RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420484.2

CIZ1-209, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 3

Gene CIZ1, Length 684 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-209	ENST00000420484	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	43.56	■■■■■ 4.56
CIZ1-209	ENST00000420484	ORAI2	Q96SN7	254 aa		43.53	■■■■■ 4.56
CIZ1-209	ENST00000420484	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		43.53	■■■■■ 4.56
CIZ1-209	ENST00000420484	LRP6	O75581	1613 aa		43.52	■■■■■ 4.56
CIZ1-209	ENST00000420484	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	43.5	■■■■■ 4.55
CIZ1-209	ENST00000420484	DHX57	Q6P158	1386 aa	Known RBP	43.5	■■■■■ 4.55
CIZ1-209	ENST00000420484	SIRT1	Q96EB6	747 aa		43.49	■■■■■ 4.55
CIZ1-209	ENST00000420484	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		43.47	■■■■■ 4.55
CIZ1-209	ENST00000420484	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		43.46	■■■■■ 4.55
CIZ1-209	ENST00000420484	POTEA	Q6S8J7	498 aa		43.45	■■■■■ 4.55
CIZ1-209	ENST00000420484	STAC3	Q96MF2	364 aa		43.41	■■■■■ 4.54
CIZ1-209	ENST00000420484	MEX3C	Q5U5Q3	659 aa	Known RBP	43.4	■■■■■ 4.54
CIZ1-209	ENST00000420484	ADGRB1	O14514	1584 aa		43.38	■■■■■ 4.54
CIZ1-209	ENST00000420484	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		43.38	■■■■■ 4.53
CIZ1-209	ENST00000420484	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	43.38	■■■■■ 4.53
CIZ1-209	ENST00000420484	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		43.37	■■■■■ 4.53
CIZ1-209	ENST00000420484	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	43.37	■■■■■ 4.53
CIZ1-209	ENST00000420484	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	43.37	■■■■■ 4.53
CIZ1-209	ENST00000420484	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	43.37	■■■■■ 4.53
CIZ1-209	ENST00000420484	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		43.37	■■■■■ 4.53
CIZ1-209	ENST00000420484	DLC1	Q96QB1	1528 aa		43.34	■■■■■ 4.53
CIZ1-209	ENST00000420484	NUTM2F	A1L443	756 aa		43.34	■■■■■ 4.53
CIZ1-209	ENST00000420484	PRAM1	Q96QH2	718 aa		43.32	■■■■■ 4.53
CIZ1-209	ENST00000420484	SAFB2	Q14151	953 aa	Known RBP eCLIP	43.27	■■■■■ 4.52
CIZ1-209	ENST00000420484	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		43.26	■■■■■ 4.52
CIZ1-209	ENST00000420484	POGK	Q9P215	609 aa		43.25	■■■■■ 4.51
CIZ1-209	ENST00000420484	TRAK1	Q9UPV9	953 aa		43.24	■■■■■ 4.51
CIZ1-209	ENST00000420484	RGPD8	O14715	1765 aa	Predicted RBP	43.24	■■■■■ 4.51
CIZ1-209	ENST00000420484	FOXO3	O43524	673 aa		43.23	■■■■■ 4.51
CIZ1-209	ENST00000420484	PXDN	Q92626	1479 aa		43.23	■■■■■ 4.51
CIZ1-209	ENST00000420484	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	43.22	■■■■■ 4.51
CIZ1-209	ENST00000420484	KIF1A	Q12756	1690 aa		43.19	■■■■■ 4.5
CIZ1-209	ENST00000420484	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	43.16	■■■■■ 4.5
CIZ1-209	ENST00000420484	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	43.16	■■■■■ 4.5
CIZ1-209	ENST00000420484	ADGRB2	O60241	1585 aa		43.15	■■■■■ 4.5
CIZ1-209	ENST00000420484	AFF2	P51816	1311 aa		43.12	■■■■■ 4.49
CIZ1-209	ENST00000420484	C8orf37	Q96NL8	207 aa		43.11	■■■■■ 4.49
CIZ1-209	ENST00000420484	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		43.11	■■■■■ 4.49
CIZ1-209	ENST00000420484	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	43.08	■■■■■ 4.49
CIZ1-209	ENST00000420484	ADAMTS2	O95450	1211 aa		43.08	■■■■■ 4.49
CIZ1-209	ENST00000420484	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		43.08	■■■■■ 4.49
CIZ1-209	ENST00000420484	USP32	Q8NFA0	1604 aa		43.08	■■■■■ 4.49
CIZ1-209	ENST00000420484	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	43.07	■■■■■ 4.49
CIZ1-209	ENST00000420484	MINK1	Q8N4C8	1332 aa	Predicted RBP	43.06	■■■■■ 4.48
CIZ1-209	ENST00000420484	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		43.05	■■■■■ 4.48
CIZ1-209	ENST00000420484	KRT28	Q7Z3Y7	464 aa		43.03	■■■■■ 4.48
CIZ1-209	ENST00000420484	NGLY1	Q96IV0	654 aa		43.01	■■■■■ 4.48
CIZ1-209	ENST00000420484	SPATA31A3	Q5VYP0	1347 aa		42.99	■■■■■ 4.47
CIZ1-209	ENST00000420484	RXRB	P28702	533 aa		42.98	■■■■■ 4.47
CIZ1-209	ENST00000420484	SIN3A	Q96ST3	1273 aa		42.97	■■■■■ 4.47
CIZ1-209	ENST00000420484	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	42.96	■■■■■ 4.47
