RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491520.5

CDC45-211, Transcript of cell division cycle 45, humanhuman

TSL 5

Gene CDC45, Length 723 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45-211ENST00000491520 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.19■■■□□ 2.1
CDC45-211ENST00000491520 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.18■■■□□ 2.1
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CDC45-211ENST00000491520 ESCO1Q5FWF5 840 aa28.16■■■□□ 2.1
CDC45-211ENST00000491520 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.13■■■□□ 2.09
CDC45-211ENST00000491520 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CDC45-211ENST00000491520 MYOM2P54296 1465 aa28.11■■■□□ 2.09
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CDC45-211ENST00000491520 PXDNQ92626 1479 aa28.09■■■□□ 2.09
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CDC45-211ENST00000491520 STK26Q9P289 416 aa28.08■■■□□ 2.09
CDC45-211ENST00000491520 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.08■■■□□ 2.09
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CDC45-211ENST00000491520 TECPR2O15040 1411 aa28.07■■■□□ 2.08
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CDC45-211ENST00000491520 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.06■■■□□ 2.08
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CDC45-211ENST00000491520 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.01■■■□□ 2.08
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CDC45-211ENST00000491520 IFT172Q9UG01 1749 aa28.01■■■□□ 2.07
CDC45-211ENST00000491520 ABCC11Q96J66 1382 aa28■■■□□ 2.07
CDC45-211ENST00000491520 KIF1AQ12756 1690 aa27.99■■■□□ 2.07
CDC45-211ENST00000491520 PIK3C2GO75747 1445 aa27.98■■■□□ 2.07
CDC45-211ENST00000491520 TMEM132EQ6IEE7 984 aa27.97■■■□□ 2.07
CDC45-211ENST00000491520 FMN2Q9NZ56 1722 aa27.97■■■□□ 2.07
CDC45-211ENST00000491520 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.97■■■□□ 2.07
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CDC45-211ENST00000491520 EP400Q96L91 3159 aa27.94■■■□□ 2.06
CDC45-211ENST00000491520 CCDC125Q86Z20 511 aa27.94■■■□□ 2.06
CDC45-211ENST00000491520 MPHOSPH9Q99550 1183 aa27.94■■■□□ 2.06
CDC45-211ENST00000491520 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa27.93■■■□□ 2.06
CDC45-211ENST00000491520 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa27.92■■■□□ 2.06
CDC45-211ENST00000491520 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
CDC45-211ENST00000491520 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.91■■■□□ 2.06
CDC45-211ENST00000491520 USP32Q8NFA0 1604 aa27.89■■■□□ 2.06
CDC45-211ENST00000491520 SLIT2O94813 1529 aa27.89■■■□□ 2.06
CDC45-211ENST00000491520 KRT28Q7Z3Y7 464 aa27.89■■■□□ 2.06
CDC45-211ENST00000491520 RALGAPBQ86X10 1494 aa27.88■■■□□ 2.05
CDC45-211ENST00000491520 TNS3Q68CZ2 1445 aa27.87■■■□□ 2.05
CDC45-211ENST00000491520 PSME1Q06323 249 aa27.86■■■□□ 2.05
CDC45-211ENST00000491520 GLI3P10071 1580 aa27.86■■■□□ 2.05
CDC45-211ENST00000491520 SIRT1Q96EB6 747 aa27.85■■■□□ 2.05
CDC45-211ENST00000491520 PHF8Q9UPP1 1060 aa27.85■■■□□ 2.05
CDC45-211ENST00000491520 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
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CDC45-211ENST00000491520 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
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CDC45-211ENST00000491520 CABLES1Q8TDN4 633 aa27.77■■■□□ 2.04
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CDC45-211ENST00000491520 POGKQ9P215 609 aa27.76■■■□□ 2.03
CDC45-211ENST00000491520 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.75■■■□□ 2.03
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CDC45-211ENST00000491520 A0A0G2JS52 829 aa27.71■■■□□ 2.03
CDC45-211ENST00000491520 MYT1Q01538 1121 aa27.71■■■□□ 2.03
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CDC45-211ENST00000491520 TRAK1Q9UPV9 953 aa27.63■■■□□ 2.01
CDC45-211ENST00000491520 ADGRB1O14514 1584 aa27.62■■■□□ 2.01
CDC45-211ENST00000491520 FAM83GA6ND36 823 aa27.62■■■□□ 2.01
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CDC45-211ENST00000491520 TULP4Q9NRJ4 1543 aa27.6■■■□□ 2.01
CDC45-211ENST00000491520 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
CDC45-211ENST00000491520 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
CDC45-211ENST00000491520 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa27.59■■■□□ 2.01
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CDC45-211ENST00000491520 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
CDC45-211ENST00000491520 ALS2Q96Q42 1657 aa27.58■■■□□ 2.01
CDC45-211ENST00000491520 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
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