RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	STK26	Q9P289	416 aa		25.25	■■□□□ 1.63
HDAC10-216	ENST00000489424	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	25.25	■■□□□ 1.63
HDAC10-216	ENST00000489424	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		25.25	■■□□□ 1.63
HDAC10-216	ENST00000489424	SHPRH	Q149N8	1683 aa		25.25	■■□□□ 1.63
HDAC10-216	ENST00000489424	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		25.23	■■□□□ 1.63
HDAC10-216	ENST00000489424	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		25.23	■■□□□ 1.63
HDAC10-216	ENST00000489424	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		25.22	■■□□□ 1.63
HDAC10-216	ENST00000489424	ORAI2	Q96SN7	254 aa		25.21	■■□□□ 1.63
HDAC10-216	ENST00000489424	LRP6	O75581	1613 aa		25.2	■■□□□ 1.62
HDAC10-216	ENST00000489424	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		25.2	■■□□□ 1.62
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	25.2	■■□□□ 1.62
HDAC10-216	ENST00000489424	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		25.19	■■□□□ 1.62
HDAC10-216	ENST00000489424	DLC1	Q96QB1	1528 aa		25.18	■■□□□ 1.62
HDAC10-216	ENST00000489424	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		25.17	■■□□□ 1.62
HDAC10-216	ENST00000489424	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		25.16	■■□□□ 1.62
HDAC10-216	ENST00000489424	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	25.16	■■□□□ 1.62
HDAC10-216	ENST00000489424	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	25.16	■■□□□ 1.62
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		25.15	■■□□□ 1.62
HDAC10-216	ENST00000489424	ADGRB1	O14514	1584 aa		25.13	■■□□□ 1.61
HDAC10-216	ENST00000489424	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	25.12	■■□□□ 1.61
HDAC10-216	ENST00000489424	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	25.12	■■□□□ 1.61
HDAC10-216	ENST00000489424	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	25.12	■■□□□ 1.61
HDAC10-216	ENST00000489424	PRAM1	Q96QH2	718 aa		25.11	■■□□□ 1.61
HDAC10-216	ENST00000489424	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		25.11	■■□□□ 1.61
HDAC10-216	ENST00000489424	POGK	Q9P215	609 aa		25.09	■■□□□ 1.61
HDAC10-216	ENST00000489424	FOXO3	O43524	673 aa		25.06	■■□□□ 1.6
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	25.05	■■□□□ 1.6
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		25.05	■■□□□ 1.6
HDAC10-216	ENST00000489424	PXDN	Q92626	1479 aa		25.05	■■□□□ 1.6
HDAC10-216	ENST00000489424	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		25.04	■■□□□ 1.6
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		25.03	■■□□□ 1.6
HDAC10-216	ENST00000489424	PSME1	Q06323	249 aa		25.02	■■□□□ 1.6
HDAC10-216	ENST00000489424	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		25.02	■■□□□ 1.6
HDAC10-216	ENST00000489424	AFF2	P51816	1311 aa		25.02	■■□□□ 1.6
HDAC10-216	ENST00000489424	ADGRB2	O60241	1585 aa		25.01	■■□□□ 1.59
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF1A	Q12756	1690 aa		25.01	■■□□□ 1.59
HDAC10-216	ENST00000489424	RXRB	P28702	533 aa		25	■■□□□ 1.59
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	25	■■□□□ 1.59
HDAC10-216	ENST00000489424	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	25	■■□□□ 1.59
HDAC10-216	ENST00000489424	NUTM2F	A1L443	756 aa		24.99	■■□□□ 1.59
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		24.99	■■□□□ 1.59
HDAC10-216	ENST00000489424	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	24.99	■■□□□ 1.59
HDAC10-216	ENST00000489424	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		24.98	■■□□□ 1.59
HDAC10-216	ENST00000489424	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	24.97	■■□□□ 1.59
HDAC10-216	ENST00000489424	NGLY1	Q96IV0	654 aa		24.97	■■□□□ 1.59
HDAC10-216	ENST00000489424	SBNO1	A3KN83	1393 aa		24.96	■■□□□ 1.59
HDAC10-216	ENST00000489424	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	24.96	■■□□□ 1.59
HDAC10-216	ENST00000489424	C8orf37	Q96NL8	207 aa		24.96	■■□□□ 1.59
HDAC10-216	ENST00000489424	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	24.95	■■□□□ 1.59
HDAC10-216	ENST00000489424	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		24.95	■■□□□ 1.59
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	24.94	■■□□□ 1.58
