RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467683.5

UBE2Q1-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 5

Gene UBE2Q1, Length 370 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-202ENST00000467683 USP21Q9UK80 565 aa17.49■□□□□ 0.39
UBE2Q1-202ENST00000467683 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
UBE2Q1-202ENST00000467683 ATRNO75882 1429 aa17.47■□□□□ 0.39
UBE2Q1-202ENST00000467683 ORAI2Q96SN7 254 aa17.47■□□□□ 0.39
UBE2Q1-202ENST00000467683 NAIPQ13075 1403 aa17.47■□□□□ 0.39
UBE2Q1-202ENST00000467683 NPHP3Q7Z494 1330 aa17.47■□□□□ 0.39
UBE2Q1-202ENST00000467683 MYOM2P54296 1465 aa17.46■□□□□ 0.39
UBE2Q1-202ENST00000467683 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
UBE2Q1-202ENST00000467683 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
UBE2Q1-202ENST00000467683 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1-202ENST00000467683 CCDC125Q86Z20 511 aa17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1-202ENST00000467683 PXDNQ92626 1479 aa17.43■□□□□ 0.38
UBE2Q1-202ENST00000467683 KNDC1Q76NI1 1749 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2Q1-202ENST00000467683 ZRANB1Q9UGI0 708 aa17.41■□□□□ 0.38
UBE2Q1-202ENST00000467683 KIF1AQ12756 1690 aa17.4■□□□□ 0.38
UBE2Q1-202ENST00000467683 BCL9LQ86UU0 1499 aa17.4■□□□□ 0.38
UBE2Q1-202ENST00000467683 ESCO1Q5FWF5 840 aa17.4■□□□□ 0.38
UBE2Q1-202ENST00000467683 TECPR2O15040 1411 aa17.39■□□□□ 0.38
UBE2Q1-202ENST00000467683 IFT172Q9UG01 1749 aa17.39■□□□□ 0.37
UBE2Q1-202ENST00000467683 FMN2Q9NZ56 1722 aa17.38■□□□□ 0.37
UBE2Q1-202ENST00000467683 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
UBE2Q1-202ENST00000467683 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
UBE2Q1-202ENST00000467683 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
UBE2Q1-202ENST00000467683 CCDC144AA2RUR9 1427 aa17.34■□□□□ 0.37
UBE2Q1-202ENST00000467683 FOXO3O43524 673 aa17.34■□□□□ 0.37
UBE2Q1-202ENST00000467683 USP32Q8NFA0 1604 aa17.34■□□□□ 0.37
UBE2Q1-202ENST00000467683 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa17.34■□□□□ 0.37
UBE2Q1-202ENST00000467683 BRWD3Q6RI45 1802 aa17.33■□□□□ 0.37
UBE2Q1-202ENST00000467683 SLIT2O94813 1529 aa17.33■□□□□ 0.37
UBE2Q1-202ENST00000467683 ABCC11Q96J66 1382 aa17.33■□□□□ 0.36
UBE2Q1-202ENST00000467683 GLI3P10071 1580 aa17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1-202ENST00000467683 NWD2Q9ULI1 1742 aa17.32■□□□□ 0.36
UBE2Q1-202ENST00000467683 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1-202ENST00000467683 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1-202ENST00000467683 UNC5CLQ8IV45 518 aa17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1-202ENST00000467683 RALGAPBQ86X10 1494 aa17.31■□□□□ 0.36
UBE2Q1-202ENST00000467683 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1-202ENST00000467683 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1-202ENST00000467683 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1-202ENST00000467683 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa17.3■□□□□ 0.36
UBE2Q1-202ENST00000467683 PLCH1Q4KWH8 1693 aa17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1-202ENST00000467683 PIK3C2GO75747 1445 aa17.29■□□□□ 0.36
UBE2Q1-202ENST00000467683 WAPLQ7Z5K2 1190 aa17.28■□□□□ 0.36
UBE2Q1-202ENST00000467683 STK26Q9P289 416 aa17.28■□□□□ 0.36
UBE2Q1-202ENST00000467683 ABCA3Q99758 1704 aa17.27■□□□□ 0.36
