RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397070.6

TM2D2-201, Transcript of TM2 domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TM2D2, Length 1,631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D2-201ENST00000397070 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.57■■□□□ 1.52
TM2D2-201ENST00000397070 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.57■■□□□ 1.52
TM2D2-201ENST00000397070 TECPR2O15040 1411 aa24.56■■□□□ 1.52
TM2D2-201ENST00000397070 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.56■■□□□ 1.52
TM2D2-201ENST00000397070 PPP2R1AP30153 589 aa24.56■■□□□ 1.52
TM2D2-201ENST00000397070 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.56■■□□□ 1.52
TM2D2-201ENST00000397070 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
TM2D2-201ENST00000397070 PRAM1Q96QH2 718 aa24.55■■□□□ 1.52
TM2D2-201ENST00000397070 POGKQ9P215 609 aa24.55■■□□□ 1.52
TM2D2-201ENST00000397070 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa24.53■■□□□ 1.52
TM2D2-201ENST00000397070 DIP2AQ14689 1571 aa24.53■■□□□ 1.52
TM2D2-201ENST00000397070 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TM2D2-201ENST00000397070 FAM135BQ49AJ0 1406 aa24.52■■□□□ 1.52
TM2D2-201ENST00000397070 NEFLP07196 543 aa24.51■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.51■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 NSD2O96028 1365 aa24.51■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.5■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.49■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 METP08581 1390 aa24.49■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 ADGRB2O60241 1585 aa24.49■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 SIRT1Q96EB6 747 aa24.48■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 CABP2Q9NPB3 220 aa24.48■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 ITSN1Q15811 1721 aa24.48■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 MED14O60244 1454 aa24.48■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 SHPRHQ149N8 1683 aa24.48■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 AKAP12Q02952 1782 aa24.47■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.46■■□□□ 1.51
TM2D2-201ENST00000397070 ATP7BP35670 1465 aa24.44■■□□□ 1.5
TM2D2-201ENST00000397070 CD163L1Q9NR16 1453 aa24.44■■□□□ 1.5
TM2D2-201ENST00000397070 MON2Q7Z3U7 1717 aa24.44■■□□□ 1.5
TM2D2-201ENST00000397070 A0A1W2PP64 1363 aa24.43■■□□□ 1.5
TM2D2-201ENST00000397070 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.42■■□□□ 1.5
TM2D2-201ENST00000397070 EID1Q9Y6B2 187 aa24.42■■□□□ 1.5
TM2D2-201ENST00000397070 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa24.41■■□□□ 1.5
TM2D2-201ENST00000397070 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TM2D2-201ENST00000397070 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TM2D2-201ENST00000397070 FKBP8Q14318 412 aa24.4■■□□□ 1.5
TM2D2-201ENST00000397070 CDK19Q9BWU1 502 aa24.4■■□□□ 1.5
TM2D2-201ENST00000397070 NUDCQ9Y266 331 aa24.4■■□□□ 1.5
TM2D2-201ENST00000397070 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TM2D2-201ENST00000397070 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.5
TM2D2-201ENST00000397070 TERF2IPQ9NYB0 399 aa24.39■■□□□ 1.5
TM2D2-201ENST00000397070 LTKP29376 864 aa24.39■■□□□ 1.49
TM2D2-201ENST00000397070 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
TM2D2-201ENST00000397070 MORC1Q86VD1 984 aa24.38■■□□□ 1.49
TM2D2-201ENST00000397070 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.38■■□□□ 1.49
TM2D2-201ENST00000397070 BCANQ96GW7 911 aa24.38■■□□□ 1.49
TM2D2-201ENST00000397070 WAPLQ7Z5K2 1190 aa24.37■■□□□ 1.49
TM2D2-201ENST00000397070 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa24.36■■□□□ 1.49
TM2D2-201ENST00000397070 PDE3BQ13370 1112 aa24.35■■□□□ 1.49
TM2D2-201ENST00000397070 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
TM2D2-201ENST00000397070 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.33■■□□□ 1.49
TM2D2-201ENST00000397070 PTCH1Q13635 1447 aa24.33■■□□□ 1.48
TM2D2-201ENST00000397070 WASLO00401 505 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
TM2D2-201ENST00000397070 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
TM2D2-201ENST00000397070 ROBO2Q9HCK4 1378 aa24.31■■□□□ 1.48
TM2D2-201ENST00000397070 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
TM2D2-201ENST00000397070 TBX22Q9Y458 520 aa24.3■■□□□ 1.48
TM2D2-201ENST00000397070 PTPRUQ92729 1446 aa24.3■■□□□ 1.48
TM2D2-201ENST00000397070 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.29■■□□□ 1.48
TM2D2-201ENST00000397070 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.28■■□□□ 1.48
TM2D2-201ENST00000397070 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa24.28■■□□□ 1.48
TM2D2-201ENST00000397070 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
TM2D2-201ENST00000397070 NRKQ7Z2Y5 1582 aa24.28■■□□□ 1.48
TM2D2-201ENST00000397070 CABP1Q9NZU7 370 aa24.26■■□□□ 1.47
TM2D2-201ENST00000397070 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
TM2D2-201ENST00000397070 PIK3R4Q99570 1358 aa24.25■■□□□ 1.47
TM2D2-201ENST00000397070 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
TM2D2-201ENST00000397070 CFAP53Q96M91 514 aa24.24■■□□□ 1.47
TM2D2-201ENST00000397070 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.23■■□□□ 1.47
TM2D2-201ENST00000397070 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.21■■□□□ 1.47
TM2D2-201ENST00000397070 NGEFQ8N5V2 710 aa24.21■■□□□ 1.47
TM2D2-201ENST00000397070 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.21■■□□□ 1.47
TM2D2-201ENST00000397070 FYB1O15117 783 aa24.21■■□□□ 1.47
TM2D2-201ENST00000397070 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TM2D2-201ENST00000397070 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
TM2D2-201ENST00000397070 FMN2Q9NZ56 1722 aa24.2■■□□□ 1.46
TM2D2-201ENST00000397070 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
TM2D2-201ENST00000397070 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
TM2D2-201ENST00000397070 MTHFSP49914 203 aa24.19■■□□□ 1.46
TM2D2-201ENST00000397070 CCDC61Q9Y6R9 512 aa24.18■■□□□ 1.46
TM2D2-201ENST00000397070 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.17■■□□□ 1.46
TM2D2-201ENST00000397070 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
TM2D2-201ENST00000397070 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.17■■□□□ 1.46
TM2D2-201ENST00000397070 NALCNQ8IZF0 1738 aa24.17■■□□□ 1.46
TM2D2-201ENST00000397070 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa24.17■■□□□ 1.46
TM2D2-201ENST00000397070 ZNF521Q96K83 1311 aa24.16■■□□□ 1.46
TM2D2-201ENST00000397070 PRR36Q9H6K5 1346 aa24.14■■□□□ 1.45
TM2D2-201ENST00000397070 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.12■■□□□ 1.45
TM2D2-201ENST00000397070 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.11■■□□□ 1.45
TM2D2-201ENST00000397070 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
TM2D2-201ENST00000397070 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
TM2D2-201ENST00000397070 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108 ms