	347 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ETV1-223	ENST00000497115	MSS51	Q4VC12	460 aa		10.98	□□□□□ -0.65
ETV1-223	ENST00000497115	PTPRN	Q16849	979 aa		10.97	□□□□□ -0.65
ETV1-223	ENST00000497115	F12	P00748	615 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
ETV1-223	ENST00000497115	SOX11	P35716	441 aa		10.96	□□□□□ -0.65
ETV1-223	ENST00000497115	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	10.94	□□□□□ -0.66
ETV1-223	ENST00000497115	VAC14	Q08AM6	782 aa		10.94	□□□□□ -0.66
ETV1-223	ENST00000497115	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		10.94	□□□□□ -0.66
ETV1-223	ENST00000497115	DXO	O77932	396 aa	Known RBP	10.92	□□□□□ -0.66
ETV1-223	ENST00000497115	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		10.92	□□□□□ -0.66
ETV1-223	ENST00000497115	SPSB2	Q99619	263 aa		10.92	□□□□□ -0.66
ETV1-223	ENST00000497115	ALG2	Q9H553	416 aa		10.92	□□□□□ -0.66
ETV1-223	ENST00000497115	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	10.91	□□□□□ -0.66
ETV1-223	ENST00000497115	MMP16	P51512	607 aa		10.91	□□□□□ -0.66
ETV1-223	ENST00000497115	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	10.91	□□□□□ -0.66
ETV1-223	ENST00000497115	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
ETV1-223	ENST00000497115	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		10.9	□□□□□ -0.66
ETV1-223	ENST00000497115	ADH1B	P00325	375 aa		10.89	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		10.89	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	COPS2	P61201	443 aa		10.89	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	ZPR1	O75312	459 aa		10.88	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	NR1H3	Q13133	447 aa		10.88	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	MAP10	Q9P2G4	905 aa		10.88	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	10.87	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	ZBBX	A8MT70	800 aa		10.86	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		10.86	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	10.86	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	MTR	Q99707	1265 aa		10.86	□□□□□ -0.67
ETV1-223	ENST00000497115	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		10.86	□□□□□ -0.67

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