RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 NUTM2FA1L443 756 aa28.88■■■□□ 2.21
UBXN4-202ENST00000415164 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.88■■■□□ 2.21
UBXN4-202ENST00000415164 USP21Q9UK80 565 aa28.86■■■□□ 2.21
UBXN4-202ENST00000415164 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
UBXN4-202ENST00000415164 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.84■■■□□ 2.21
UBXN4-202ENST00000415164 WAPLQ7Z5K2 1190 aa28.83■■■□□ 2.21
UBXN4-202ENST00000415164 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.82■■■□□ 2.2
UBXN4-202ENST00000415164 NPHP3Q7Z494 1330 aa28.82■■■□□ 2.2
UBXN4-202ENST00000415164 LAMC1P11047 1609 aa28.81■■■□□ 2.2
UBXN4-202ENST00000415164 TMEM132EQ6IEE7 984 aa28.81■■■□□ 2.2
UBXN4-202ENST00000415164 FOXO3O43524 673 aa28.8■■■□□ 2.2
UBXN4-202ENST00000415164 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
UBXN4-202ENST00000415164 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa28.79■■■□□ 2.2
UBXN4-202ENST00000415164 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.77■■■□□ 2.2
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UBXN4-202ENST00000415164 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.75■■■□□ 2.19
UBXN4-202ENST00000415164 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa28.75■■■□□ 2.19
UBXN4-202ENST00000415164 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
UBXN4-202ENST00000415164 PXDNQ92626 1479 aa28.72■■■□□ 2.19
UBXN4-202ENST00000415164 ATAD2Q6PL18 1390 aa28.71■■■□□ 2.19
UBXN4-202ENST00000415164 TECPR2O15040 1411 aa28.7■■■□□ 2.19
UBXN4-202ENST00000415164 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
UBXN4-202ENST00000415164 MYOM2P54296 1465 aa28.7■■■□□ 2.18
UBXN4-202ENST00000415164 PLEKHG5O94827 1062 aa28.69■■■□□ 2.18
UBXN4-202ENST00000415164 ABCC11Q96J66 1382 aa28.69■■■□□ 2.18
UBXN4-202ENST00000415164 PIK3C2GO75747 1445 aa28.69■■■□□ 2.18
UBXN4-202ENST00000415164 ATRNO75882 1429 aa28.67■■■□□ 2.18
UBXN4-202ENST00000415164 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
UBXN4-202ENST00000415164 IFT172Q9UG01 1749 aa28.66■■■□□ 2.18
UBXN4-202ENST00000415164 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP28.64■■■□□ 2.18
UBXN4-202ENST00000415164 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
UBXN4-202ENST00000415164 KRT28Q7Z3Y7 464 aa28.62■■■□□ 2.17
UBXN4-202ENST00000415164 KNDC1Q76NI1 1749 aa28.62■■■□□ 2.17
UBXN4-202ENST00000415164 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.61■■■□□ 2.17
UBXN4-202ENST00000415164 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.6■■■□□ 2.17
UBXN4-202ENST00000415164 LMOD2Q6P5Q4 547 aa28.59■■■□□ 2.17
UBXN4-202ENST00000415164 FMN2Q9NZ56 1722 aa28.59■■■□□ 2.17
UBXN4-202ENST00000415164 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa28.59■■■□□ 2.17
UBXN4-202ENST00000415164 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
UBXN4-202ENST00000415164 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
UBXN4-202ENST00000415164 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
UBXN4-202ENST00000415164 PHF8Q9UPP1 1060 aa28.57■■■□□ 2.16
UBXN4-202ENST00000415164 PRAM1Q96QH2 718 aa28.56■■■□□ 2.16
UBXN4-202ENST00000415164 KIF1AQ12756 1690 aa28.55■■■□□ 2.16
UBXN4-202ENST00000415164 POGKQ9P215 609 aa28.55■■■□□ 2.16
UBXN4-202ENST00000415164 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
UBXN4-202ENST00000415164 PSME1Q06323 249 aa28.54■■■□□ 2.16
UBXN4-202ENST00000415164 UNC5CLQ8IV45 518 aa28.54■■■□□ 2.16
UBXN4-202ENST00000415164 CABLES1Q8TDN4 633 aa28.53■■■□□ 2.16
