RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444973.5

NEK6-209, Transcript of NIMA related kinase 6, humanhuman

TSL 5

Gene NEK6, Length 790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK6-209ENST00000444973 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa42.2■■■■■ 4.35
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NEK6-209ENST00000444973 IFT172Q9UG01 1749 aa42.2■■■■■ 4.35
NEK6-209ENST00000444973 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
NEK6-209ENST00000444973 NGLY1Q96IV0 654 aa42.17■■■■■ 4.34
NEK6-209ENST00000444973 ESCO1Q5FWF5 840 aa42.16■■■■■ 4.34
NEK6-209ENST00000444973 WAPLQ7Z5K2 1190 aa42.16■■■■■ 4.34
NEK6-209ENST00000444973 TMEM132EQ6IEE7 984 aa42.15■■■■■ 4.34
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NEK6-209ENST00000444973 TECPR2O15040 1411 aa42.14■■■■■ 4.34
NEK6-209ENST00000444973 RGS12O14924 1447 aa42.12■■■■■ 4.33
NEK6-209ENST00000444973 PIK3C2GO75747 1445 aa42.12■■■■■ 4.33
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NEK6-209ENST00000444973 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa42.1■■■■■ 4.33
NEK6-209ENST00000444973 NPHP3Q7Z494 1330 aa42.09■■■■■ 4.33
NEK6-209ENST00000444973 ABCC11Q96J66 1382 aa42.08■■■■■ 4.33
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NEK6-209ENST00000444973 KNDC1Q76NI1 1749 aa42.05■■■■■ 4.32
NEK6-209ENST00000444973 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP42.05■■■■■ 4.32
NEK6-209ENST00000444973 USP21Q9UK80 565 aa42.02■■■■■ 4.32
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NEK6-209ENST00000444973 KRT28Q7Z3Y7 464 aa41.78■■■■■ 4.28
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NEK6-209ENST00000444973 TNS3Q68CZ2 1445 aa41.68■■■■■ 4.26
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NEK6-209ENST00000444973 LMOD2Q6P5Q4 547 aa41.59■■■■■ 4.25
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NEK6-209ENST00000444973 RALGAPBQ86X10 1494 aa41.58■■■■■ 4.25
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NEK6-209ENST00000444973 GLI3P10071 1580 aa41.57■■■■■ 4.25
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NEK6-209ENST00000444973 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
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NEK6-209ENST00000444973 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP41.3■■■■■ 4.2
NEK6-209ENST00000444973 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
NEK6-209ENST00000444973 NRAPQ86VF7 1730 aa41.27■■■■■ 4.2
NEK6-209ENST00000444973 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP41.26■■■■■ 4.2
NEK6-209ENST00000444973 BTG4Q9NY30 223 aa41.26■■■■■ 4.2
NEK6-209ENST00000444973 ATP7BP35670 1465 aa41.25■■■■■ 4.19
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