RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF697Q5TEC3 545 aa10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-204ENST00000461653 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
RABGGTB-204ENST00000461653 TRIM67Q6ZTA4 783 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-204ENST00000461653 SPIRE2Q8WWL2 714 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-204ENST00000461653 BCANQ96GW7 911 aa10.43□□□□□ -0.74
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC24A3Q9HC58 644 aa10.42□□□□□ -0.74
RABGGTB-204ENST00000461653 MMP16P51512 607 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-204ENST00000461653 BEGAINQ9BUH8 593 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-204ENST00000461653 FDX1P10109 184 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-204ENST00000461653 RPIAP49247 311 aa10.41□□□□□ -0.74
RABGGTB-204ENST00000461653 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
RABGGTB-204ENST00000461653 DXOO77932 396 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 MS4A1P11836 297 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 PDE4DQ08499 809 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHGC3Q9UN70 934 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 MOXD2PA6NHM9 499 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 NDUFV2P19404 249 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 PRR20EP86478 221 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 PRR20CP86479 221 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 PRR20DP86480 221 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 PRR20BP86481 221 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 PRR20AP86496 221 aa10.38□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 RETREG3Q86VR2 466 aa10.37□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 TNFRSF10AO00220 468 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 GDF9O60383 454 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 C6orf229H3BNL8 230 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 LCE2BO14633 110 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 TRAF7Q6Q0C0 670 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 TBC1D2Q9BYX2 928 aa10.36□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 JUNDP17535 347 aa10.35□□□□□ -0.75
RABGGTB-204ENST00000461653 FOXC1Q12948 553 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-204ENST00000461653 DIXDC1Q155Q3 683 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC24Q8N4L8 307 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-204ENST00000461653 PKD2L1Q9P0L9 805 aa10.33□□□□□ -0.76
RABGGTB-204ENST00000461653 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
RABGGTB-204ENST00000461653 TRIM32Q13049 653 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-204ENST00000461653 MTMR2Q13614 643 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-204ENST00000461653 PKDCCQ504Y2 493 aa10.3□□□□□ -0.76
RABGGTB-204ENST00000461653 GJA5P36382 358 aa10.29□□□□□ -0.76
RABGGTB-204ENST00000461653 FAM187AA6NFU0 413 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-204ENST00000461653 DGAT1O75907 488 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-204ENST00000461653 NUDT12Q9BQG2 462 aa10.28□□□□□ -0.76
RABGGTB-204ENST00000461653 SPTLC1O15269 473 aa10.27□□□□□ -0.76
RABGGTB-204ENST00000461653 PRR7Q8TB68 274 aa10.27□□□□□ -0.76
RABGGTB-204ENST00000461653 SPDYE5A6NIY4 337 aa10.27□□□□□ -0.77
RABGGTB-204ENST00000461653 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-204ENST00000461653 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa10.26□□□□□ -0.77
RABGGTB-204ENST00000461653 CYP4X1Q8N118 509 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-204ENST00000461653 WNT7AO00755 349 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-204ENST00000461653 CCNYL3P0C7X3 344 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-204ENST00000461653 PTPRNQ16849 979 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-204ENST00000461653 MYSM1Q5VVJ2 828 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-204ENST00000461653 TOR4AQ9NXH8 423 aa10.24□□□□□ -0.77
RABGGTB-204ENST00000461653 MYT1Q01538 1121 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGGTB-204ENST00000461653 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGGTB-204ENST00000461653 ZBTB3Q9H5J0 574 aa10.23□□□□□ -0.77
RABGGTB-204ENST00000461653 HRCP23327 699 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-204ENST00000461653 DESI1Q6ICB0 168 aa10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-204ENST00000461653 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RABGGTB-204ENST00000461653 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
RABGGTB-204ENST00000461653 LIMD1Q9UGP4 676 aa10.21□□□□□ -0.77
RABGGTB-204ENST00000461653 WNT7BP56706 349 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 SKOR1P84550 965 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 CABLES1Q8TDN4 633 aa10.21□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 CFAP99D6REC4 459 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 MRGPRX2Q96LB1 330 aa10.2□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 EVA1BQ9NVM1 165 aa10.19□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 TUSC1Q2TAM9 212 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 KDM4CQ9H3R0 1056 aa10.18□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 CLK2P49760 499 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 KCNH2Q12809 1159 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 RSPH6AQ9H0K4 717 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 UNC93B1Q9H1C4 597 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 QPCTQ16769 361 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 LYPD8Q6UX82 237 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 ST8SIA5O15466 376 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 LILRB3O75022 631 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-204ENST00000461653 AVPP01185 164 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF787Q6DD87 383 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 TSC1Q92574 1164 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 AAASQ9NRG9 546 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 POLR3EQ9NVU0 708 aa10.14□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 SMPD1P17405 629 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 CTHP32929 405 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 SH3BP2P78314 561 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC01559Q495D7 138 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 EHBP1Q8NDI1 1231 aa10.13□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 J3QL48 77 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 CRIPAKQ8N1N5 446 aa10.12□□□□□ -0.79
RABGGTB-204ENST00000461653 BAP1Q92560 729 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.2 ms