HDAC10-216	ENST00000489424	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	24.93	■■□□□ 1.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAMTS2	O95450	1211 aa		24.92	■■□□□ 1.58
HDAC10-216	ENST00000489424	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		24.9	■■□□□ 1.58
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGEF10	O15013	1369 aa		24.9	■■□□□ 1.58
HDAC10-216	ENST00000489424	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	24.89	■■□□□ 1.58
HDAC10-216	ENST00000489424	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		24.89	■■□□□ 1.58
HDAC10-216	ENST00000489424	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	24.89	■■□□□ 1.58
HDAC10-216	ENST00000489424	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	24.89	■■□□□ 1.58
HDAC10-216	ENST00000489424	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		24.88	■■□□□ 1.57
HDAC10-216	ENST00000489424	USP21	Q9UK80	565 aa		24.88	■■□□□ 1.57
HDAC10-216	ENST00000489424	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	24.87	■■□□□ 1.57
HDAC10-216	ENST00000489424	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		24.87	■■□□□ 1.57
HDAC10-216	ENST00000489424	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		24.86	■■□□□ 1.57
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		24.86	■■□□□ 1.57
HDAC10-216	ENST00000489424	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	24.85	■■□□□ 1.57
HDAC10-216	ENST00000489424	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		24.84	■■□□□ 1.57
HDAC10-216	ENST00000489424	USP32	Q8NFA0	1604 aa		24.83	■■□□□ 1.57
HDAC10-216	ENST00000489424	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		24.83	■■□□□ 1.57
HDAC10-216	ENST00000489424	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	24.82	■■□□□ 1.56
HDAC10-216	ENST00000489424	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	24.82	■■□□□ 1.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ATRN	O75882	1429 aa		24.81	■■□□□ 1.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CDK19	Q9BWU1	502 aa		24.81	■■□□□ 1.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		24.81	■■□□□ 1.56
HDAC10-216	ENST00000489424	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		24.8	■■□□□ 1.56
HDAC10-216	ENST00000489424	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		24.8	■■□□□ 1.56
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		24.79	■■□□□ 1.56
HDAC10-216	ENST00000489424	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	24.79	■■□□□ 1.56
HDAC10-216	ENST00000489424	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	24.79	■■□□□ 1.56
HDAC10-216	ENST00000489424	ATP7B	P35670	1465 aa		24.78	■■□□□ 1.56
HDAC10-216	ENST00000489424	SLIT2	O94813	1529 aa		24.77	■■□□□ 1.56
HDAC10-216	ENST00000489424	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		24.77	■■□□□ 1.56
HDAC10-216	ENST00000489424	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	24.77	■■□□□ 1.56
HDAC10-216	ENST00000489424	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	24.76	■■□□□ 1.55
HDAC10-216	ENST00000489424	RGS12	O14924	1447 aa		24.76	■■□□□ 1.55
HDAC10-216	ENST00000489424	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	24.75	■■□□□ 1.55
HDAC10-216	ENST00000489424	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	24.74	■■□□□ 1.55
HDAC10-216	ENST00000489424	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	24.74	■■□□□ 1.55
HDAC10-216	ENST00000489424	NEUROD1	Q13562	356 aa		24.73	■■□□□ 1.55
HDAC10-216	ENST00000489424	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		24.72	■■□□□ 1.55
HDAC10-216	ENST00000489424	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		24.7	■■□□□ 1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ITSN1	Q15811	1721 aa		24.69	■■□□□ 1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	24.69	■■□□□ 1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	PLEKHG5	O94827	1062 aa		24.69	■■□□□ 1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	24.69	■■□□□ 1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ACE	P12821	1306 aa		24.68	■■□□□ 1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	VPS72	Q15906	364 aa		24.68	■■□□□ 1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		24.68	■■□□□ 1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	24.67	■■□□□ 1.54
HDAC10-216	ENST00000489424	ALS2	Q96Q42	1657 aa		24.66	■■□□□ 1.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms