RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472218.1

RPS18-231, Transcript of ribosomal protein S18, human

TSL 2

Gene RPS18, Length 1,109 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS18-231	ENST00000472218	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		14.82	□□□□□ -0.04
RPS18-231	ENST00000472218	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
RPS18-231	ENST00000472218	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RPS18-231	ENST00000472218	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		14.81	□□□□□ -0.04
RPS18-231	ENST00000472218	RALBP1	Q15311	655 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RPS18-231	ENST00000472218	PTPRU	Q92729	1446 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RPS18-231	ENST00000472218	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
RPS18-231	ENST00000472218	PANK3	Q9H999	370 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RPS18-231	ENST00000472218	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RPS18-231	ENST00000472218	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		14.79	□□□□□ -0.04
RPS18-231	ENST00000472218	HSPA2	P54652	639 aa		14.78	□□□□□ -0.04
RPS18-231	ENST00000472218	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	14.77	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		14.77	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	KCNA6	P17658	529 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	CDK19	Q9BWU1	502 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	ADGRB2	O60241	1585 aa		14.76	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	STRC	Q7RTU9	1775 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		14.75	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	14.75	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	NCKAP5L	Q9HCH0	1330 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		14.73	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	CABP2	Q9NPB3	220 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		14.72	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	TMC1	Q8TDI8	760 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	NWD1	Q149M9	1564 aa		14.71	□□□□□ -0.05
RPS18-231	ENST00000472218	NSD2	O96028	1365 aa		14.71	□□□□□ -0.06
RPS18-231	ENST00000472218	MYOM1	P52179	1685 aa		14.71	□□□□□ -0.06
RPS18-231	ENST00000472218	ATP7B	P35670	1465 aa		14.7	□□□□□ -0.06
RPS18-231	ENST00000472218	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
RPS18-231	ENST00000472218	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		14.69	□□□□□ -0.06
RPS18-231	ENST00000472218	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
RPS18-231	ENST00000472218	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
RPS18-231	ENST00000472218	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RPS18-231	ENST00000472218	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
RPS18-231	ENST00000472218	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		14.68	□□□□□ -0.06
RPS18-231	ENST00000472218	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RPS18-231	ENST00000472218	NLRP13	Q86W25	1043 aa		14.67	□□□□□ -0.06
RPS18-231	ENST00000472218	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
RPS18-231	ENST00000472218	USP32	Q8NFA0	1604 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RPS18-231	ENST00000472218	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		14.66	□□□□□ -0.06
RPS18-231	ENST00000472218	CABP1	Q9NZU7	370 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RPS18-231	ENST00000472218	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
RPS18-231	ENST00000472218	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		14.65	□□□□□ -0.06
RPS18-231	ENST00000472218	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
RPS18-231	ENST00000472218		A0A1W2PP64	1363 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RPS18-231	ENST00000472218	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RPS18-231	ENST00000472218	CDC42BPG	Q6DT37	1551 aa		14.64	□□□□□ -0.07
RPS18-231	ENST00000472218	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		14.63	□□□□□ -0.07
RPS18-231	ENST00000472218	DCC	P43146	1447 aa		14.62	□□□□□ -0.07
RPS18-231	ENST00000472218	EDC4	Q6P2E9	1401 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
RPS18-231	ENST00000472218	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
RPS18-231	ENST00000472218	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
RPS18-231	ENST00000472218	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RPS18-231	ENST00000472218	MRS2	Q9HD23	443 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RPS18-231	ENST00000472218	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		14.61	□□□□□ -0.07
RPS18-231	ENST00000472218	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
RPS18-231	ENST00000472218	INSR	P06213	1382 aa		14.6	□□□□□ -0.07
RPS18-231	ENST00000472218	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	PPP2R1A	P30153	589 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	MORC1	Q86VD1	984 aa		14.57	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		14.56	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	FYB1	O15117	783 aa		14.56	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	TTC21A	Q8NDW8	1320 aa		14.56	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	C14orf37	Q86TY3	774 aa		14.55	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	CADPS2	Q86UW7	1296 aa		14.55	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	ACE	P12821	1306 aa		14.55	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	TMEM94	Q12767	1356 aa		14.55	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		14.55	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	USP6	P35125	1406 aa		14.54	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	ITSN1	Q15811	1721 aa		14.54	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	SSH2	Q76I76	1423 aa		14.53	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		14.52	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	MSH6	P52701	1360 aa		14.52	□□□□□ -0.08
RPS18-231	ENST00000472218	ATF3	P18847	181 aa		14.52	□□□□□ -0.09
RPS18-231	ENST00000472218	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
RPS18-231	ENST00000472218	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		14.52	□□□□□ -0.09
RPS18-231	ENST00000472218	NALCN	Q8IZF0	1738 aa		14.52	□□□□□ -0.09
RPS18-231	ENST00000472218	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		14.51	□□□□□ -0.09
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC184	Q52MB2	194 aa		14.51	□□□□□ -0.09
RPS18-231	ENST00000472218	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		14.5	□□□□□ -0.09
RPS18-231	ENST00000472218	AKAP12	Q02952	1782 aa		14.5	□□□□□ -0.09
RPS18-231	ENST00000472218	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		14.49	□□□□□ -0.09
RPS18-231	ENST00000472218	USP31	Q70CQ4	1352 aa		14.49	□□□□□ -0.09
RPS18-231	ENST00000472218	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09

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