CIZ1-209	ENST00000420484	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		42.95	■■■■■ 4.47
CIZ1-209	ENST00000420484	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	42.94	■■■■■ 4.46
CIZ1-209	ENST00000420484	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		42.94	■■■■■ 4.46
CIZ1-209	ENST00000420484	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		42.94	■■■■■ 4.46
CIZ1-209	ENST00000420484	MARF1	Q9Y4F3	1742 aa	Known RBP	42.94	■■■■■ 4.46
CIZ1-209	ENST00000420484	PSME1	Q06323	249 aa		42.93	■■■■■ 4.46
CIZ1-209	ENST00000420484	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		42.93	■■■■■ 4.46
CIZ1-209	ENST00000420484	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		42.93	■■■■■ 4.46
CIZ1-209	ENST00000420484	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	42.92	■■■■■ 4.46
CIZ1-209	ENST00000420484	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		42.88	■■■■■ 4.46
CIZ1-209	ENST00000420484	NEUROD1	Q13562	356 aa		42.87	■■■■■ 4.45
CIZ1-209	ENST00000420484	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	42.87	■■■■■ 4.45
CIZ1-209	ENST00000420484	SBNO1	A3KN83	1393 aa		42.87	■■■■■ 4.45
CIZ1-209	ENST00000420484	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	42.86	■■■■■ 4.45
CIZ1-209	ENST00000420484	USP21	Q9UK80	565 aa		42.85	■■■■■ 4.45
CIZ1-209	ENST00000420484	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	42.82	■■■■■ 4.45
CIZ1-209	ENST00000420484	ITSN1	Q15811	1721 aa		42.8	■■■■■ 4.44
CIZ1-209	ENST00000420484	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	42.8	■■■■■ 4.44
CIZ1-209	ENST00000420484	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	42.78	■■■■■ 4.44
CIZ1-209	ENST00000420484	ATP7B	P35670	1465 aa		42.77	■■■■■ 4.44
CIZ1-209	ENST00000420484	NUDT16	Q96DE0	195 aa	Known RBP	42.77	■■■■■ 4.44
CIZ1-209	ENST00000420484	CDK19	Q9BWU1	502 aa		42.77	■■■■■ 4.44
CIZ1-209	ENST00000420484	LMOD2	Q6P5Q4	547 aa		42.76	■■■■■ 4.44
CIZ1-209	ENST00000420484	ARHGEF10	O15013	1369 aa		42.76	■■■■■ 4.44
CIZ1-209	ENST00000420484	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	42.75	■■■■■ 4.43
CIZ1-209	ENST00000420484	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		42.75	■■■■■ 4.43
CIZ1-209	ENST00000420484	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		42.75	■■■■■ 4.43
CIZ1-209	ENST00000420484	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		42.74	■■■■■ 4.43
CIZ1-209	ENST00000420484	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		42.73	■■■■■ 4.43
CIZ1-209	ENST00000420484	ABCA3	Q99758	1704 aa		42.72	■■■■■ 4.43
CIZ1-209	ENST00000420484	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	42.72	■■■■■ 4.43
CIZ1-209	ENST00000420484	ATRN	O75882	1429 aa		42.71	■■■■■ 4.43
CIZ1-209	ENST00000420484	RGS12	O14924	1447 aa		42.71	■■■■■ 4.43
CIZ1-209	ENST00000420484	ALS2	Q96Q42	1657 aa		42.7	■■■■■ 4.43
CIZ1-209	ENST00000420484	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	42.7	■■■■■ 4.43
CIZ1-209	ENST00000420484	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	42.69	■■■■■ 4.42
CIZ1-209	ENST00000420484	PLEKHG5	O94827	1062 aa		42.68	■■■■■ 4.42
CIZ1-209	ENST00000420484	TOPAZ1	Q8N9V7	1692 aa		42.67	■■■■■ 4.42
CIZ1-209	ENST00000420484	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		42.66	■■■■■ 4.42
CIZ1-209	ENST00000420484	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	42.65	■■■■■ 4.42
CIZ1-209	ENST00000420484	SLIT2	O94813	1529 aa		42.65	■■■■■ 4.42
CIZ1-209	ENST00000420484	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		42.62	■■■■■ 4.41
CIZ1-209	ENST00000420484	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		42.59	■■■■■ 4.41
CIZ1-209	ENST00000420484	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	42.59	■■■■■ 4.41
CIZ1-209	ENST00000420484	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	42.57	■■■■■ 4.41
CIZ1-209	ENST00000420484	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	42.57	■■■■■ 4.41
CIZ1-209	ENST00000420484	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	42.56	■■■■■ 4.4
CIZ1-209	ENST00000420484	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		42.56	■■■■■ 4.4
CIZ1-209	ENST00000420484	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		42.56	■■■■■ 4.4

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.9 ms