RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		13.28	□□□□□ -0.28
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UQCRH	P07919	91 aa		13.28	□□□□□ -0.28
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.28
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VGLL3	A8MV65	326 aa		13.27	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BRD4	O60885	1362 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		13.26	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RAPGEF3	O95398	923 aa		13.26	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		13.25	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		13.25	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		13.25	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AGL	P35573	1532 aa		13.25	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DYNC1I1	O14576	645 aa		13.24	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		13.24	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		13.24	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TET3	O43151	1660 aa		13.24	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		13.24	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF20A	O95235	890 aa		13.24	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP10A	O60312	1499 aa		13.23	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		13.23	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NLRP1	Q9C000	1473 aa		13.23	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		13.22	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CEP152	O94986	1710 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		13.21	□□□□□ -0.29
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658		E9PCH4	1651 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	13.2	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RALBP1	Q15311	655 aa		13.2	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	13.2	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NUP155	O75694	1391 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGHD	P01880	384 aa		13.19	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CBX1	P83916	185 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZBTB22	O15209	634 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABCC3	O15438	1527 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NLRP13	Q86W25	1043 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC4A1AP	Q9BWU0	796 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	USP47	Q96K76	1375 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KANK1	Q14678	1352 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KLHL34	Q8N239	644 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	KIF3B	O15066	747 aa		13.13	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HS1BP3	Q53T59	392 aa		13.13	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRPM2	O94759	1503 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PANK3	Q9H999	370 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PTPRT	O14522	1441 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PKD2	Q13563	968 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLA2R1	Q13018	1463 aa		13.11	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TAF3	Q5VWG9	929 aa		13.1	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MROH2A	A6NES4	1674 aa		13.1	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		13.1	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		13.09	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TSC1	Q92574	1164 aa		13.09	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGSF3	O75054	1194 aa		13.09	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		13.09	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		13.09	□□□□□ -0.31
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DDIT3	P35638	169 aa		13.08	□□□□□ -0.32
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.08	□□□□□ -0.32
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	13.08	□□□□□ -0.32	5e-7	■■■□□ 16.8
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GBP4	Q96PP9	640 aa		13.07	□□□□□ -0.32
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		13.07	□□□□□ -0.32
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CLTCL1	P53675	1640 aa		13.07	□□□□□ -0.32
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32

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