UBXN4-202ENST00000415164 SIRT1Q96EB6 747 aa28.53■■■□□ 2.16
UBXN4-202ENST00000415164 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
UBXN4-202ENST00000415164 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa28.5■■■□□ 2.15
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
UBXN4-202ENST00000415164 TNS3Q68CZ2 1445 aa28.5■■■□□ 2.15
UBXN4-202ENST00000415164 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.48■■■□□ 2.15
UBXN4-202ENST00000415164 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.48■■■□□ 2.15
UBXN4-202ENST00000415164 ZRANB1Q9UGI0 708 aa28.48■■■□□ 2.15
UBXN4-202ENST00000415164 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.48■■■□□ 2.15
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UBXN4-202ENST00000415164 USP32Q8NFA0 1604 aa28.47■■■□□ 2.15
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UBXN4-202ENST00000415164 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.46■■■□□ 2.15
UBXN4-202ENST00000415164 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC125Q86Z20 511 aa28.44■■■□□ 2.14
UBXN4-202ENST00000415164 EP400Q96L91 3159 aa28.44■■■□□ 2.14
UBXN4-202ENST00000415164 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
UBXN4-202ENST00000415164 GLI3P10071 1580 aa28.42■■■□□ 2.14
UBXN4-202ENST00000415164 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
UBXN4-202ENST00000415164 SBNO1A3KN83 1393 aa28.41■■■□□ 2.14
UBXN4-202ENST00000415164 ARHGEF10O15013 1369 aa28.41■■■□□ 2.14
UBXN4-202ENST00000415164 A0A0G2JS52 829 aa28.41■■■□□ 2.14
UBXN4-202ENST00000415164 MYT1Q01538 1121 aa28.41■■■□□ 2.14
UBXN4-202ENST00000415164 SEPT12Q8IYM1 358 aa28.39■■■□□ 2.14
UBXN4-202ENST00000415164 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.39■■■□□ 2.14
UBXN4-202ENST00000415164 VPS72Q15906 364 aa28.38■■■□□ 2.13
UBXN4-202ENST00000415164 DLC1Q96QB1 1528 aa28.38■■■□□ 2.13
UBXN4-202ENST00000415164 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.37■■■□□ 2.13
UBXN4-202ENST00000415164 ANKARQ7Z5J8 1434 aa28.36■■■□□ 2.13
UBXN4-202ENST00000415164 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
UBXN4-202ENST00000415164 GPRASP1Q5JY77 1395 aa28.34■■■□□ 2.13
UBXN4-202ENST00000415164 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
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UBXN4-202ENST00000415164 FAM83GA6ND36 823 aa28.33■■■□□ 2.13
UBXN4-202ENST00000415164 ADGRB1O14514 1584 aa28.33■■■□□ 2.12
UBXN4-202ENST00000415164 DEFB132Q7Z7B7 95 aa28.32■■■□□ 2.12
UBXN4-202ENST00000415164 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
UBXN4-202ENST00000415164 ADGRB2O60241 1585 aa28.3■■■□□ 2.12
UBXN4-202ENST00000415164 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
UBXN4-202ENST00000415164 KRT27Q7Z3Y8 459 aa28.3■■■□□ 2.12
UBXN4-202ENST00000415164 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
UBXN4-202ENST00000415164 ABCA3Q99758 1704 aa28.29■■■□□ 2.12
UBXN4-202ENST00000415164 PRR36Q9H6K5 1346 aa28.29■■■□□ 2.12
UBXN4-202ENST00000415164 BTG4Q9NY30 223 aa28.29■■■□□ 2.12
UBXN4-202ENST00000415164 BRWD3Q6RI45 1802 aa28.28■■■□□ 2.12
UBXN4-202ENST00000415164 WASLO00401 505 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
UBXN4-202ENST00000415164 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
UBXN4-202ENST00000415164 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.26■■■□□ 2.12
UBXN4-202ENST00000415164 TULP4Q9NRJ4 1543 aa28.26■■■□□ 2.11
UBXN4-202ENST00000415164 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
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