RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 TXLNBQ8N3L3 684 aa8.71□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 GGT6Q6P531 493 aa8.71□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 GCC2Q8IWJ2 1684 aa8.71□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 CDC45O75419 566 aa8.7□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 CLUAP1Q96AJ1 413 aa8.7□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 TPM2P07951 284 aa8.7□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 ADGBQ8N7X0 1667 aa8.7□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 TPM1P09493 284 aa8.7□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 MRE11P49959 708 aa8.7□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 CCT4P50991 539 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 ANKRD1Q15327 319 aa8.7□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa8.7□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa8.7□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC70Q6NSX1 233 aa8.69□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 GSE1Q14687 1217 aa8.69□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.69□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 PLCH2O75038 1416 aa8.68□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 C1orf141Q5JVX7 400 aa8.68□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 PIK3C2GO75747 1445 aa8.68□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 FCHSD2O94868 740 aa8.68□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 FAM184AQ8NB25 1140 aa8.68□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa8.68□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 ACBD3Q9H3P7 528 aa8.68□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 ZFYVE9O95405 1425 aa8.68□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 AMPHP49418 695 aa8.67□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC27Q2M243 656 aa8.67□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 ABCC10Q5T3U5 1492 aa8.67□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 PSME1Q06323 249 aa8.67□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 ARAP3Q8WWN8 1544 aa8.67□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 CAVIN2O95810 425 aa8.66□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa8.66□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 AMOTL1Q8IY63 956 aa8.66□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC30Q5VVM6 783 aa8.66□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.66□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa8.65□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 PPP2R1AP30153 589 aa8.65□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa8.65□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa8.65□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa8.65□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
ALMS1-201ENST00000423048 ARHGAP45Q92619 1136 aa8.65□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 BABAM1Q9NWV8 329 aa8.65□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa8.64□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 TUBB4AP04350 444 aa8.64□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 KRT32Q14532 448 aa8.64□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 PDCL2Q8N4E4 241 aa8.64□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 PLXNC1O60486 1568 aa8.64□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 RAB11FIP3O75154 756 aa8.64□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 MCM5P33992 734 aa8.63□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 CDR1P51861 262 aa8.63□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa8.63□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.63□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 ADGRL1O94910 1474 aa8.63□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.63□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 NEUROD2Q15784 382 aa8.63□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 TEFQ10587 303 aa8.62□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 KIF24Q5T7B8 1368 aa8.62□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa8.62□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 DRC7Q8IY82 874 aa8.62□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 CNTROBQ8N137 903 aa8.62□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 XBP1P17861 261 aa8.62□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 PBRM1Q86U86 1689 aa8.62□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa8.62□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa8.62□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 ABCC2Q92887 1545 aa8.61□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 KDM5DQ9BY66 1539 aa8.61□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 KCNH5Q8NCM2 988 aa8.61□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 DACH1Q9UI36 760 aa8.61□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 JMYQ8N9B5 988 aa8.61□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 IFT57Q9NWB7 429 aa8.61□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 PTPRCP08575 1304 aa8.61□□□□□ -1.03
ALMS1-201ENST00000423048 TRIM29Q14134 588 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 98.8 ms