UBE2Q1-202ENST00000467683 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP17.27■□□□□ 0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 NUTM2FA1L443 756 aa17.26■□□□□ 0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 SIRT1Q96EB6 747 aa17.26■□□□□ 0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 TNS3Q68CZ2 1445 aa17.26■□□□□ 0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 PSME1Q06323 249 aa17.25■□□□□ 0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP17.25■□□□□ 0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa17.25■□□□□ 0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 RGL3Q3MIN7 710 aa17.24■□□□□ 0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 KRT28Q7Z3Y7 464 aa17.24■□□□□ 0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 LRP5O75197 1615 aa17.24■□□□□ 0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 SBNO1A3KN83 1393 aa17.23■□□□□ 0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 ARHGEF10O15013 1369 aa17.23■□□□□ 0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 VPS72Q15906 364 aa17.22■□□□□ 0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 TMEM132EQ6IEE7 984 aa17.22■□□□□ 0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 NRXN1Q9ULB1 1477 aa17.22■□□□□ 0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 PHF8Q9UPP1 1060 aa17.21■□□□□ 0.35
UBE2Q1-202ENST00000467683 SEPT12Q8IYM1 358 aa17.2■□□□□ 0.34
UBE2Q1-202ENST00000467683 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
UBE2Q1-202ENST00000467683 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP17.19■□□□□ 0.34
UBE2Q1-202ENST00000467683 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
UBE2Q1-202ENST00000467683 ADGRB2O60241 1585 aa17.19■□□□□ 0.34
UBE2Q1-202ENST00000467683 NRAPQ86VF7 1730 aa17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1-202ENST00000467683 MPHOSPH9Q99550 1183 aa17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1-202ENST00000467683 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1-202ENST00000467683 ANKARQ7Z5J8 1434 aa17.18■□□□□ 0.34
UBE2Q1-202ENST00000467683 DLC1Q96QB1 1528 aa17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-202ENST00000467683 KRT27Q7Z3Y8 459 aa17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-202ENST00000467683 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
UBE2Q1-202ENST00000467683 RGPD1P0DJD0 1748 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-202ENST00000467683 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-202ENST00000467683 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-202ENST00000467683 DEFB132Q7Z7B7 95 aa17.16■□□□□ 0.34
UBE2Q1-202ENST00000467683 ALS2Q96Q42 1657 aa17.15■□□□□ 0.34
UBE2Q1-202ENST00000467683 BAG6P46379 1132 aa17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1-202ENST00000467683 LMOD2Q6P5Q4 547 aa17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1-202ENST00000467683 CABLES1Q8TDN4 633 aa17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1-202ENST00000467683 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
UBE2Q1-202ENST00000467683 PRAM1Q96QH2 718 aa17.12■□□□□ 0.33
UBE2Q1-202ENST00000467683 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa17.1■□□□□ 0.33
UBE2Q1-202ENST00000467683 A0A0G2JS52 829 aa17.1■□□□□ 0.33
UBE2Q1-202ENST00000467683 FAM83GA6ND36 823 aa17.1■□□□□ 0.33
UBE2Q1-202ENST00000467683 MYT1Q01538 1121 aa17.1■□□□□ 0.33
UBE2Q1-202ENST00000467683 CFAP70Q5T0N1 1121 aa17.1■□□□□ 0.33
UBE2Q1-202ENST00000467683 POGKQ9P215 609 aa17.1■□□□□ 0.33
UBE2Q1-202ENST00000467683 GPRASP1Q5JY77 1395 aa17.1■□□□□ 0.33
UBE2Q1-202ENST00000467683 ITSN1Q15811 1721 aa17.1■□□□□ 0.33
UBE2Q1-202ENST00000467683 TULP4Q9NRJ4 1543 aa17.08■□□□□ 0.32
UBE2Q1-202ENST00000467683 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP17.08■□□□□ 0.32
UBE2Q1-202ENST00000467683 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa17.07■□□□□ 0.32
UBE2Q1-202ENST00000467683 ADGRB1O14514 1584 aa17.07■□□□□ 0.32
UBE2Q1-202ENST00000467683 DISP2A7MBM2 1401 aa17.07■□□□□ 0.32
UBE2Q1-202ENST00000467683 PLEKHG5O94827 1062 aa17.07■□□□□ 0.32
UBE2Q1-202ENST00000467683 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
UBE2Q1-202ENST00000467683 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.2 ms